Job Description P0A853 Confidence 99.97% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 52 Aligned Residues 349 % Identity 17% Template d2cfba1 SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.85

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		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	F	R	I	R	V	I	E	P	V	K	R	T	T	R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	R	G	D	E	A	Y	S	G	S	R	S	Y	Y	A	L	A	E	S	V	K	N
Query Conservation
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	I	V	F	D	H	V	K	G	A	H	I	W	D	V	D	G	N	Q	Y	I	D	Y	V	G	S	W	G	P	A	I	V	G	H	A	H	P	E	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	A	L	H	A	A	L	E	K	G	T	S	F	G	A	P	C	L	L	E	N	I	L	A	E	M	V	I	A
Template Known Secondary structure										B	T					T	T							S	S	T	T	T	T	T		T	T		B	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T		S			S	S
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.												.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		90	.	.	.		.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.
Query SS confidence						.
Query Sequence		I	F	G	Y	.	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V	R	Y	D	F	K
Query Conservation						.
Alig confidence						.																								.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	V	P	S	V	E	M	V	R	F	V	N	S	G	T	E	A	C	M	A	V	L	R	L	M	R	A	Y	.	.	.	.	.	.	T	Q	R	E	K	V	I	K	F	E	G	C	Y	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	A	A	T	L	T	A	P	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				S	S		S						S	S																.	.	.	.	.	.		T									T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.							.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.											130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.														.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.														.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	D	L	E	A	V	S	R	L	F	E	Q	Y	P	.	N	D	I	A	G	V	I	L	E	P	V	V	G	N	A	G	F	I	P	P	D	A	G	F	L	E	G	L	R	E	L	T	K	Q	Y	G	A	L	L	V	F	D	E	V	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	F	R	I
Template Known Secondary structure		.	.	.												S	T	.	T	T								S	S	B		S	S	S		B				T	T												T	T								T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.														.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.		.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.														.	.	.	230	.
		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y	D	G	M	N	L
Query Conservation
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template Sequence		A	Y	G	G	A	Q	E	K	F	G	V	T	P	D	L	T	T	L	G	K	V	I	G	G	G	L	P	V	G	A	Y	G	G	R	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	M	K	M	V	A	P	A	G	P	T	L	S	G	N	P	L	A	M	T	A	G	I	K	T	.	L	E	I	L	S	R	P
Template Known Secondary structure			T	T							T				S						G	G	G	G	T	T	S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	S		T	T																		.					T	S	T
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template SS confidence
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.												.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.		.	.	.	.	.	.	.
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.										.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	V	C	Q	Q	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		G	S	Y	E	H	L	D	R	I	T	G	K	L	V	Q	G	L	L	D	A	A	R	E	F	G	H	E	V	C	G	G	H	I	S	G	M	F	G	L	F	F	T	A	G	P	V	T	N	Y	E	Q	A	K	Q	S	D	L	K	K	F	A	A	F	H	R	G	M	L	E	Q	G	I	Y	L	A	P	S	Q	F	.
Template Known Secondary structure		T																						T	T	T									T	T						S	S	S				S	S					T	T	S															T	T					S	S	T	T	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	G	F	.	T	S	L	A	H	T	E	A	D	I	E	R	T	I	A	A	A	R	T	V	L	S	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S				.			T	T																		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.
Template SS confidence
																				384	.	.	.		.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410