Job Description P0A853 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 393 % Identity 15% Template d1zoda1 SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 1.80

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	E	N	F	K	H	L	P	E	P	F	R	I	R	V	I	E	P	V	K	R	T	T	R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	R	G	D	E	A	Y	S	G	S	R	S	Y
Query Conservation
Alig confidence										.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	R	Y	G	G	T	F	E	.	P	M	I	I	E	R	A	K	G	S	F	V	Y	D	A	D	G	R	A	I	L	D	F	T	S	G	Q	M	S	A	V	L	G	H	C	H	P	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	S	V	I	G	E	Y	A	G	K	L	D	H	L	F	S	E	M	L	S	R
Template Known Secondary structure					S	S				.	S	S							B	T					T	T							T	T					T		T	T		B	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																T	T
Template Predicted Secondary structure										.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		18	.	20	.	.	.	.	.		.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.												.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		81	.			.	.	.	.	.	.	.	90	.			.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.										.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.										.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	A	.	.	L	A	E	S	V	K	N	I	F	.	.	G	Y	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation				.	.										.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.										.	.																											.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	V	V	D	L	A	T	R	L	A	N	I	T	P	P	G	L	D	R	A	L	L	L	S	T	G	A	E	S	N	E	A	A	I	R	M	A	K	L	V	T	.	.	.	.	.	.	G	K	Y	E	I	V	G	F	A	Q	S	W	H	G	M	T	G	A	A	A	S	A	T	Y	S	A	G	R	K	G	V	G	P
Template Known Secondary structure														S		T	T								S																		.	.	.	.	.	.	T								T	T					S	S						T			S	S			S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.							.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
						148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V	R	Y	D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	V	G	S	F	A	I	P	A	P	F	T	Y	R	P	R	F	E	R	N	G	A	Y	D	Y	L	A	E	L	D	Y	A	F	D	L	I	D	R	Q	S	S	G	N	L	A	A	F	I	A	E	P	I	L	S	S	G	G	I	I	E	L	P	D	G	Y	M	A	A	L	K	R	K	C	E	A	R	G	M	L
Template Known Secondary structure				T	T									T	T	S						T	T																					S									S			T	T	T	T						T	T													T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	V	Q	E	G
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.																							.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.																							.	.	.	.	.
Template Sequence		L	I	L	D	E	A	Q	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	G	R	T	G	T	M	F	A	C	Q	R	D	G	V	T	P	D	I	L	T	L	S	K	T	L	G	A	G	L	P	.	L	A	A	I	V	T	S	A	A	I	E	E	R	A	H	E	L	G	Y	L	F	Y	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T	T	S	S	S	S	T					T				S										T	T	S	S	.																	T	T					.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.																							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.													.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.						.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.
Query Sequence		F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y	D	G	M	N	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	.	.	.	.	.	G	V	V	C	Q	Q	A	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A
Query Conservation																																															.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																																												.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	T	T	H	V	S	D	P	L	P	A	A	V	G	L	R	V	L	D	V	V	Q	R	D	G	L	V	A	R	A	N	V	M	G	D	R	L	R	R	G	L	L	D	L	M	E	R	F	D	C	I	G	D	V	R	G	R	G	L	L	L	G	V	E	I	V	K	D	R	R	T	K	E	P	A	D	G	L	G
Template Known Secondary structure		.	.		T	T	T	T																		T	T																								T	T								T	T										T	T	T	T				T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N	A
Query Conservation
Alig confidence										.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation										.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Sequence		A	K	I	T	R	E	C	M	.	N	L	G	L	S	M	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	V	Q	L	P	G	M	G	G	V	F	R	I	A	.	P	P	L	T	V	S	E	D	E	I	D	L	G	L	S	L	L	G	Q	A	I	E	R	A
Template Known Secondary structure										.		T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	S								.			T	T
Template Predicted Secondary structure										.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template SS confidence
		380	.	.	.	.	.	.	.		.	.	390	.	.	.	.														.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.		.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.