Job Description P0A853 Confidence 99.98% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 40 Aligned Residues 352 % Identity 16% Template d1z7da1 SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.10

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		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.			.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.
Query SS confidence																																																																				.	.
Query Sequence		P	E	P	F	R	I	R	V	I	E	P	V	K	R	T	T	R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	R	G	D	E	A	.	.	Y	S	G	S	R	S	Y	Y	A	L	A	E
Query Conservation																																																																				.	.
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	I	P	V	V	L	K	R	A	K	G	V	F	V	Y	D	V	N	D	K	R	Y	Y	D	F	L	S	A	Y	S	S	V	N	Q	G	H	C	H	P	N	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	N	A	M	I	N	Q	A	K	N	L	T	I	C	S	R	A	F	F	S	V	P	L	G	I	C	E	R
Template Known Secondary structure				S								B	T					T	T							S	S					T	T	T	T		B	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T		S				T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.												.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	V	K	N	I	F	G	Y	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V	R	Y
Query Conservation
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	L	T	N	L	L	G	Y	D	K	V	L	M	M	N	T	G	A	E	A	N	E	T	A	Y	K	L	C	R	K	W	G	Y	E	V	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	E	N	M	A	K	I	V	V	C	K	N	N	Q	F	S	K	V	P	Y	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T		S						S	S																			T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T								T	T								T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.													.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q	R	E	A	E	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.												.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.												.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	D	L	E	A	L	E	E	E	L	K	D	.	.	.	P	N	V	C	A	F	I	V	E	P	I	Q	G	E	A	G	V	I	V	P	S	D	N	Y	L	Q	G	V	Y	D	I	C	K	K	Y	N	V	L	F	V	A	D	E	V	Q	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.										T	S	.	.	.	T	T								S	S	B	S	T	T	T	S	B				T	T												T	T								T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.												.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190				.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.													.	.
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y	D	G
Query Conservation
Alig confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	R	T	G	K	L	L	C	V	H	H	Y	N	V	K	P	D	V	I	L	L	G	K	A	L	S	G	G	H	Y	P	I	S	A	V	L	A	N	D	D	I	M	L	V	I	K	P	G	E	H	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	Y	G	G	N	P	L	A	A	S	I	C	V	E	A	L	N	V	L
Template Known Secondary structure		T	T	T	S	S	S	S	G	G	G	G	G	T				S						G	G	G	G	T	T	S	S													T	T			T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.										290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.						.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.
Query Sequence		M	N	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	V	C	Q	.	.	.	.	.	Q	A	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L
Query Conservation																														.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.																	.						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.																	.						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	N	E	K	L	C	E	N	A	E	K	L	G	G	P	F	L	E	N	L	K	R	E	L	K	D	S	K	I	V	R	D	V	R	G	K	G	L	L	C	A	I	E	.	.	.	.	.	.	.	F	K	N	E	L	V	N	V	L	D	I	C	L	K	L	K	.	E	N	G	L	I	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T																					T	T		T	T								T	T						.	.	.	.	.	.	.			T	T	T												.		T	T			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.																	.						.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.								.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.		.	370	.	.	.
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N	A	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	D	V	H	D	K	T	I	R	L	T	.	P	P	L	C	I	T	K	E	Q	L	D	E	C	T	E	I	I	V	K	T	V	K	F	F	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	T						.			T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template SS confidence
											374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.		.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410