Job Description P0A853 Confidence 99.82% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 200 Aligned Residues 328 % Identity 16% Template d1yaaa_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases AAT-like Resolution 2.05

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		50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.							.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.											.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	T	D	S	G	T	G	A	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	.	.	.	.	.	.	R	G	D	E	A	Y	S	G	S	R	S	Y	Y	A	L	A	E	S	V	K	N	I	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	R	D	D	N	G	K	P	W	V	L	P	S	V	K	A	A	E	K	L	I	H	N	D	S	S	Y	N	H	E	Y	L	G	I	T	G	L	P	S	L	T	S	N	A	A	K	I	I	F	G	T	Q	S	D	A	L	Q	E	D	R	V	I	S	V	Q	S	L	S	G	T	G	A	L	H	I	S	A	K	F	F
Template Known Secondary structure			B		T	T	S		B															T		T	T								T	T																T	T						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
				114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V	R	Y	D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Sequence		S	K	F	F	P	D	K	L	V	Y	L	S	K	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	W	A	N	H	M	A	I	F	E	N	Q	G	L	K	T	A	T	Y	P	Y	W	A	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	T	K	S	L	D	L	N	G	F	L	N	A	I	Q	K	.	A	P	E	G	S	I	F	V
Template Known Secondary structure						T	T								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T							T	T	T											.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T														.	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template SS confidence
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.										.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.									.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.		.	.	.	.	.	.	180	.
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.									.
Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	M
Query Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	H	S	C	A	H	N	P	T	.	G	L	D	P	T	S	E	Q	W	V	Q	I	V	D	A	I	A	S	K	N	H	I	A	L	F	D	T	A	Y	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	A	T	G	D	L	D	K	D	A	Y	A	V	R	L	G	V	E	K	L	S	T	V	S	P	V	F
Template Known Secondary structure					S	S		T	T	T	.																			T	T								S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	S	S						T										T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure											.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		188	.	190	.	.	.	.	.	.		.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.													.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.			.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.			.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.									.	.	.	.	.	.	330	.
Predicted Secondary structure															.	.																													.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.																													.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	.	.	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	V	Q	E	G	F	.	.	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	M	N	L	D	W	L
Query Conservation															.	.																													.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.																													.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	C	Q	S	F	A	K	N	A	G	M	Y	G	E	R	V	G	C	F	H	L	A	L	T	K	Q	A	Q	N	K	T	I	K	P	A	V	T	S	Q	L	A	K	I	I	R	S	E	V	S	N	P	P	A	Y	G	A	K	I	V	A	K	L	L	E	T	P	E	L	T	E	Q	W	H	K	D	M	V	T	M	S
Template Known Secondary structure							T	T	T	S			G	G	G											S		T	T																		T	T	T	S	S															S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.						.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.
Query Sequence		A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	V	.	.	.	.	.	C	Q	Q	A	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	K
Query Conservation																						.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	R	I	T	K	M	R	H	A	L	R	D	H	L	V	K	L	G	T	P	G	N	W	D	H	I	V	N	Q	C	G	M	F	S	F	T	G	L	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	M	V	K	R	L	E	E	T	H	A	V	Y	L	V	A	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																			T		S	S			T							S	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.														.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	A	S	I	.	.	A	G	L	N	Q	G	N	V	E	Y	V	A	K	A	I	D	E	V	V	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				G	.	.	G	G			T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template SS confidence
														386	.	.	.			390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low