Job Description P0A853 Confidence 99.78% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 213 Aligned Residues 336 % Identity 16% Template d1t3ia_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Cystathionine synthase-like Resolution 1.80

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		43	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.												.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.				.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Query Sequence		S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	D	E	A	Y	S	G	S	R	S	Y	Y	A	L	A	E	S	V	K	N	I	F	G	Y	Q	Y	T	.	.	.	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Alig confidence																		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Template Conservation																		.
Template Sequence		N	G	H	P	L	V	Y	L	D	N	A	A	T	S	Q	K	.	P	R	A	V	L	E	K	L	M	H	Y	Y	E	N	D	N	A	N	V	G	A	H	Q	L	S	V	R	A	T	D	A	Y	E	A	V	R	N	K	V	A	K	F	I	N	A	R	S	P	R	E	I	V	Y	T	R	N	A	T	E	A	I	N	L
Template Known Secondary structure		T	T							B	T	T	T					.															T							S																					T	T		S		G	G	G					S	S
Template Predicted Secondary structure																		.
Template SS confidence
		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40		.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
		109	110	.	.	.					.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.
Query Sequence		Y	I	P	V	L	.	.	.	.	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V	R	Y	D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G
Query Conservation							.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.																.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Template Sequence		V	A	Y	S	W	G	M	N	N	L	K	A	G	D	E	I	I	T	T	V	M	E	H	H	.	.	.	.	.	S	N	L	V	P	W	Q	M	V	A	A	K	T	G	A	V	L	K	F	V	Q	L	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	E	S	F	D	L	E	H	F	K	T	L	L	S	E	.	.
Template Known Secondary structure						T							T	T							T	T			G	.	.	.	.	.	G	G	T																			B		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	S	B											T	.	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Template SS confidence
		106	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.						130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.											.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		185	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	M	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.																				.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																				.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	K	T	K	L	V	T	V	V	H	I	S	N	T	L	G	C	V	N	P	.	.	.	.	A	E	E	I	A	Q	L	A	H	Q	A	G	A	K	V	L	V	D	A	C	Q	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	H	Y	P	L	D	V	Q	L	I	D	.	.	.	.	.	.	C	D	W	L
Template Known Secondary structure		.	.	T								S	B		T	T	T		B	B			.	.	.	.											T	T								T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S								T	.	.	.	.	.	.		S
Template Predicted Secondary structure		.	.																				.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.					.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210												.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.							.	.	.	.
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.													.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.				.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Query Sequence		A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	V	Q	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y	D	G	M	N	.	.	.	L	D
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	A	S	G	H	K	M	C	A	P	T	G	I	G	F	L	Y	G	K	E	E	I	L	E	A	M	P	P	F	F	G	G	G	E	M	I	A	E	V	F	F	D	H	F	T	T	G	E	L	P	H	K	F	E	A	G	T	P	A	I	A	E	A	I	A	L	G	A	A	V	D	Y	L	T	D	L	G	M	E	N
Template Known Secondary structure					G	G	G	T	T	S		T	T														S				S		S	T	T	S						S	S							T	T	G	G	G			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.								350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	.	.	.	.	.	.	.	V	V	C	Q	Q	A	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	H	N	Y	E	V	E	L	T	H	Y	L	W	Q	G	L	G	Q	I	P	Q	L	R	L	Y	G	P	N	P	K	H	G	D	R	A	A	L	A	S	F	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	A	G	L	H	A	S	D	V	A	T	M	V	D	Q
Template Known Secondary structure																			T		T	T					S			G	G	G	S		B		S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	B											T
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.										.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Template Conservation																														.
Template Sequence		D	G	I	A	I	R	S	G	H	H	C	T	Q	P	L	H	R	L	F	D	A	S	G	S	A	R	A	S	.	L	Y	F	Y	N	T	K	E	E	I	D	L	F	L	Q	S	L	Q	A	T	I	R
Template Known Secondary structure		T	T				B		S		T	T								T	T									.			T	T
Template Predicted Secondary structure																														.
Template SS confidence
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.