Job Description P0A853 Confidence 99.96% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 58 Aligned Residues 379 % Identity 15% Template d1ohwa_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.30

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		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.								80
Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																										.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	E	P	F	R	I	R	V	I	E	P	V	K	R	T	T	R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	R	G	D	E	A	Y	S	G	S	R	S	.	.	.	.	.	.	.	Y
Query Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	F	F	C	N	Y	E	E	S	R	G	N	Y	L	V	D	V	D	G	N	R	M	L	D	L	Y	S	Q	I	S	S	I	P	I	G	Y	S	H	P	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	L	V	Q	Q	P	Q	N	V	S	T	F	I	N	R	P	A	L	G	I	L	P	P	E	N	F	V
Template Known Secondary structure					B		T	T	T		B	B	T				B	T	T	S						S	S					T		S	S		B	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							G	G	G										T	T	T	S			T	T
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.												.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.			.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	A	L	A	E	S	V	K	N	I	F	.	.	G	Y	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T
Query Conservation													.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	K	L	R	E	S	L	L	S	V	A	P	K	G	M	S	Q	L	I	T	M	A	C	G	S	C	S	N	E	N	A	F	K	T	I	F	M	W	Y	R	S	K	E	R	G	Q	S	A	F	S	K	E	E	L	E	T	C	M	I	N	Q	A	P	G	C	P	D	Y	S	I	L	S	F	M	G	A	F	H	G	R
Template Known Secondary structure							T	G	G	G	G			T	T								S	S																						T	T													T	T		T	T	T	S									T	T					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.
		139	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.																.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.			.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Query Sequence		T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V	R	Y	D	F	K	G	N	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	.	.	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	M	G	C	L	A	T	T	H	S	K	A	I	H	K	I	D	I	P	S	F	D	W	P	I	A	P	F	P	R	L	K	Y	P	L	E	E	F	V	K	E	N	Q	Q	E	E	A	R	C	L	E	E	V	E	D	L	I	V	K	Y	R	K	K	K	K	T	V	A	G	I	I	V	E	P	I	Q	S	E	G	G
Template Known Secondary structure		S						T			S						T	T																S	S	G	G	G																										T	T										S	S	B		T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		193	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
		202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.			260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.
Query SS confidence																																																												.	.
Query Sequence		G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	.	.	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	G	G	L
Query Conservation																																																												.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.																				.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Template Sequence		D	N	H	A	S	D	D	F	F	R	K	L	R	D	I	S	R	K	H	G	C	A	F	L	V	D	E	V	Q	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	S	T	G	K	F	W	A	H	E	H	W	G	L	D	D	P	A	D	V	M	T	F	S	K	K	M	M	T	G	G	F	F	H	K	.
Template Known Secondary structure			B																	T	T								T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	T	T	S	S	S	S	G	G	G	G	G			S	S			S						G	G	G	S	S							.
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Template SS confidence
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.													.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y	D	G	M	N	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	V	C	Q	Q	A	G	G	H	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.																												.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.																												.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	F	R	P	N	A	P	Y	R	I	F	N	T	W	L	G	D	P	S	K	N	L	L	L	A	E	V	.	I	N	I	I	K	R	E	D	L	L	S	N	A	A	H	A	G	K	V	L	L	T	G	L	L	D	L	.	.	.	Q	A	R	Y	P	Q	F	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	S		S	S	T	T	S	S			S		S	S												.							T	T																				.	.	.					T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.																												.	.	.
Template SS confidence
															340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.		.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.				.	.	.	.	.	400	.	.
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Sequence		S	R	V	R	G	R	G	T	F	C	S	F	D	T	P	D	E	S	I	R	N	K	L	I	S	I	A	R	N	K	G	V	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	G	C	G	D	K	S	I	R	F	R	.	P	T	L	V	F	R	D	H	H	A	H	L	F	L	N	I	F
Template Known Secondary structure								T	T							S	S														T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	T						.			T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template SS confidence
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.		.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
		440	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	H	V	K	E	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	D	I	L	A	D
Template Known Secondary structure							T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		465	.	.	.	.	470