Job Description P0A853 Confidence 99.96% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 63 Aligned Residues 364 % Identity 16% Template d1fc4a_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.00

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	P	E	P	F	R	I	R	V	I	E	P	V	K	R	T	T	R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	R	G	D	E	A	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	G	S	R	S
Query Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.												.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.												.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	K	E	E	R	I	I	T	S	A	Q	Q	A	D	I	T	V	A	D	G	S	H	V	I	N	.	F	C	A	N	N	Y	L	G	L	A	N	.	H	P	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	A	A	K	A	G	X	D	S	H	G	F	G	X	A	S	V	R	F	I	C	G	T	Q	D	S
Template Known Secondary structure								B		S		S	S	S				B	T	T	S						.				S		T	T	S		T	T	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													S				S
Template Predicted Secondary structure																											.												.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.		.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.		.	.	60	.												.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	Y	A	L	A	E	S	V	K	N	I	F	G	Y	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F
Query Conservation
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.
Template Sequence		H	K	E	L	E	Q	K	L	A	A	F	L	G	X	E	D	A	I	L	Y	S	S	C	F	D	A	N	G	G	L	F	E	T	L	L	G	A	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	I	I	S	D	A	L	N	H	A	S	I	I	D	G	V	R	L	C	K	A	K	R	Y	R	Y	A	N	N	.	.	.
Template Known Secondary structure														T		S						S								T	T							T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T											T	S		S							T	T	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.										.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.			.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.
Query SS confidence																									.	.
Query Sequence		D	T	G	V	R	Y	D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	.	.	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F
Query Conservation																									.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																				.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	X	Q	E	L	E	A	R	L	K	E	A	R	E	A	G	A	R	H	V	L	I	A	T	D	G	V	F	S	X	D	G	.	.	.	.	V	I	A	N	L	K	G	V	C	D	L	A	D	K	Y	D	A	L	V	X	V	D	D	S	H	A	V	G	F	V	G	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															T	T		S	S							S			T	T	T	T	.	.	.	.															T	T								T	T	T	T	T	T	S	S	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Template SS confidence
														157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.					.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	G	R	G	S	H	E	Y	C	D	V	X	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	I	I	T	G	T	L	G	K	A	L	G	G	A	S	G	G	Y	T	A	A	R	K	E	V	V	E	W	L	R	Q	R	S	R	P	Y	.	.	.	.	.	.	L	F	S	N	S	L	A	P	A	I	V	A	A	S
Template Known Secondary structure		T	S							T	T		T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.		S						S	S	S	T	T		S	S	S																						.	.	.	.	.	.			S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.										.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.							.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	V	G	L	Y	D	G	M	N	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	V	C	Q	Q	A	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G
Query Conservation
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	K	V	L	E	X	V	E	A	G	S	E	L	R	D	R	L	W	A	N	A	R	Q	F	R	E	Q	X	S	A	A	G	F	T	L	A	G	A	D	H	A	I	I	P	V	X	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	D	A	V	V	A	Q	K	F	A
Template Known Secondary structure										T																						T	T			B			S	S	S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.					.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.
Query Sequence		S	F	L	L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	.	.	.	.	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N	A	A	N	I	K
Query Conservation																				.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.							.
Template Conservation																														.
Template Sequence		R	E	L	Q	K	E	G	I	Y	V	T	G	F	F	Y	P	V	V	P	K	G	Q	A	R	I	R	T	Q	.	X	S	A	A	H	T	P	E	Q	I	T	R	A	V	E	A	F	T	R	I	G	K	Q	L	G	V	I	A
Template Known Secondary structure							T	T								T	T	S	S		T	T								.			T	T																				T	T	S
Template Predicted Secondary structure																														.
Template SS confidence
		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.