Job Description P0A853 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 364 % Identity 17% Template d1ejia_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.90

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		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.												.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.					.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Query Sequence		R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	D	E	A	Y	S	G	S	R	S	Y	Y	A	.	.	.	.	L	A	E	S	V	K
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	K	E	S	N	R	Q	.	.	.	.	R	V	G	L	E	L	I	A	S	E	N	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	A	V	L	E	A	L	G	S	S	L	N	N	K	Y	S	E	G	Y	P	G	Q	R	Y	Y	G	G	T	E	F	I	D	E	L	E	X	L	C	Q	K	R	A	L
Template Known Secondary structure									.	.	.	.		S	S					T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	S	G	G	G	G					S		S	S	S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		38	.	40	.	.	.	.					.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.													.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
		89	90	.	.	.	.					.	.		.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.			.
Query SS confidence								.	.	.	.			.
Query Sequence		N	I	F	G	Y	Q	.	.	.	.	Y	T	.	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V
Query Conservation								.	.	.	.			.
Alig confidence								.	.	.	.			.																																									.																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	A	Y	H	L	D	P	Q	C	W	G	V	N	V	Q	P	Y	S	G	S	P	A	N	F	A	V	Y	T	A	L	V	E	P	H	G	R	I	X	G	L	D	L	P	D	G	G	H	L	T	H	G	F	X	.	T	D	K	K	K	I	S	A	T	S	I	F	F	E	S	X	P	Y	K	V	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T			T	T	T								S	S													T		T	T								G	G	G	T			G	G	G			B	.		S	S		B		S						S							B	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																							.																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.		.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	Y	D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q	R	E	A
Query Conservation
Alig confidence		.																							.	.	.														.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																							.	.	.														.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	Y	P	E	T	G	Y	I	N	Y	D	Q	L	E	E	N	A	S	L	F	H	P	K	.	.	.	L	I	I	A	G	T	S	C	Y	S	R	N	L	.	.	.	.	.	.	D	Y	A	R	L	R	K	I	A	D	D	N	G	A	Y	L	X	A	D	X	A	H	I	S	G	L	V	A	A	G	V	V	P	S	P
Template Known Secondary structure		.		T	T	T		S	B															S	.	.	.							S	S			S			.	.	.	.	.	.												T	T								G	G	G						T	T	S	S			G
Template Predicted Secondary structure		.																							.	.	.														.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.				.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.							210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.															.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	G	G	L	L	C	M	K	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G	G
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	E	H	C	H	V	V	T	T	T	T	H	K	T	L	R	G	C	R	A	G	X	I	F	Y	R	K	G	V	R	S	V	D	P	K	T	G	K	E	T	Y	Y	E	L	E	S	L	I	N	S	A	V	F	P	G	.	.	.	.	.	.	.	L	Q	G	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	T		S						S	S	G	G	G				S															S	T	T																	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	T			S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.								300	.	.	.
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.				.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.			.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.																															.	.
Query SS confidence																				.	.	.																															.	.
Query Sequence		L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y	D	G	M	N	.	.	.	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	V	C	Q	Q	A	G	G	.	.	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E
Query Conservation																				.	.	.																															.	.
Alig confidence																				.	.	.																															.	.											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	H	N	H	A	I	A	G	V	A	V	A	L	K	Q	A	X	T	T	E	F	K	I	Y	Q	L	Q	V	L	A	N	C	R	A	L	S	D	A	L	T	E	L	G	Y	K	I	V	T	G	G	S	D	N	H	L	I	L	X	D	L	R	S	K	.	.	.	.	.	.	.	G	T	D	G	G	R	A	E	K	V
Template Known Secondary structure																		T	S																								T	T			B	T	T	S	S		S	S	S						G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.								.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420				.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.
Query Sequence		L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	.	.	.	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N	A	A	N	I	K	G	L	T	F	T	Y	E
Query Conservation																																						.	.	.
Alig confidence			.							.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Template Conservation			.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	.	E	A	C	S	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	C	N	K	N	T	C	P	G	D	K	S	A	L	R	P	S	G	L	R	L	G	T	P	A	L	T	S	R	G	L	L	E	E	D	F	Q	K	V	A	H	F	I	H	R	G	I	E	L	T	L	Q	I	Q	S	H	X	A	T	K	A
Template Known Secondary structure			.			T	T			.	.	.	.	.	.	.	.		B					S	S	S	S		T	T	S		S											T	T	T																										T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure			.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		377		.	.	380	.	.	.									.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.