Job Description P0A853 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 352 % Identity 16% Template d1bj4a_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.65

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.												.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.					.	.	.	.	.	90	.	.	.	.					.	.		.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.											.	.	.	.			.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.											.	.	.	.			.
Query Sequence		L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	D	E	A	Y	S	G	S	R	S	Y	Y	A	L	A	.	.	.	.	E	S	V	K	N	I	F	G	Y	Q	.	.	.	.	Y	T	.	I	P	T
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.											.	.	.	.			.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.											.	.	.	.			.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	I	A	S	E	N	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	A	V	L	E	A	L	G	S	C	L	N	N	K	Y	S	E	G	Y	P	G	Q	R	Y	Y	G	G	T	E	F	I	D	E	L	E	T	L	C	Q	K	R	A	L	Q	A	Y	K	L	D	P	Q	C	W	G	V	N	V	Q	P
Template Known Secondary structure				T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	S	G	G	G	T							T	T			S	S	S																				T	T			T	T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		50	.	.	.	.	.	.	.													.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V	R	Y	D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G
Query Conservation
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	S	G	S	P	A	N	F	A	V	Y	T	A	L	V	E	P	H	G	R	I	M	G	L	D	L	P	D	G	G	H	L	T	H	G	F	M	T	D	.	.	.	.	.	.	.	.	K	K	K	I	S	A	T	S	I	F	F	E	S	M	P	Y	K	V	N	P	D	T	G	Y	I	N	Y	D	Q	L	E	E	N
Template Known Secondary structure		S	S													T		T	T								G	G	G	T			G	G	G			B		S	.	.	.	.	.	.	.	.	S		B		S						S							B		T	T	T		S	B
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.									.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.														.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.														.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	R	L	F	H	P	K	.	.	.	L	I	I	A	G	T	S	C	Y	S	R	N	L	.	.	.	.	.	.	E	Y	A	R	L	R	K	I	A	D	E	N	G	A	Y	L	M	A	D	M	A	H	I	S	G	L	V	A	A	G	V	V	P	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	E
Template Known Secondary structure								S	.	.	.							S	S			S			.	.	.	.	.	.												T	T								G	G	G						T	T	S	S			G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G
Template Predicted Secondary structure									.	.	.														.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		190	.	.	.	.	.	.				.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.							210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.															.	.
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.								.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.				.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Query Sequence		Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	V	Q	E	G	F	.	.	.	.	.	.	.	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y	D	G	M	N	.	.	.	L	D
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	C	H	V	V	T	T	T	T	H	K	T	L	R	G	C	R	A	G	M	I	F	Y	R	K	G	V	K	S	V	D	P	A	T	G	K	E	I	L	Y	N	L	E	S	L	I	N	S	A	V	F	P	G	L	Q	G	G	P	H	N	H	A	I	A	G	V	A	V	A	L	K	Q	A	M	T	L	E	F	K	V
Template Known Secondary structure		T		S						S	S	G	G	G				S									S						T	T	T																	T	T	T	T			S																T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.			.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.
Query SS confidence																										.	.
Query Sequence		W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	V	C	Q	.	.	Q	A	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	K	T
Query Conservation																										.	.
Alig confidence																										.	.															.	.	.	.	.	.	.												.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.												.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	Q	H	Q	V	V	A	N	C	R	A	L	S	E	A	L	T	E	L	G	Y	K	I	V	T	G	G	S	D	N	H	L	I	L	V	D	L	R	S	K	.	.	.	.	.	.	.	G	T	D	G	G	R	A	E	K	V	L	.	E	A	C	S	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	C	N	K	N	T	C	P
Template Known Secondary structure																				T	T				T	T	S	S		S	S	S						G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	T											.			T	T			.	.	.	.	.	.	.	.							T
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.												.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.								.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.		.	.	380	.	.	.									.	.	.	.	.	.	390
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420				.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
Predicted Secondary structure															.	.	.
Query SS confidence															.	.	.
Query Sequence		G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	.	.	.	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N	A	A	N	I	K
Query Conservation															.	.	.
Alig confidence															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	D	R	S	A	L	R	P	S	G	L	R	L	G	T	P	A	L	T	S	R	G	L	L	E	K	D	F	Q	K	V	A	H	F	I	H	R	G	I	E	L	T	L	Q	I	Q
Template Known Secondary structure		T		S		T	T	S														T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.