Job Description P0A853 Confidence 99.83% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 194 Aligned Residues 367 % Identity 14% Template c3t18D_ PDB info PDB header:transferase Chain: D: PDB Molecule:aminotransferase class i and ii; PDBTitle: crystal structure of aminotransferase from anaerococcus prevotii dsm2 20548. Resolution 2.86 Å

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		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.		.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
Predicted Secondary structure																																												.																																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.																																	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	P	V	K	R	T	T	R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	.	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	R	G	D	E	A	Y	S	G	S	R	S	Y	Y	A	L	A	E	S	V	K	N	I	.	.	.	.	.
Query Conservation																																												.																																	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.														.																																	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.
Template Sequence		D	L	A	F	D	I	N	N	K	A	N	A	A	I	E	K	Y	G	R	E	A	V	I	N	A	A	L	G	.	T	L	L	D	D	K	G	K	I	I	A	L	P	S	V	Y	D	R	L	D	E	X	D	R	S	H	I	A	S	Y	A	P	I	E	G	E	K	D	Y	R	K	I	V	I	D	T	L	F	G	P	Y
Template Known Secondary structure																				G	G	G						S		.			B		T	T	S		B												T	S		G	G	G	T	S	S				T	T															G	G	G
Template Predicted Secondary structure																														.
Template SS confidence
		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.		.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
				91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	F	G	Y	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V	R	Y	D	F	K
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	P	E	G	Y	I	S	A	I	A	T	P	G	G	T	G	A	I	R	S	A	I	F	S	Y	L	D	E	G	D	P	L	I	C	H	D	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	W	A	P	Y	R	K	I	C	E	E	F	G	R	N	F	K	T	F	E	F	F	T	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D
Template Known Secondary structure				S	S								S													T	S		S	S							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T										T									B		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130										.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.										.
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.			.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.							220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure																													.	.																									.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.																									.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	.	.	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	.	.	.	.	.	.	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q
Query Conservation																													.	.																									.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.						.																			.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	A	F	N	I	D	V	Y	K	E	A	I	D	E	G	I	R	D	S	D	R	I	A	S	L	I	N	S	P	G	N	N	P	T	.	G	Y	S	L	S	D	E	E	W	D	E	V	I	T	F	L	K	E	K	A	E	D	K	D	K	K	I	T	L	I	V	D	V	A	Y	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S	B															S		S									S	S		T	T	T	.														T	T	T	T	T	T	T	T	S	T	T										T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																				.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.					.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.			.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.															.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.															.	.
Query Sequence		R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	.	.	.	.	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	.	.	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A
Query Conservation																								.	.	.	.															.	.
Alig confidence		.																						.	.	.	.															.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	E	F	A	G	D	G	D	Q	Q	R	K	F	F	E	K	F	S	N	L	P	R	N	L	F	V	V	V	A	F	S	X	S	K	S	H	T	A	Y	G	L	R	S	G	A	A	V	G	I	S	S	S	K	E	I	I	E	E	F	E	A	S	L	A	H	S	A	R	C	N	W	S	N	G	T	H	A	A	Q	N
Template Known Secondary structure		.	T	T	S	S	S	S	S	S	S	S	T	T	T	G	G	G	S	S			T	T														T		G	G	G										S																				T	S	S							T
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
		315	.	.	.	.	320	.	.	.						.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.		.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.																																	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.																																	.
Query Sequence		M	E	R	L	A	V	G	L	Y	.	.	.	.	.	D	G	M	N	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	V	C	Q	Q	A	.	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V
Query Conservation											.	.	.	.	.																																	.
Alig confidence											.	.	.	.	.																																	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	L	I	E	L	E	R	A	E	N	K	K	I	Y	E	Q	E	L	V	D	L	R	N	X	L	K	S	R	A	D	V	F	V	T	A	A	K	E	N	K	L	T	X	I	P	Y	F	G	G	F	F	T	F	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	K	A	F	D	I	V	K	D	L	E	K
Template Known Secondary structure		T	T	S	S	T	T	S	G	G	G	T	T																												T								S	S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S											T
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.													360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Sequence		E	N	I	F	T	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	S	A	K	G	I	R	V	A	I	.	.	C	G	V	G	E	E	K	I	P	K	L	V	Q	R	L	A	F	Y	T	N	K
Template Known Secondary structure		T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S						S	.	.	T	T	S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template SS confidence
		373	.	.	.	.	.																			.	380	.	.	.	.	.	.	.	.			.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.