Job Description P0A853 Confidence 99.87% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 154 Aligned Residues 368 % Identity 13% Template c3rq1A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:aminotransferase class i and ii; PDBTitle: crystal structure of aminotransferase class i and ii from veillonella2 parvula Resolution 2.20 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.					.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.																				.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.																				.
Query Sequence		E	P	V	K	R	T	T	R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	R	G	D	E	.	.	.	.	A	Y	S	G	S	R	S	Y	Y	A	L	A	E	S	V	K	N	I	F	.
Query Conservation																																																										.	.	.	.																				.
Alig confidence																														.	.	.	.																									.	.	.	.																				.
Template Conservation																														.	.	.	.
Template Sequence		D	V	I	F	V	T	A	G	Q	A	Q	A	D	A	K	E	N	G	R	E	N	V	V	N	G	T	L	G	.	.	.	.	A	I	H	D	E	E	G	N	L	V	F	L	K	T	V	K	E	E	Y	L	S	L	S	D	S	E	H	V	G	Y	A	P	I	A	G	I	P	D	F	L	C	A	A	E	K	E	C	F
Template Known Secondary structure																				G	G	G						S	S	.	.	.	.			B		T	T	S		B												T								S				T	T
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.
Template SS confidence
		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.					.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
								92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	G	Y	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V	R	Y
Query Conservation		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	F	R	P	E	G	H	I	R	S	I	A	T	A	G	G	T	G	G	I	H	H	L	I	H	N	Y	T	E	P	G	D	E	V	L	T	A	D	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	W	G	A	Y	R	V	I	C	S	D	T	G	R	T	L	V	T	Y	S	L	F	D	E	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G			S	S								S														S		T	T							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T									T	T								S	B		T	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.										.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.			.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220							.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.																									.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.																									.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	.	.	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	.	.	.	.	.	.	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F
Query Conservation																																	.	.																									.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																														.	.					.																				.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																																				.																																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	H	N	N	F	N	H	E	A	F	Q	N	R	V	N	E	L	A	A	K	Q	T	N	V	V	V	I	F	N	T	P	G	N	N	P	T	.	G	Y	S	I	E	D	K	D	W	D	S	I	L	N	F	L	K	D	L	V	A	I	G	R	N	N	V	I	I	G	I	D	V	A	Y	L	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	T	S	S	B																	S									S	S		T	T	T	.																						T	S	S										T	T	G	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.																																				.																																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190		.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.					.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.			.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.															.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.															.	.
Query Sequence		I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	.	.	.	.	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	.	.	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G	G	L	E
Query Conservation																											.	.	.	.															.	.
Alig confidence		.	.	.	.																						.	.	.	.															.	.
Template Conservation		.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	D	Y	S	G	E	K	D	E	V	R	A	F	F	N	K	F	S	H	L	P	K	E	I	L	T	C	V	C	Y	S	L	S	K	G	F	T	X	Y	G	Q	R	V	G	A	X	I	G	I	S	D	D	E	E	I	A	D	E	F	F	E	V	N	K	S	T	S	R	A	T	W	S	N	I	C	R	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	G	G	S	S							G	G	G	G	G	G	T	T			T	T									S	T	T	T	T	T			S	S										S	S																			T	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Template SS confidence
						227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.							.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.		.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.																														.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.																														.
Query Sequence		G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y	D	G	M	.	.	.	.	.	.	N	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	V	C	Q	Q	A	.	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.																														.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.																														.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	X	R	T	X	A	N	I	V	A	D	P	A	K	F	K	E	Y	E	A	E	R	N	C	Y	Y	Q	L	I	R	D	R	A	D	I	F	K	Q	E	A	A	Q	V	G	L	P	X	L	P	Y	R	G	G	F	F	I	T	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	S	A	N	A	I	C	E
Template Known Secondary structure											T																																		T								S	S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.													.	.	.	.	.	.	.	.	370
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N	A	A	N	I
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Sequence		E	L	K	K	E	H	I	Y	V	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	A	N	G	I	R	I	A	.	.	A	C	G	I	P	K	C	Q	X	T	G	L	A	E	K	I	Y	N	A	X	K	S	L	G	K	L
Template Known Secondary structure						T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S						.	.	G	G	G	S						T	T												T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template SS confidence
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380																			.	.	.	.	.	.	.	.	.			390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.