Job Description P0A853 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 402 % Identity 14% Template c3i5tB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:aminotransferase; PDBTitle: crystal structure of aminotransferase prk07036 from rhodobacter2 sphaeroides kd131 Resolution 2.00 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.				.	70	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.
Query SS confidence																																																																						.	.	.
Query Sequence		M	E	N	F	K	H	L	P	E	P	F	R	I	R	V	I	E	P	V	K	R	T	T	R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	.	.	.	R	G	D	E	A	Y	S	G	S
Query Conservation																																																																						.	.	.
Alig confidence										.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Conservation										.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	A	K	L	G	K	S	A	.	Q	P	V	L	T	H	A	E	G	I	Y	V	H	T	E	D	G	R	R	L	I	D	G	P	A	G	M	W	C	A	Q	V	G	Y	G	R	R	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	A	M	A	H	Q	A	M	V	L	P	Y	A	S	P	W	Y	M	A	T
Template Known Secondary structure		G	G	G	T	T	T			.									B	T					T	T							T	T					T		T	T		B						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																T	T	T
Template Predicted Secondary structure										.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		26	.	.	.	30	.	.	.		.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.												.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.			.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	S	Y	Y	A	L	A	E	S	V	K	N	I	F	.	.	G	Y	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	P	A	A	R	L	A	E	K	I	A	T	L	T	P	G	D	L	N	R	I	F	F	T	T	G	G	S	T	A	V	D	S	A	L	R	F	S	E	F	Y	N	N	V	L	G	R	P	Q	K	K	R	I	I	V	R	Y	D	G	Y	H	G	S	T	A	L	T	A	A	C	T	G	R	T	G	N	W	P	N	F
Template Known Secondary structure													T	T	S	S	T	T								S	S																			T	T		T	T								T	T					S	S						T				G	G	G		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
								148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V	R	Y	D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation																															.
Template Sequence		D	I	A	Q	D	R	I	S	F	L	S	S	P	N	P	R	H	A	G	N	R	S	Q	E	A	F	L	D	D	.	L	V	Q	E	F	E	D	R	I	E	S	L	G	P	D	T	I	A	A	F	L	A	E	P	I	L	A	S	G	G	V	I	I	P	P	A	G	Y	H	A	R	F	K	A	I	C	E	K	H	D
Template Known Secondary structure						T	T									G	G	G		T	T	S									.														G	G	G								S	S	B	T	T	T	T	S	B				T	T												T	T
Template Predicted Secondary structure																															.
Template SS confidence
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.		.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.		.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure																																					.
Query SS confidence																																					.
Query Sequence		I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	.	T	Y	K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	V
Query Conservation																																					.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	L	Y	I	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	V	V	T	G	F	G	R	C	G	E	W	F	A	S	E	K	V	F	G	V	V	P	D	I	I	T	F	A	K	G	V	T	S	G	Y	V	P	L	G	G	L	A	I	S	E	A	V	L	A	R	I	S	G	E	N	A	K	G	S	W	F
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T	T	T	T	T	T	S	S	S						T	T					S						G	G	G	G	T	T	S	S														T	T	S	G	G	G		T	T
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		253	.	.	.	.	.													.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.					.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.
Query Sequence		Q	E	G	F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y	D	G	M	N	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	.	.	.	.	G	V	V	C	Q	Q	A	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F
Query Conservation																																																		.	.	.	.
Alig confidence													.	.																																				.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	N	G	Y	T	Y	S	N	Q	P	V	.	.	A	C	A	A	A	L	A	N	I	E	L	M	E	R	E	G	I	V	D	Q	A	R	E	M	A	D	Y	F	A	A	A	L	A	S	L	R	D	L	P	G	V	A	E	T	R	S	V	G	L	V	G	C	V	Q	C	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						T	T	T	T				.	.															T	T																		T	T	T	T	S	T	T								T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.			.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N	A	A	N	I	K	G	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	T	A	E	D	K	A	F	T	L	K	I	D	E	R	C	F	E	L	G	L	I	V	R	P	L	G	D	L	C	V	I	S	.	P	P	L	I	I	S	R	A	Q	I	D	E	M	V	A	I	M	R	Q	A	I	T	E	V	S	A	A	H	G	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				T	T							T	T						.			T	T																								S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template SS confidence
													388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.		.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.