Job Description P0A853 Confidence 99.87% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 147 Aligned Residues 355 % Identity 13% Template c3h14A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:aminotransferase, classes i and ii; PDBTitle: crystal structure of a putative aminotransferase from silicibacter2 pomeroyi Resolution 1.90 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.		.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.		.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.																																																			.
Query SS confidence										.																																																			.
Query Sequence		M	E	N	F	K	H	L	P	.	E	P	F	R	I	R	V	I	E	P	V	K	R	T	T	R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	.	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	R	G	D	E	A	Y	S	G	S	R
Query Conservation										.																																																			.
Alig confidence										.						.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.							.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	N	S	S	R	S	A	V	D	P	F	I	V	.	.	.	.	.	.	.	.	X	D	V	X	E	A	A	R	R	A	E	E	A	G	R	R	I	I	H	X	E	V	G	Q	P	.	.	.	.	.	.	G	T	G	A	P	R	G	A	V	E	A	L	A	K	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E
Template Known Secondary structure						S	T	T						T	T	.	.	.	.	.	.	.	.													T	T									S	S		.	.	.	.	.	.	S	S		S													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.									.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.							.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.											.
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.									.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	Y	Y	A	L	A	E	S	V	K	N	I	F	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	L	P	A	L	R	Q	R	I	A	R	L	Y	G	E	W	Y	G	V	D	L	D	P	G	R	V	V	I	T	P	G	S	S	G	G	F	L	L	A	F	T	A	L	F	D	S	G	D	R	V	G	I	G	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	P	S	Y	R	Q	I	L	R	A	L	G	L	V	P
Template Known Secondary structure																								G	G	G					S	S															T	T								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.										.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V	R	Y	D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.															.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.															.
Template Sequence		V	D	L	P	T	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	N	R	L	Q	P	V	P	A	D	F	A	G	L	.	.	.	.	D	L	A	G	L	X	V	A	S	P	A	N	P	T	.	G	T	X	L	D	H	A	A	X	G	A	L	I	E	A	A	Q	A	Q	G	A	S	F	I	S	D	E	I	Y
Template Known Secondary structure								G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	T	T	S							T	T	S	.	.	.	.			S						S	S		T	T	T	.																			T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.															.
Template SS confidence
		140	.	.	.	.	.	.												.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160					.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.		.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.			.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.
Query SS confidence																																																.	.
Query Sequence		F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	.	.	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G
Query Conservation																																																.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	I	E	Y	E	A	K	A	V	T	A	L	E	L	T	D	E	C	Y	V	I	N	S	F	S	K	Y	F	S	X	T	G	W	R	V	G	W	X	V	V	P	E	D	Q	V	R	V	V	E	R	I	A	Q	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	X	F	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		B	S	S	S					G	G	G	T		S	S	S						S	S	S	T	T			T	T	S									G	G	G											.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.										.	260	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.		.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.			.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.																											.	.
Query SS confidence																					.																											.	.
Query Sequence		G	L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y	D	G	M	N	.	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	V	C	Q	.	.	Q	A	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E	L
Query Conservation																					.																											.	.
Alig confidence																					.																											.	.											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																												.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	A	P	H	A	S	Q	V	A	A	L	A	A	L	D	C	D	A	E	L	Q	A	N	L	D	V	Y	K	A	N	R	K	L	X	L	E	R	L	P	K	A	G	F	T	R	I	A	P	P	D	G	A	F	Y	V	Y	A	D	.	.	.	.	.	.	.	V	S	D	L	T	D	D	S	R	A	F	A	A	E	I
Template Known Secondary structure															T	T																											T				B					B	T	T						.	.	.	.	.	.	.		T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		262	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.								320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N	A
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Sequence		L	E	K	A	G	V	A	V	T	P	G	L	D	F	D	P	E	R	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	L	R	F	S	Y	A	R	.	.	.	A	T	A	D	I	E	E	G	L	D	R	L	E	A	F	X	Q	A	R
Template Known Secondary structure												G	G	G	T		T	T	T	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G								S	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template SS confidence
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.											.	.	.	.	.	360	.	.	.				.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.