Job Description P0A853 Confidence 99.80% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 210 Aligned Residues 380 % Identity 12% Template c3g0tA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:putative aminotransferase; PDBTitle: crystal structure of putative aspartate aminotransferase (np_905498.1)2 from porphyromonas gingivalis w83 at 1.75 a resolution Resolution 1.75 Å

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		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.		.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.		.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70		.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.																										.													.
Query SS confidence																										.																										.													.
Query Sequence		P	F	R	I	R	V	I	E	P	V	K	R	T	T	R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	.	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	.	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	R	G	.	D	E	A	Y	S	G	S	R	S	Y	Y	A	L	A	E	S
Query Conservation																										.																										.													.
Alig confidence																										.														.	.	.	.	.	.							.													.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	H	I	K	D	L	G	X	A	S	I	R	D	L	V	A	L	V	T	N	L	E	K	A	T	G	T	K	F	C	R	X	E	X	G	V	P	.	.	.	.	.	.	G	L	P	A	P	Q	I	G	I	E	T	E	I	Q	K	L	R	E	G	V	A	S	I	Y	P	N	L	D	G	L	P	E	L	K	Q	E
Template Known Secondary structure				T		S		G	G	G																		T										S		.	.	.	.	.	.		S																	T	G	G	G	S				T	T
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.							.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		87	.	.	90	.					.	.	.					.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.					120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.				.	.	.	.																										.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.				.	.	.	.																										.	.	.	.
Query Sequence		V	K	N	I	F	.	.	.	.	G	Y	Q	.	.	.	.	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	.	.	.	.	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y
Query Conservation							.	.	.	.				.	.	.	.																										.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.				.	.	.	.																										.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	S	R	F	A	K	L	F	V	N	I	D	I	P	A	R	A	C	V	P	T	V	G	S	X	Q	G	C	F	V	S	F	L	V	A	N	R	T	H	K	N	R	E	Y	G	T	L	F	I	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	N	L	N	K	L	Q	C	R	I	L	G	Q	K	F	E	S	F	D
Template Known Secondary structure																G	G	G					S														T	T	S		T	T		S								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140										.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	K	E	A	F	D	T	G	V	R	Y	D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.															.																														.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.															.																														.	.
Template Sequence		L	F	E	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	K	L	R	E	K	L	E	S	Y	L	Q	T	G	.	.	.	.	Q	F	C	S	I	I	Y	S	N	P	N	N	P	T	.	W	Q	C	X	T	D	E	E	L	R	I	I	G	E	L	A	T	K	H	D	V	I	V	I	E	D	L	A	Y	.	.	F	G
Template Known Secondary structure		G	G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	T	T											T	T	T	.	.	.	.									S	S		T	T	T	.																			T	T								T	T	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.															.																														.	.
Template SS confidence
		161	.	.	.	.									.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180					.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.		.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.			.	.
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.			.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.										.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	Y	F	I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	.	.	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	C	V	V	Q	E	G
Query Conservation																																												.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.																	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.
Template Sequence		X	D	F	R	K	D	Y	S	H	P	G	E	P	L	Y	Q	P	S	V	A	N	Y	T	.	.	.	D	N	Y	I	L	A	L	S	S	S	A	F	S	Y	A	G	Q	R	I	G	V	L	X	I	S	G	K	L	Y	E	R	E	Y	P	D	L	E	E	S	F	G	R	L	R	F	G	E	A	L	S	S	S	A	L
Template Known Secondary structure				T	T	S				S	T	T	S	S						G	G	G	T		.	.	.	S												S		G	G	G															B		G	G	G					S		S	B							T	T
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.
Template SS confidence
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.				.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.						.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.									.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y	D	G	M	N	.	.	.	.	.	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	V	C	Q	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H
Query Conservation																										.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		Y	A	L	S	S	G	A	T	H	S	A	Q	W	G	X	A	A	X	L	K	A	C	N	D	G	E	Y	N	F	R	D	S	V	I	E	Y	G	R	K	A	R	I	X	K	K	X	F	L	D	N	G	F	N	I	V	Y	D	K	D	G	N	E	P	L	A	D	G	F	Y	F	T	V	G	Y	K	G	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						S	S	S																	T	T	S																							T	T	T				S	S				T	T					S	S	S							T	T	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	X	D	S	S	K	L	I	E	K	F	V	R	Y	G	X	C	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	T	L	K	T	T	G	S	K	R	N	E	A	X	R	I	C	.	.	T	S	L	L	P	E	S	Q	F	P	D	L	E	K	R	L	Q	X	L	N	A	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.													T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	T	T	T	T				T	T						.	.		S	S	S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template SS confidence
							380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.													.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.			.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.