Job Description P0A853 Confidence 99.71% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 226 Aligned Residues 339 % Identity 14% Template c3f6tA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:aspartate aminotransferase; PDBTitle: crystal structure of aspartate aminotransferase (e.c. 2.6.1.1)2 (yp_194538.1) from lactobacillus acidophilus ncfm at 2.15 a3 resolution Resolution 2.15 Å

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		62	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90												.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.						.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Query Sequence		S	M	Q	A	A	M	M	R	G	D	E	A	Y	S	G	S	R	S	Y	Y	A	L	A	E	S	V	K	N	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	Y	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	.	.	.	.	.	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	E	W	V	N	G	A	V	A	N	N	Y	P	V	P	D	R	C	L	V	N	T	E	K	I	I	N	Y	F	L	Q	E	L	S	Y	K	D	A	N	L	A	E	Q	T	D	L	F	P	T	E	G	G	T	A	A	I	V	Y	A	F	H	S	L	A	E	N	H	L	L	K	K	G	D	K	I	A	I	N	E	P
Template Known Secondary structure										T		S			S	S	S	S																		T	T	T				G	G	G																							T	T	S	S		T	T							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V	R	Y	D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.															.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.															.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	F	T	P	Y	L	R	I	P	E	L	K	D	Y	E	L	V	E	V	D	L	H	S	.	.	.	.	.	.	Y	E	K	N	D	W	E	I	E	P	N	E	I	E	K	L	K	D	P	.	.	.	.	S	I	K	A	L	I	V	V	N	P	T	N	P	T	.	S	K	E	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	S	G	G	G	G	G	S										.	.	.	.	.	.		T	T	T	T	S											S		T	.	.	.	.	T								S	S		T	T	T	.		B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.															.
Template SS confidence
											201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.							.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.					.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.		.	.	.	260
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220		.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.
Query SS confidence																	.
Query Sequence		S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	.	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	G	G	L	L	C	M	K	D
Query Conservation																	.
Alig confidence																	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	T	N	A	L	N	A	I	K	Q	A	V	E	K	N	P	K	L	X	I	I	S	D	E	V	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	F	V	P	N	F	K	S	I	Y	S	V	V	P	Y	N	T	X	L	V	Y	S	Y	S	L	F	G	C	T	G	W	R	L	G	V	I	A	L	N	E
Template Known Secondary structure																	T	T								T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	S	T	T								S	G	G	G											S		G	G	G									S
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.														.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.									.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	G	M	N	L
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	N	V	F	D	D	N	I	A	H	L	D	K	V	E	L	R	Q	L	H	K	R	Y	S	S	V	V	L	D	P	D	K	X	K	F	I	D	R	L	C	A	D	S	R	S	I	G	L	Y	H	T	A	G	L	S	T	P	Q	Q	I	X	E	A	L	F	S	X	T	H	L	L	T	S	T	N	G	G	S	D	D
Template Known Secondary structure		S									T	S														T	T		S		G	G	G												T	T	T	T	T	G	G	G		S																		T	T		B	G	G	G	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.				.	350	.	.	.	.	.		.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380									.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.								.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.								.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	.	.	.	G	V	V	C	Q	Q	A	.	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I
Query Conservation																						.	.	.								.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.								.																										.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		P	Y	I	D	I	A	R	K	L	V	S	E	R	Y	D	Q	L	H	D	A	X	Q	A	P	K	D	E	T	D	T	N	T	H	Y	Y	S	L	I	D	I	Y	R	L	A	E	K	I	Y	G	K	E	F	R	D	Y	L	T	N	N	F	E	Q	V	D	F	L	L	K	L	A	E	K	N	G	V	V	L	V	.	.
Template Known Secondary structure																							T						S	T	T	B			S																																							T	T	S	S	S		.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.		.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.
Query SS confidence																					.
Query Sequence		G	S	F	L	L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	.	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N	A	A	N
Query Conservation																					.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.								.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	V	G	F	G	A	K	P	G	E	L	R	V	S	Q	.	.	A	N	L	P	T	E	D	Y	A	L	I	G	K	Q	V	L	E	L	L	K	E	Y	Y	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T					S	S	T	T						S	.	.	S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template SS confidence
													487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.			.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.