Job Description P0A853 Confidence 99.85% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 181 Aligned Residues 359 % Identity 14% Template c3eleB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:amino transferase; PDBTitle: crystal structure of amino transferase (rer070207001803) from2 eubacterium rectale at 2.10 a resolution Resolution 2.10 Å

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		18	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.		.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.					.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
Predicted Secondary structure																																											.																.	.	.	.																		.	.
Query SS confidence																																											.																.	.	.	.																		.	.
Query Sequence		P	V	K	R	T	T	R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	.	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	R	G	D	E	A	.	.	.	.	Y	S	G	S	R	S	Y	Y	A	L	A	E	S	V	K	N	I	.	.
Query Conservation																																											.																.	.	.	.																		.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.							.																.	.	.	.																		.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	I	R	E	L	F	E	Y	G	K	K	R	A	A	I	V	G	K	E	N	V	Y	D	F	S	I	G	N	P	.	.	.	.	.	.	S	I	P	A	P	Q	I	V	N	D	T	I	K	E	L	V	T	D	Y	D	S	V	A	L	H	G	Y	T	S	A	Q	G	D	V	E	T	R	A	A	I	A	E	F	L	N
Template Known Secondary structure																			G	G	G										.	.	.	.	.	.		S																	S							S				T	T
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.							.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
								91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.		.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																												.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																												.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	F	G	Y	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	.	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																												.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																												.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template Sequence		N	T	H	G	T	H	F	N	A	D	N	L	Y	X	T	X	G	A	A	A	S	L	S	I	C	F	R	A	L	T	S	D	A	Y	D	E	F	I	T	I	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	F	P	E	Y	K	V	F	V	N	A	A	G	A	R	L	V	E	V	P	A	D	T	E	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										G	G	G					S	S															S	T	T							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T								T	T										T	T	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.										.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.							.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	Y	D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	.	.	.	.	.	.	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F
Query Conservation																																																												.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																.	.	.	.															.																					.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																.	.	.	.															.																																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	H	F	Q	I	D	F	D	A	L	E	E	R	I	N	A	.	.	.	.	H	T	R	G	V	I	I	N	S	P	N	N	P	S	.	G	T	V	Y	S	E	E	T	I	K	K	L	S	D	L	L	E	K	K	S	K	E	I	G	R	P	I	F	I	I	A	D	E	P	Y	R	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	T	S	S									T			T	.	.	.	.	T								S	S		T	T	T	.																								T	S									T	T	T	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																.	.	.	.															.																																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170					.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.		.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.			.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.
Query SS confidence																																									.	.
Query Sequence		I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	.	.	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M
Query Conservation																																									.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																		.	.																							.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	E	I	V	Y	D	G	I	K	V	P	F	V	T	K	Y	Y	D	N	T	L	V	C	Y	S	Y	S	K	S	L	S	L	P	G	E	R	I	G	Y	V	L	V	P	D	E	V	Y	D	K	A	E	L	Y	A	A	V	C	G	.	.	.	.	.	A	G	R	A	L	G	Y	V	C	A	P	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	T		B		T	T						G	G	G	T		S	S							S	T	T	T	S	S		G	G	G									T	T	S	T	T											.	.	.	.	.					T	T				S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.
Template SS confidence
								221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.						.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.		.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.
Query SS confidence																																							.
Query Sequence		E	R	L	A	V	G	L	Y	D	G	M	N	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	V	C	.	Q	Q	A	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V
Query Conservation																																							.
Alig confidence																																							.															.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Sequence		L	F	Q	K	X	I	V	K	C	Q	G	A	T	G	D	I	N	A	Y	K	E	N	R	D	L	L	Y	E	G	L	T	R	I	G	Y	H	C	F	K	P	D	G	A	F	Y	X	F	V	K	A	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	S	N	A	F	C	E	K	A	K	E	E	.	D	V	L	I	V
Template Known Secondary structure								T	T		T	T																							T							S	B	S	S							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S												T	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template SS confidence
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.										.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.		.	.	.	.	.
		395	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N	A	A	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	D	G	F	G	C	P	G	W	V	R	I	S	Y	C	V	.	.	.	D	R	E	X	I	K	H	S	X	P	A	F	E	K	I	Y	K	K	Y	N	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		G	G	G	G	T		T	T								S	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template SS confidence
															360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.				.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.