Job Description P0A853 Confidence 99.78% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 212 Aligned Residues 336 % Identity 14% Template c2zy3A_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:l-aspartate beta-decarboxylase; PDBTitle: dodecameric l-aspartate beta-decarboxylase Resolution 2.50 Å

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		62	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90												.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.						.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Query Sequence		S	M	Q	A	A	M	M	R	G	D	E	A	Y	S	G	S	R	S	Y	Y	A	L	A	E	S	V	K	N	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	Y	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	.	.	.	.	.	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	E	M	V	D	G	I	L	G	C	N	Y	P	V	P	P	R	M	L	N	I	S	E	K	I	V	R	Q	Y	I	I	R	E	M	G	A	D	A	I	P	S	E	S	V	N	L	F	A	V	E	G	G	T	A	A	M	A	Y	I	F	E	S	L	K	L	N	G	L	L	K	A	G	D	K	V	A	I	G	M	P
Template Known Secondary structure										T		S			S	S	T	T																	T	T		T	T	S		G	G	G							S																T	T	S	S		T	T								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170			.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.
Query SS confidence																																															.	.
Query Sequence		S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V	R	Y	D	F	K	G	N	.	.	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q
Query Conservation																																															.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.													.	.	.	.															.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.															.
Template Sequence		V	.	.	.	.	.	.	.	F	T	P	Y	I	E	I	P	E	L	A	Q	Y	A	L	E	E	V	A	I	N	A	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	N	W	Q	Y	P	D	S	E	L	D	K	L	K	D	P	.	.	.	.	A	I	K	I	F	F	C	V	N	P	S	N	P	P	.	S	V
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.		T					S	T	T	S	T	T	T										B	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	T	S	B							G	G	G	G		T	.	.	.	.	T								S	S		S	S	S	.		B
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.															.
Template SS confidence
		203								.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.											.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.					.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.		.	260
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.			.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.			.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.																																																								.	.
Query SS confidence																				.	.																																																								.	.
Query Sequence		P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	.	.	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	.	.	G	G	L
Query Conservation																				.	.																																																								.	.
Alig confidence																				.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.																	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Sequence		K	M	D	Q	R	S	L	E	R	V	R	N	I	V	A	E	H	R	P	D	L	M	I	L	T	D	D	V	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	F	A	D	D	F	Q	S	L	F	A	I	C	P	E	.	.	.	.	N	T	L	L	V	Y	S	F	S	K	Y	F	G	A	T	G	W	R	L	G	V
Template Known Secondary structure																		T		T	T								T	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	S	S									G	G	.	.	.	.	G							S	T	T	T	T	T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template SS confidence
		261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290											.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.					.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	C	R	T	L	C	V	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y	D	G	M
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	A	A	H	Q	Q	N	V	F	D	L	A	L	D	K	L	Q	E	S	E	K	V	A	L	D	H	R	Y	R	S	L	L	P	D	V	R	S	L	K	F	I	D	R	L	V	A	D	S	R	A	V	A	L	N	H	T	A	G	L	S	T	P	Q	Q	V	Q	M	A	L	F	S	L	F	A	L	M	D	E	A	D
Template Known Secondary structure						S	S									S	S												T	T	T	T		S		G	G	G											T	T	T	T	T	T	G	G	G		S	S																			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
		327			.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.									.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	.	.	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	V	C	Q	Q	A	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I
Query Conservation			.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		E	Y	K	H	T	L	K	Q	L	I	R	R	R	E	T	T	L	Y	R	E	L	G	M	P	P	L	R	D	E	N	A	V	D	Y	Y	T	L	I	D	L	Q	D	V	T	A	K	L	Y	G	E	A	F	S	E	W	A	V	K	Q	S	S	T	G	D	M	L	F	R	I	A	D	E	T	G	I	V	L	L	.	.
Template Known Secondary structure																			T	T	T	T	T	S						T	T	B			S																																								S					.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.		.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.
Query SS confidence																					.
Query Sequence		G	S	F	L	L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	.	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N	A	A	N
Query Conservation																					.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.								.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	R	G	F	G	S	N	R	P	S	G	R	A	S	L	.	.	A	N	L	N	E	Y	E	Y	A	A	I	G	R	A	L	R	K	M	A	D	E	L	Y	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S		T	T	S							S	.	.	S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template SS confidence
													485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500			.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.