Job Description P0A853 Confidence 99.69% Date Thu Jan 5 11:06:55 GMT 2012 Rank 229 Aligned Residues 354 % Identity 12% Template c2z61A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:probable aspartate aminotransferase 2; PDBTitle: crystal structure of mj0684 from methanococcus jannaschii2 reveals its similarity in the active site to kynurenine3 aminotransferases Resolution 2.20 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		R	I	R	V	I	E	P	V	K	R	T	T	R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	R	G	D	E	A	Y	S	G	S	R	S	Y	Y	A	L	A	E	S	V	K	N	I	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																																										.	.	.	.	.																																			.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.
Template Sequence		R	L	L	N	F	E	S	F	E	V	M	D	I	L	A	L	A	Q	K	L	E	S	E	G	K	K	V	I	H	L	E	I	G	E	P	D	F	N	T	P	.	.	.	.	.	K	P	I	V	D	E	G	I	K	S	L	K	E	G	K	T	H	Y	T	D	S	R	G	I	L	E	L	R	E	K	I	S	E	L	Y
Template Known Secondary structure										T	T													T	T										S		S	S				.	.	.	.	.													T	T			S				T	T
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.						.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
									91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	F	G	Y	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T	G	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	D	K	Y	K	A	D	I	I	P	D	N	I	I	I	T	G	G	S	S	L	G	L	F	F	A	L	S	S	I	I	D	D	G	D	E	V	L	I	Q	N	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	Y	P	C	Y	K	N	F	I	R	F	L	G	A	K	P	V	F	C	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					S	S					G	G	G					S	S															T	T							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T									T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.										.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	Y	D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q	R	E	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																					.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																					.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	F	T	V	E	S	L	E	E	A	L	S	.	.	.	.	.	D	K	T	K	A	I	I	I	N	S	P	S	N	P	L	G	E	V	I	D	.	.	.	.	R	E	I	Y	E	F	A	Y	E	N	I	P	Y	I	I	S	D	E	I	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	S	S										.	.	.	.	.	S	S								S	S		T	T	T						.	.	.	.												S							T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																					.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.						.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.					.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.											.	.
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	C	V	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y
Query Conservation
Alig confidence																																																									.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.
Template Sequence		V	Y	E	G	K	C	Y	S	A	I	E	F	D	E	N	L	E	K	T	I	L	I	N	G	F	S	L	Y	A	M	T	G	W	R	I	G	Y	V	I	S	N	D	E	I	I	E	A	I	L	K	L	Q	Q	N	L	.	.	.	.	.	F	I	S	A	P	T	I	S	Q	Y	A	A	L	K	A	F	E	K	E	T
Template Known Secondary structure		B	S	S	S					G	G	G	T		T	T		S	S													G	G	G																							.	.	.	.	.	T	S	S	S									G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		196	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250						.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.		.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure																																		.
Query SS confidence																																		.
Query Sequence		D	G	M	N	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	V	C	Q	Q	A	.	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G
Query Conservation																																		.
Alig confidence																																		.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	R	E	I	N	S	M	I	K	E	F	D	R	R	R	R	L	V	L	K	Y	V	K	D	F	G	W	E	V	N	N	P	I	G	A	Y	Y	V	F	P	N	I	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	R	E	F	A	Y	K	L	L	K	E	K	F	V	A	L	T	P	G	I	G	F	G	S	K
Template Known Secondary structure																										T	T		B						B	T	T					B		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				G	G	G	G		G	G
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.											.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.
Template Sequence		G	K	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	R	I	S	Y	A	N	.	.	.	S	Y	E	N	I	K	E	G	L	E	R	I	K	E	F	L
Template Known Secondary structure		G	S	S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.
Template SS confidence
		342	.	.	.												.	.	.	.	350	.	.				.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.