Job Description P31600 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:48 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 494 % Identity 11% Template d2ooea1 SCOP info alpha-alpha superhelix TPR-like HAT/Suf repeat Resolution 3.00

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		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Y	I	H	Q	Q	V	P	D	N	I	P	L	T	L	Y	L	A	E	A	Y	R	H	F	G	H	D	D	R	A	R	L	L	L	E	D	Q	L	K	R	H	P	G	D	A	R	L	E	R	S	L	A	A	I	P	V	E	V	K	S	V	T	T	V	E	E	L	L	A	Q	Q	K	A	C	D	A	A	P	T	L
Query Conservation
Alig confidence																					.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	K	K	L	E	E	N	P	Y	D	L	D	A	W	S	I	L	I	R	.	E	A	Q	N	Q	P	I	D	K	A	R	K	T	Y	E	R	L	V	A	Q	F	P	S	S	G	R	F	W	K	L	Y	I	E	A	E	I	K	A	K	N	Y	D	K	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									T	T											.				S	S														T	T		T	T															T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																					.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40		.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	C	R	S	E	V	G	Q	N	A	L	R	L	A	Q	L	P	V	A	R	A	Q	L	N	D	A	T	F	A	A	S	P	E	G	K	T	L	R	T	D	L	L	Q	R	A	I	Y	L	K	Q	W	S	Q	A	D	T	L	Y	N	E	A	R	Q	Q	N	T	L	S	A	A	E	R	R	Q	W	F	D	V	L	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	F	Q	R	C	L	M	K	V	L	H	I	D	L	W	K	C	Y	L	S	Y	V	R	E	T	K	G	K	L	P	S	Y	K	E	K	M	A	Q	A	Y	D	F	A	L	D	K	I	G	M	E	I	M	S	Y	Q	I	W	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	T																		T	T	T	S	T	T																T	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																							86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	Q	L	D	D	R	I	L	A	L	Q	S	Q	G	I	F	T	D	P	Q	S	Y	I	T	Y	A	T	A	L	A	Y	R	G	E	K	A	R	L	Q	H	Y	L	I	E	N	K	P	L	F	T	T	D	A	Q	E	K	S	W	L	Y	L	L	S	K	Y	S	A	N	P	V	Q	A	L	A	N	Y	T	V	Q
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	I	N	F	L	K	G	V	E	A	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Y	A	E	N	Q	R	I	T	A	V	R	R	V	Y	Q	R	G	C	V	N	P	M	I	N	I	E	Q	L	W	R	D	Y	N	K	Y	E	E	G	I	N	I	H	L	A	K	K	M	I	E	D	R
Template Known Secondary structure										S				S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T																T	T	S			T	T																										T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.																.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	A	D	N	R	Q	Y	V	V	G	A	T	L	P	V	L	L	K	E	G	Q	Y	D	A	A	Q	K	L	L	A	T	L	P	A	N	E	M	L	E	E	R	Y	A	V	S	V	A	T	R	N	K	A	E	A	L	R	L	A	R	L	L	Y	Q	Q	E	P	A	N	L	T	R	L	D	Q	L	T	W	Q	L	M
Query Conservation
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	R	D	Y	M	N	A	R	R	V	A	K	E	Y	E	T	V	M	K	G	L	D	R	N	A	P	S	V	P	P	Q	P	Q	E	A	Q	Q	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																								S	S	S															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	N	E	Q	S	R	E	A	A	D	L	L	L	Q	R	Y	P	F	Q	G	D	A	R	V	S	Q	T	L	M	A	R	L	A	S	L	L	E	S	H	P	Y	L	A	T	P	A	K	V	A	I	L	S	K	P	L	P	L	A	E	Q	R	Q	W	Q	S	Q	L	P	G	I	A	D	N	C	P	A	I	V	R	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	M	W	K	K	Y	I	Q	W	E	K	S	N	P	L	R	T	E	D	Q	T	L	I	T	K	R	V	M	F	A	Y	E	Q	C	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	L	G	H	H	P	D	I	W	Y	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.													S	S			S		S																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510			.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.			.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.																																			.	.
Query SS confidence																																										.	.																																			.	.
Query Sequence		L	G	D	M	S	P	S	Y	D	A	A	A	W	N	R	L	A	K	C	Y	R	D	T	L	P	G	V	A	L	Y	A	W	L	Q	A	E	Q	R	Q	P	.	.	S	A	W	Q	H	R	A	V	A	Y	Q	A	Y	Q	V	E	D	Y	A	T	A	L	A	A	W	Q	K	I	S	L	H	D	M	S	.	.	N	E
Query Conservation																																										.	.																																			.	.
Alig confidence																																										.	.																																			.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	Q	Y	L	E	Q	S	S	K	L	L	A	E	K	G	D	M	N	N	A	K	L	F	S	D	E	A	A	N	I	Y	E	R	A	I	S	T	L	L	K	K	N	M	L	L	Y	F	A	Y	A	D	Y	E	E	S	R	M	K	Y	E	K	V	H	S	I	Y	N	R	L	L	A	I	E	D	I	D	P	T	L
Template Known Secondary structure															T	T	T																				T	T	T	T		S	S															T	T															S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
		547	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.		.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.		.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.																								.
Query SS confidence																																												.																								.
Query Sequence		D	L	L	A	A	A	N	T	A	Q	A	A	G	N	G	A	A	R	D	R	W	L	Q	Q	A	E	K	R	G	L	G	S	N	A	L	Y	W	W	L	H	A	Q	.	R	Y	I	P	G	Q	P	E	L	A	L	N	D	L	T	R	S	I	N	I	A	P	S	.	A	N	A	Y	V	A	R	A	T	I	Y	R	Q
Query Conservation																																												.																								.
Alig confidence																																												.																								.
Template Conservation
Template Sequence		V	Y	I	Q	Y	M	K	F	A	R	R	A	E	G	I	K	S	G	R	M	I	F	K	K	A	R	E	D	A	R	T	R	H	H	V	Y	V	T	A	A	L	M	E	Y	Y	C	S	K	D	K	S	V	A	F	K	I	F	E	L	G	L	K	K	Y	G	D	I	P	E	Y	V	L	A	Y	I	D	Y	L	S	H
Template Known Secondary structure																												T		T	T			T														T																		T	T													T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
		625	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.					.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.
Query Sequence		R	H	N	V	P	A	A	V	S	D	L	R	A	A	L	E	L	E	P	N	N	S	N	T	Q	A	A	L	G	Y	A	L	W	D	.	.	.	.	S	G	D	I	A	Q	S	R	E	M	L	E	P	A	H	K	G	L	P	D	D	P	A	L	I	R	Q	L	A	Y	V	N	Q
Query Conservation																																				.	.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	N	E	D	N	N	T	R	V	L	F	E	R	V	L	T	S	G	S	L	P	P	E	K	S	G	E	I	W	A	R	F	L	A	F	E	S	N	I	G	D	L	A	S	I	L	K	V	E	K	R	R	F	T	A	F	R	E	E	Y	E	G	K	E	T	A	L	L	V	D	R
Template Known Secondary structure		T	T															S			S		G	G	G															S	S																T					T	T							G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		457	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.