Job Description P31600 Confidence 98.20% Date Wed Jan 25 15:20:48 GMT 2012 Rank 102 Aligned Residues 434 % Identity 9% Template c2xm6A_ PDB info PDB header:unknown function Chain: A: PDB Molecule:protein corresponding to locus c5321 from cft073 e.coli PDBTitle: crystal structure of the protein corresponding to locus c5321 from2 cft073 e.coli strain Resolution 1.68 Å

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		67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.					.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.					.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.																																			.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.																																			.	.	.	.
Query Sequence		I	R	E	F	E	Y	I	H	Q	Q	V	P	D	N	I	P	L	T	L	Y	L	A	E	A	Y	R	H	.	.	.	.	F	G	H	D	D	R	A	R	L	L	L	E	D	Q	L	K	R	H	P	G	D	A	R	L	E	R	S	L	A	A	I	P	V	E	.	.	.	.	V	K	S	V	T	T	V	E	E	L	L
Query Conservation																													.	.	.	.																																			.	.	.	.
Alig confidence											.	.																	.	.	.	.																		.	.																.	.	.	.
Template Conservation											.	.																																						.	.
Template Sequence		L	E	Q	L	K	Q	K	A	E	.	.	S	G	E	A	K	A	Q	L	E	L	G	Y	R	Y	F	Q	G	N	E	T	T	K	D	L	T	Q	A	M	D	W	F	R	R	A	A	E	Q	.	.	G	Y	T	P	A	E	Y	V	L	G	L	R	Y	M	N	G	E	G	V	P	Q	D	Y	A	Q	A	V	I	W	Y
Template Known Secondary structure											.	.	T	T															T	S	S	S																	T	.	.	T															T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure											.	.																																						.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.			.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.			50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	Q	Q	K	A	C	D	A	A	P	T	L	R	C	R	S	E	V	G	Q	N	A	L	R	L	A	Q	L	P	V	A	R	A	Q	L	N	D	A	T	F	A	A	S	P	E	G	K	T	L	R	T	D	L	L	Q	R	A	I	Y	L	K	Q	W	S	Q	A	D	T	L	Y	N	E	A	R	Q	Q	N	T	L	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	K	A	A	L	K	G	L	P	Q	A	Q	Q	N	L	G	V	M	Y	H	E	G	N	G	V	K	V	D	K	A	E	S	V	K	W	F	R	L	A	A	E	Q	G	R	D	S	G	Q	Q	S	M	G	D	A	Y	F	E	G	D	G	V	T	R	D	Y	V	M	A	R	E	W	Y	S	K	A	A	E	Q	G	N
Template Known Secondary structure							T	T															T	S	S	S																	T	T															T	S	S	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.					.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.
Query Sequence		A	A	E	R	R	Q	W	F	D	V	L	L	A	.	.	.	.	G	Q	L	D	D	R	I	L	A	L	Q	S	Q	G	I	F	T	D	P	Q	S	Y	I	T	Y	A	T	A	L	A	Y	R	G	E	K	A	R	L	Q	H	Y	L	I	E	N	K	P	L	F	T	T	D	A	Q	E	K	S	W	L	Y	L	L	S
Query Conservation															.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	W	S	C	N	Q	L	G	Y	M	Y	S	R	G	L	G	V	E	R	N	D	A	I	S	A	Q	W	Y	R	K	S	A	T	S	G	D	E	L	G	Q	L	H	L	A	D	M	Y	Y	F	G	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															T	S	S	S																	T	T															T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	Y	S	A	N	P	V	Q	A	L	A	N	Y	T	V	Q	F	A	D	N	R	Q	Y	V	V	G	A	T	L	P	V	L	L	K	E	G	Q	Y	D	A	A	Q	K	L	L	A	T	L	P	A	N	E	M	L	E	E	R	Y	A	V	S	V	A	T	R	N	K	A	E	A	L	R	L	A	R	L	L	Y	Q	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	Q	D	Y	T	Q	S	R	V	L	F	S	Q	S	A	E	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	P	A	N	L	T	R	L	D	Q	L	T	W	Q	L	M	Q	N	E	Q	S	R	E	A	A	D	L	L	L	Q	R	Y	P	F	Q	G	D	A	R	V	S	Q	T	L	M	A	R	L	A	S	L	L	E	S	H	P	Y	L	A	T	P	A	K	V	A	I	L	S	K	P	L	P	L	A	E	Q	R	Q	W	Q
Query Conservation
Alig confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	S	I	A	Q	F	R	L	G	Y	I	L	E	Q	G	L	A	G	A	K	E	P	L	K	A	L	E	W	Y	R	K	S	A	E	Q	G	N	S	D	G	Q	Y	Y	L	A	H	L	Y	D	K	G	A	E	G	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T															T	T	T	S	S															T	T	T																B	T	T	B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	Q	L	P	G	I	A	D	N	C	P	A	I	V	R	L	L	G	D	M	S	P	S	Y	D	A	A	A	W	N	R	L	A	K	C	Y	R	D	T	L	P	G	V	A	L	Y	A	W	L	Q	A	E	Q	R	Q	P	S	A	W	Q	H	R	A	V	A	Y	Q	A	Y	Q	V	E	D	Y	A	T	A	L	A	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																																																																								.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																																																								.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	K	N	R	E	Q	A	I	S	W	Y	T	K	S	A	E	Q	G	D	A	T	A	Q	A	N	L	G	A	I	Y	F	R	L	G	S	E	E	E	H	K	K	A	V	E	W	F	R	K	A	A	A	K	G	E	K	A	A	Q	F	N	L	G	N	A	L	L	Q	G	K	G	V	K	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.																T	T															S																			T	T															T	S	S	S		.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																																																								.	.	.	.	.
Template SS confidence
						287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
		535	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.					.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.
Query Sequence		W	Q	K	I	S	L	H	D	M	S	N	E	D	L	L	A	A	A	N	T	A	Q	A	A	G	N	G	A	A	R	D	R	W	L	Q	Q	A	E	K	R	G	L	G	S	N	A	L	Y	W	W	L	H	A	Q	R	Y	I	.	.	.	.	P	G	Q	P	E	L	A	L	N	D	L	T	R	S	I	N	I	A	P
Query Conservation																																																											.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.															.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	D	E	Q	Q	A	A	I	W	M	R	K	A	A	E	Q	G	.	.	L	S	A	A	Q	V	Q	L	G	E	I	Y	Y	Y	G	L	G	V	E	R	D	Y	V	Q	A	W	A	W	F	D	T	A	S	T	N	D	M
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																T	T	.	.															T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template SS confidence
																										358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.			.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
		611	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.			.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.
Predicted Secondary structure													.	.
Query SS confidence													.	.
Query Sequence		S	A	N	A	Y	V	A	R	A	T	I	.	.	Y	R	Q	R	H	N	V	P	A	A	V	S	D	L	R	A	A	L	E	L	E	P	N	N	S	N	T	Q	A	A	L
Query Conservation													.	.
Alig confidence													.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	L	F	G	T	E	N	R	N	I	T	E	K	K	L	T	A	K	Q	L	Q	Q	A	E	L	L	S	Q	Q	Y	I	E	K	Y	A	P	E	A	W	A	R	M	Q	K
Template Known Secondary structure														T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.