Job Description P31600 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:48 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 465 % Identity 12% Template c2gw1A_ PDB info PDB header:protein transport Chain: A: PDB Molecule:mitochondrial precursor proteins import receptor; PDBTitle: crystal structure of the yeast tom70 Resolution 3.00 Å

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		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	C	R	S	E	V	G	Q	N	A	L	R	L	A	Q	L	P	V	A	R	A	Q	L	N	D	A	T	F	A	A	S	P	E	G	K	T	L	R	T	D	L	L	Q	R	A	I	Y	L	K	Q	W	S	Q	A	D	T	L	Y	N	E	A	R	Q	Q	N	T	L	S	A	A	E	R	R	Q	W	F	D	V	L
Query Conservation
Alig confidence																						.													.
Template Conservation																						.													.
Template Sequence		A	L	A	L	K	D	K	G	N	Q	F	F	R	N	K	K	Y	D	D	A	.	I	K	Y	Y	N	W	A	L	E	L	K	E	.	D	P	V	F	Y	S	N	L	S	A	C	Y	V	S	V	G	D	L	K	K	V	V	E	M	S	T	K	A	L	E	L	K	P	D	Y	S	K	V	L	L	R	R	A	S	A	N
Template Known Secondary structure															T	S						.													.																T																	S
Template Predicted Secondary structure																						.													.
Template SS confidence
		99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.		.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130		.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	G	Q	L	D	D	R	I	L	A	L	Q	S	Q	G	I	F	T	D	P	Q	S	Y	I	T	Y	A	T	A	L	A	Y	R	G	E	K	A	R	L	Q	H	Y	L	I	E	N	K	P	L	F	T	T	D	A	Q	E	K	S	W	L	Y	L	L	S	K	Y	S	A	N	P	V	Q	A	L	A	N	Y	T	V
Query Conservation
Alig confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	G	L	G	K	F	A	D	A	M	F	D	L	S	V	L	S	L	N	G	D	F	N	D	A	S	I	E	P	M	L	E	R	N	L	N	K	Q	A	M	S	K	L	K	E	K	N	L	P	S	V	T	S	M	A	S	F	F	G	I	F	K	P	E	L	T	F	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T															S	S	S			G	G	G	T																	T	T														T	T	S							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	F	A	D	N	R	Q	Y	V	V	G	A	T	L	P	V	L	L	K	E	G	Q	Y	D	A	A	Q	K	L	L	A	T	L	P	A	N	E	M	L	E	E	R	Y	A	V	S	V	A	T	R	N	K	A	E	A	L	R	L	A	R	L	L	Y	Q	Q	E	P	A	N	L	T	R	L	D	Q	L	T	W	Q	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	E	S	N	E	A	D	K	E	L	M	N	G	L	S	N	L	Y	K	R	S	P	E	S	Y	D	K	A	D	E	S	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S															S	S			T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																	273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	Q	N	E	Q	S	R	E	A	A	D	L	L	L	Q	R	Y	P	F	Q	G	D	A	R	V	S	Q	T	L	M	A	R	L	A	S	L	L	E	S	H	P	Y	L	A	T	P	A	K	V	A	I	L	S	K	P	L	P	L	A	E	Q	R	Q	W	Q	S	Q	L	P	G	I	A	D	N	C	P	A	I	V	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	T	K	A	A	R	L	F	E	E	Q	L	D	K	N	N	E	D	E	K	L	K	E	K	L	A	I	S	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	T	G	I	F	K	F	L	K	N	D	P	L	G	A	H	E	D	I	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.											T	T	T	S	T	T														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.		.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.		.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.																															.
Query SS confidence																																															.																															.
Query Sequence		L	L	G	D	M	S	P	S	Y	D	A	A	A	W	N	R	L	A	K	C	Y	R	D	T	L	P	G	V	A	L	Y	A	W	L	Q	A	E	Q	R	Q	P	S	A	W	Q	.	H	R	A	V	A	Y	Q	A	Y	Q	V	E	D	Y	A	T	A	L	A	A	W	Q	K	I	S	L	H	D	M	S	.	N	E	D
Query Conservation																																															.																															.
Alig confidence										.																																					.																															.
Template Conservation										.
Template Sequence		K	A	I	E	L	F	P	R	.	V	N	S	Y	I	Y	M	A	L	I	M	A	D	R	N	D	S	T	E	Y	Y	N	Y	F	D	K	A	L	K	L	D	S	N	N	S	S	V	Y	Y	H	R	G	Q	M	N	F	I	L	Q	N	Y	D	Q	A	G	K	D	F	D	K	A	K	E	L	D	P	E	N	I	F	P
Template Known Secondary structure										.													T	S	S			T	T	G	G	G							T	T		T	T		T													T	T		T	T												T		S	S		S
Template Predicted Secondary structure										.
Template SS confidence
		355	.	.	.	.	360	.	.		.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
		548	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.											.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	A	A	A	N	T	A	Q	A	A	G	N	G	A	A	R	D	R	W	L	Q	Q	A	E	K	R	G	L	G	S	N	A	L	Y	W	W	L	H	A	Q	R	Y	I	P	G	Q	P	E	L	A	L	N	D	L	T	R	S	I	N	I	A	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	A	Y	V	A
Query Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	I	Q	L	A	C	L	A	Y	R	E	N	K	F	D	D	C	E	T	L	F	S	E	A	K	R	K	F	P	E	A	P	E	V	P	N	F	F	A	E	I	L	T	D	K	N	D	F	D	K	A	L	K	Q	Y	D	L	A	I	E	L	E	N	K	L	D	G	I	Y	V	G	I	A	P	L	V	G	K	A	T
Template Known Secondary structure									T	T	T	T	T																S	T	T		S													T	T																		T	S	S	S		S	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.
		618	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.						.	.	.	.	.	.	.	690	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.	.	.
Query Sequence		R	A	T	I	Y	R	Q	R	H	N	V	P	A	A	V	S	D	L	R	A	A	L	E	L	E	P	N	N	S	N	T	Q	A	A	L	G	Y	A	L	W	D	S	G	D	I	A	Q	S	R	E	M	L	E	P	A	H	K	G	L	P	D	D	P	A	L	.	.	.	.	.	I	R	Q	L	A	Y	V	N	Q	R
Query Conservation																																																																			.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																			.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	T	R	N	P	T	V	E	N	F	I	E	A	T	N	L	L	E	K	A	S	K	L	D	P	R	S	E	Q	A	K	I	G	L	A	Q	M	K	L	Q	Q	E	D	I	D	E	A	I	T	L	F	E	E	S	A	D	L	A	R	T	M	E	E	K	L	Q	A	I	T	F	A	E	A	A	K	V	Q	Q	R
Template Known Secondary structure					T	S			T	T																	T	T															T	T																	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		514	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.
		693	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	D	M	P	A	T	Q	H	Y	A	R	L	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	R	S	D	P	V	L	A	K	K	I	Q	E	T
Template Known Secondary structure			T	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		594	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.