Job Description P08201 Confidence 99.90% Date Thu Jan 5 11:00:55 GMT 2012 Rank 100 Aligned Residues 289 % Identity 22% Template c3gwdA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:cyclohexanone monooxygenase; PDBTitle: closed crystal structure of cyclohexanone monooxygenase Resolution 2.30 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	50	.	.	.	.					.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.
Query Sequence		S	K	V	R	L	A	I	I	G	N	G	M	V	G	H	R	F	I	E	D	L	L	D	K	S	D	A	A	N	F	D	I	T	V	F	C	E	E	P	R	I	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	V	H	L	S	S	Y	F	S	.	.	.	.	H
Query Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.
Template Sequence		H	T	V	D	A	V	V	I	G	A	G	F	G	G	I	Y	A	V	H	K	L	H	H	E	L	.	.	.	G	L	T	T	V	G	F	D	K	A	D	G	P	G	G	T	W	Y	W	N	R	Y	P	G	A	L	S	D	T	E	S	H	L	Y	R	F	S	F	D	R	D	L	L	Q	E	S	T	W	K	T	T	Y
Template Known Secondary structure												S													T	S	.	.	.									S	S	S	S	S		T								T	T							T	T	T	S	S			S											S	B	S
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.				.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
		56	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.			.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90					.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110			.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.																.	.	.	.																					.	.
Query SS confidence																						.	.																.	.	.	.																					.	.
Query Sequence		H	T	A	E	E	L	S	L	V	R	E	G	F	Y	E	K	H	G	I	K	.	.	V	L	V	G	E	R	A	I	T	I	N	R	Q	E	K	.	.	.	.	V	I	H	S	S	A	G	R	T	V	F	Y	D	K	L	I	M	A	T	G	.	.	S	Y	P	W	I	P	P	I	K	G	S	D	T	Q	D	C	F
Query Conservation																						.	.																.	.	.	.																					.	.
Alig confidence																						.	.																.	.	.	.																					.	.														.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.
Template Sequence		I	T	Q	P	E	I	L	E	Y	L	E	D	V	V	D	R	F	D	L	R	R	H	F	K	F	G	T	E	V	T	S	A	L	Y	L	D	D	E	N	L	W	E	V	T	T	D	H	G	E	V	Y	R	A	K	Y	V	V	N	A	V	G	L	L	S	A	I	N	F	P	N	L	P	G	L	D	T	.	.	.	F
Template Known Secondary structure																		T	T		G	G	G			T	T										T	T	T	T							T	T	S														S	S		S	B						T	T	G	G	G	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.				160
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	Y	R	T	I	E	D	L	N	A	I	E	S	C	A	R	R	S	K	R	G	A	V	V	G	G	G	L	L	G	L	E	A	A	G	A	L	K	N	L	G	I	E	T	H	V	I	E	F	A	P	M	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	G	E	T	I	H	T	A	A	W	P	E	G	K	S	L	A	G	R	R	V	G	V	I	G	T	G	S	T	G	Q	Q	V	I	T	S	L	A	P	E	V	E	H	L	T	V	F	V	R	T	P	Q	Y	S	V	P	V	G	N	R	P	V	N	P	E	Q	I	A	E	I	K	A	D	Y	D	R	I	W	E	R
Template Known Secondary structure			S					G	G	G			T	T				T	T	S								S														S	S							S	S											B												T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
																																																181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	A	E	Q	L	D	Q	M	G	G	E	Q	L	R	R	K	I	E	S	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	K	N	S	A	V	A	F	G	F	E	E	S	T	L	P	A	M	S	V	S	E	E	E	R	N	R	I	F	Q	E	A	W	D	H	G	G	G	F	R	F	M	F	G	T	F	G	D	I	A	T	D	E	A	A	N	E	A	A	A	S	F	I	R	A	K	V	A	E	I	I	E	D	P	E	T	A	R	K	L
Template Known Secondary structure				T	S	S	S		S	S	S							S	T	T	S																								S	S		S		T	T	T																						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
																									201	.	.	.	.	.			.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	R	V	H	T	.	.	S	K	N	T	L	E	I	V	Q	E	G	V	E	A	R	K	T	M	R	F	A	D	G	S	E	L	E	V	D	F	I	V	F	S	T	G	I	R	P	R	D	K	L	A	T	Q	C	G	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.											.	.	.	.	.	.																															.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.																															.	.
Template Sequence		M	P	K	G	L	F	A	K	R	P	L	C	D	S	G	Y	Y	E	V	Y	N	R	P	N	V	E	A	V	A	I	K	E	N	P	I	R	E	V	T	A	K	.	.	.	.	.	.	G	V	V	T	E	D	G	V	L	H	E	L	D	V	L	V	F	A	T	G	F	D	A	V	D	G	N	Y	R	R	.	.	I
Template Known Secondary structure					S		S		S	S					S	S	T	G	G	G	G	G	S	T	T						T	T	T	S							T	T	.	.	.	.	.	.					T	T	S						S								B			S	S					T	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.																															.	.
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.							.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.			.
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.									.	.	270	.				.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.
Query Sequence		D	V	A	P	R	G	G	I	V	I	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	S	C	Q	T	.	.	.	S	D	P	D	I	Y	A	I	G	E	C	A	S	W	N	N	R	V	F	G	L	V	A	P	G	Y	K	M	A	Q	V	A	V	D	H	I
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.										.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.
Template Sequence		E	I	R	G	R	D	G	L	H	I	N	D	H	W	D	G	Q	P	T	S	Y	L	G	V	S	T	A	N	F	P	N	W	F	M	V	L	.	.	.	G	P	N	G	P	F	T	N	L	P	P	S	I	E	T	Q	V	E	W	I	S	D	T	I
Template Known Secondary structure						G	G	G		B					T	S	S	S				B	T	T	T	B		T	T		T	T				S	S	.	.	.		S	S				S	S
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.
Template SS confidence
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.				.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.