Job Description P08201 Confidence 99.76% Date Thu Jan 5 11:00:55 GMT 2012 Rank 111 Aligned Residues 396 % Identity 12% Template c3da1A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:glycerol-3-phosphate dehydrogenase; PDBTitle: x-ray structure of the glycerol-3-phosphate dehydrogenase2 from bacillus halodurans complexed with fad. northeast3 structural genomics consortium target bhr167. Resolution 2.70 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	K	V	R	L	A	I	I	G	N	G	M	V	G	H	R	F	I	E	D	L	L	D	K	S	D	A	A	N	F	D	I	T	V	F	C	E	E	P	R	I	A	Y	D	R	V	H	L	S	S	Y	F	S	H	H	T	A	E	E	L	S	L	V	R	E	G	F	Y	E	K	H	G	I	K	V	L	V	G	E	R
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.															.	.	.	.
Template Sequence		K	Q	L	D	L	L	V	I	G	G	G	I	T	G	A	G	I	A	L	D	A	Q	V	R	G	.	.	.	.	I	Q	T	G	L	V	E	X	N	D	F	A	S	G	.	.	.	.	T	S	S	R	S	T	K	L	V	H	G	V	G	K	E	R	A	I	V	Y	E	N	A	P	H	V	T	T	P	E	W	X	L
Template Known Secondary structure		S										S												T	T	T	.	.	.	.								S	S	S	T	T		S	.	.	.	.	G	G	G	S	S																			T	T	T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.															.	.	.	.
Template SS confidence
		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.					.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.					.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	I	T	I	N	R	Q	E	K	V	I	H	S	S	A	G	R	T	V	F	Y	D	K	L	I	M	A	T	G	S	Y	P	W	I	P	P	I	K	G	S	D	T	Q	D	C	F	V	Y	R	T	I	E	D	L	N	A	I	E	S	C	A	R	R	S	K	R	G	A	V	V	G	G	G	L	L	G	L	E	A	A
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	P	I	F	K	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	X	L	N	E	K	Q	T	L	E	K	E	P	L	L	R	K	E	N	L	K	G	G	G	I	Y	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T	T	S			T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		104	.	.	.	.	.																	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230						.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.
Query Sequence		G	A	L	K	N	L	G	I	E	T	H	V	I	E	F	A	P	M	L	M	A	E	Q	L	D	Q	M	G	G	E	Q	L	R	R	K	I	E	S	M	G	V	R	V	H	T	S	K	N	T	L	E	I	V	Q	E	G	V	E	A	R	K	T	M	R	F	A	D	G	S	.	.	.	.	.	E	L	E	V	D	F
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.														.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	R	T	D	D	A	R	L	T	L	E	I	X	K	E	A	V	A	R	G	A	V	A	L	N	Y	X	K	V	E	S	F	I	Y	D	.	Q	G	K	V	V	G	V	V	A	K	D	R	L	T	D	T	T	H	T	I	Y	A	K	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			T	T						S										.	T	T										T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template SS confidence
																						165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.					.	.	.	260	.	.			.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.							.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.							.	.
Query Sequence		I	V	F	S	T	G	I	R	P	R	D	K	L	A	T	Q	C	G	L	D	.	.	.	.	V	A	P	R	G	G	.	.	I	V	I	N	D	S	C	Q	T	S	D	P	D	I	Y	A	I	G	E	C	A	S	W	N	N	R	V	F	G	L	V	A	P	G	Y	K	M	A	Q	V	A	V	D	H	I	L	G	S
Query Conservation																						.	.	.	.							.	.
Alig confidence											.											.	.	.	.							.	.																	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.																																							.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	V	N	A	A	G	P	W	V	.	D	T	L	R	E	K	D	R	S	K	H	G	K	Y	L	K	L	S	K	G	V	H	L	V	V	D	Q	S	R	F	P	L	R	Q	A	V	Y	F	.	.	.	D	T	E	S	D	G	R	X	I	F	A	I	P	R	E	.	.	.	.	.	.	.	G	K	T	Y	I	G	T
Template Known Secondary structure							G	G	G		.						T	T	T				S	S														G	G	G	S			S	S					.	.	.			S	S	S										T	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure											.																																							.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		224	.	.	.	.	.	230	.	.		.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270				.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.								.	.	.	.	290	.	.
			311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.			330	.	.	.	.	.	.	.	.	.			340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure		.																				.	.											.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																				.	.											.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	E	N	A	F	E	G	A	D	L	S	A	K	L	K	L	L	G	V	D	.	.	V	G	G	I	G	D	A	H	G	R	.	.	T	P	G	A	R	S	Y	V	Y	L	D	E	S	K	E	I	Y	K	R	L	I	V	S	E	D	N	K	T	L	L	G	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.																				.	.											.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																				.	.											.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	D	T	F	Y	D	K	D	I	A	S	P	R	X	T	V	E	D	R	D	Y	I	L	A	A	A	N	Y	X	F	P	S	L	R	L	T	A	D	D	V	E	S	S	W	A	G	L	R	P	L	I	H	E	D	E	I	F	F	S	D	S	G	L	I	S	I	A	G	G	K	L	T	G	Y	R	K	X	A	E	R
Template Known Secondary structure								S		T	T																					T	T					T	T	T																					S	S										S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
																															373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	G	D	T	S	D	Y	G	N	L	L	Q	L	V	L	N	A	I	E	L	P	E	N	P	D	S	L	I	L	P	A	H	S	G	S	G	K	P	S	I	G	V	D	K	L	P	D	S	A	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	V	D	A	V	A	Q	G	L	N	V	N	E	P	C	T	T	A	A	I	R	L	S	G	G	L	A	E	G	A	Q	G	F	P	R	F	L	D	E	A	S	R	K	G	A	K	L	G	F	D	A	D	E	V	R	R	L	A	K	L	Y	G	S	N	V	D	H	V	L	N	Y	A	Y	E	G	K	E	E	A	E
Template Known Secondary structure											T							T	T	S				T	T			T	T		S	T	T														T	T	T														G	G	G											T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
		424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.			.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.		.	.		.	460	.			.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.																.			.				.	.
Query SS confidence																				.	.																.			.				.	.
Query Sequence		I	C	S	C	F	D	V	T	K	G	D	L	I	A	A	I	N	K	.	.	G	C	H	T	V	A	A	L	K	A	E	T	K	A	G	.	T	G	.	C	G	G	.	.	C	I	P	L	V	T	Q	V	L	N	A	E	L	A	K	Q	G	I	E	V	N	N
Query Conservation																				.	.																.			.				.	.
Alig confidence																				.	.																.			.				.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	Y	G	L	P	A	L	L	L	G	Q	L	Q	Y	G	V	E	Q	E	X	V	A	T	P	L	D	F	F	V	R	R	T	G	A	L	F	F	N	I	S	L	V	H	Q	W	K	E	A	V	L	R	W	X	A	E	E	F	S	W	T	E	E	E	K	T	R
Template Known Secondary structure			T	T	S															S				S							T	T	S																									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		464	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.