Job Description P08201 Confidence 99.79% Date Thu Jan 5 11:00:55 GMT 2012 Rank 108 Aligned Residues 419 % Identity 13% Template c2rghA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:alpha-glycerophosphate oxidase; PDBTitle: structure of alpha-glycerophosphate oxidase from2 streptococcus sp.: a template for the mitochondrial alpha-3 glycerophosphate dehydrogenase Resolution 2.30 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.										.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	K	V	R	L	A	I	I	G	N	G	M	V	G	H	R	F	I	E	D	L	L	D	K	S	D	A	A	N	F	D	I	T	V	F	C	E	E	P	R	I	A	Y	D	R	V	H	L	S	S	Y	F	S	H	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	E	E	L	S	L	V	R	E	G	F	Y	E	K	H
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.
Template Sequence		E	E	L	D	L	L	I	I	G	G	G	I	T	G	A	G	V	A	V	Q	A	A	A	S	G	.	.	.	.	I	K	T	G	L	I	E	X	Q	D	F	A	E	G	T	S	S	R	S	T	K	L	V	H	G	G	I	R	Y	L	K	T	F	D	V	E	V	V	A	D	T	V	G	E	R	A	V	V	Q	G	I
Template Known Secondary structure		S		B	S							S													T	T	.	.	.	.								S	S	S	T	T		S	G	G	G	S	S		S						G	G	G	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.
Template SS confidence
		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.					.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
		73	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	I	K	V	L	V	G	E	R	A	I	T	I	N	R	Q	E	K	V	I	H	S	S	A	G	R	T	V	F	Y	D	K	L	I	M	A	T	G	S	Y	P	W	I	P	P	I	K	G	S	D	T	Q	D	C	F	V	Y	R	T	I	E	D	L	N	A	I	E	S	C	A	R	R	S	K	R	G	A	V	V	G
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	P	H	I	P	K	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	X	L	L	P	I	Y	E	D	E	G	A	T	T	F	N	X	F	S	V	K	V	A	X	D	L	Y	D	K	L	A	N	V	T	G	T	K	Y	E	N
Template Known Secondary structure			T	T	S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	S	S	S	S		S																		T		S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.			.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.																																																							.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.																																																							.	.	.	.
Query Sequence		G	G	L	L	G	L	E	A	A	G	A	L	K	N	L	G	I	E	T	H	.	.	V	I	E	F	A	P	M	L	M	A	E	Q	L	D	Q	M	G	G	E	Q	L	R	R	K	I	E	S	M	G	V	R	V	H	T	S	K	N	T	L	E	I	V	Q	E	G	V	E	A	R	K	T	M	R	F	.	.	.	.
Query Conservation																						.	.																																																							.	.	.	.
Alig confidence																						.	.											.	.	.																																.										.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.																																.
Template Sequence		Y	T	L	T	P	E	E	V	L	E	R	E	P	F	L	K	K	E	G	L	K	G	A	G	V	Y	L	D	F	R	N	N	.	.	.	D	A	R	L	V	I	D	N	I	K	K	A	A	E	D	G	A	Y	L	V	S	K	X	K	A	V	G	F	L	Y	E	.	G	D	Q	I	V	G	V	K	A	R	D	L	L
Template Known Secondary structure														T	T	S			T	T														.	.	.															T	T					S	S										.	T	T										T	T
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.																																.
Template SS confidence
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.				.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.		.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
			227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.						.	.	.	.	.	260	.	.			.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																													.	.	.	.	.									.	.
Query SS confidence		.																													.	.	.	.	.									.	.
Query Sequence		.	A	D	G	S	E	L	E	V	D	F	I	V	F	S	T	G	I	R	P	R	D	K	L	A	T	Q	C	G	.	.	.	.	.	L	D	V	A	P	R	G	G	.	.	I	V	I	N	D	S	C	Q	T	S	D	P	D	I	Y	A	I	G	E	C	A	S	W	N	N	R	V	F	G	L	V	A	P	G	Y	K
Query Conservation		.																													.	.	.	.	.									.	.
Alig confidence		.																				.									.	.	.	.	.									.	.																.	.																		.	.
Template Conservation																						.																																							.	.																		.	.
Template Sequence		T	D	E	V	I	E	I	K	A	K	L	V	I	N	T	S	G	P	W	V	.	D	K	V	R	N	L	N	F	T	R	P	V	S	P	K	X	R	P	T	K	G	I	H	L	V	V	D	A	K	K	L	P	V	P	Q	P	T	Y	.	.	F	D	T	G	K	Q	D	G	R	X	V	F	A	I	P	R	E	.	.
Template Known Secondary structure		T								B	S							G	G	G		.					T	T			S	S						B												G	G	G	S			S	S				.	.				S	S	S	S	S									T	.	.
Template Predicted Secondary structure																						.																																							.	.																		.	.
Template SS confidence
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.		.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.			.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310		.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	A	Q	V	A	V	D	H	I	L	G	S	.	E	N	A	F	E	G	A	D	L	S	A	K	L	K	L	L	G	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	G	I	G	D	A	H	G	R	T	P	G	A	R	S	Y	V	Y	L	D	E	S	K	E	I	Y	K
Query Conservation														.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.								.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																																																																								.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	N	K	T	Y	F	G	T	T	D	T	D	Y	Q	G	D	F	T	D	P	K	V	T	Q	E	D	V	D	Y	L	L	D	V	I	N	H	R	Y	P	E	A	N	I	T	L	A	D	I	E	A	S	W	A	G	L	R	P	L	L	I	G	S	S	L	E	R	E	P	D	G	L	L	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	T													S		S	S	S																			S	T	T	T				G	G	G												B									T	T	S			.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																																																								.	.	.	.
Template SS confidence
							292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.																																									.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	L	I	V	S	E	D	N	K	T	L	L	G	A	V	L	V	G	D	T	S	D	Y	G	N	L	L	Q	L	V	L	N	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	P	E	N	P
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	S	G	G	K	I	T	D	Y	R	K	X	A	E	G	A	L	R	L	I	R	Q	L	L	K	E	E	Y	G	I	E	T	K	E	I	D	S	K	K	Y	Q	I	S	G	G	N	F	D	P	T	K	L	E	E	T	V	T	E	L	A	K	E	G	V	A	A	G	L	E	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.							G	G	G																													T	T	T				T	T			S		T	T																T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.			.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.		.		.	460	.			.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure																																														.	.																	.		.				.	.
Query SS confidence																																														.	.																	.		.				.	.
Query Sequence		D	S	L	I	L	P	A	H	S	G	S	G	K	P	S	I	G	V	D	K	L	P	D	S	A	Q	I	C	S	C	F	D	V	T	K	G	D	L	I	A	A	I	N	K	.	.	G	C	H	T	V	A	A	L	K	A	E	T	K	A	G	T	.	G	.	C	G	G	.	.	C	I	P	L	V	T	Q	V	L	N
Query Conservation																																														.	.																	.		.				.	.
Alig confidence																																														.	.																	.		.				.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	D	A	T	Y	I	A	D	F	Y	G	T	N	A	R	R	I	F	E	L	A	K	E	X	A	P	Y	P	G	L	S	L	A	E	S	A	R	L	R	Y	G	L	E	E	E	X	V	L	A	P	G	D	Y	L	I	R	R	T	N	H	L	L	F	E	R	D	Q	L	D	E	I	K	Q	P	V	I	D	A	I	A
Template Known Secondary structure												G	G	G										T					T	T	S															S				S							T	T	S	S						G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	L	A	K	Q	G	I	E	V	N	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	Y	F	G	W	T	E	E	E	K	A	Q
Template Known Secondary structure					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		575	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.