Job Description P08201 Confidence 99.64% Date Thu Jan 5 11:00:55 GMT 2012 Rank 124 Aligned Residues 398 % Identity 14% Template c2r4jA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase; PDBTitle: crystal structure of escherichia coli semet substituted2 glycerol-3-phosphate dehydrogenase in complex with dhap Resolution 1.96 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	S	K	V	R	L	A	I	I	G	N	G	M	V	G	H	R	F	I	E	D	L	L	D	K	S	D	A	A	N	F	D	I	T	V	F	C	E	E	P	R	I	A	Y	D	R	V	H	L	S	S	Y	F	S	H	H	T	A	E	E	L	S	L	V	R	E	G	F	Y	E	K	H	G	I	K	V	L	V	G	E
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	E	T	K	D	L	I	V	I	G	G	G	I	N	G	A	G	I	A	A	D	A	A	G	R	G	.	.	.	.	L	S	V	L	X	L	E	A	Q	D	L	A	C	A	T	S	S	A	S	S	K	L	I	H	G	G	L	R	Y	L	E	H	Y	E	F	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													S												T	T	T	.	.	.	.								S	S	S	T	T		S	G	G	G	S	S								G	G	G	G	G	G	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.					.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.									.
Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	A	I	T	I	N	R	Q	E	K	V	I	H	S	S	A	G	R	T	V	F	Y	D	K	L	I	M	A	T	G	S	Y	P	W	I	P	P	I	K	G	S	D	T	Q	D	C	F	V	Y	R	T	I	E	D	L	N	A	I	E	S	C	A	R	R	S	K	R	G	A	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Query Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	S	E	A	L	A	E	R	E	V	L	L	K	X	A	P	H	I	A	F	P	X	R	F	R	L	P	H	R	P	H	L	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T	T												T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.							170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.													.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	L	L	G	L	E	A	A	G	A	L	K	N	L	G	I	.	.	.	.	.	.	E	T	H	V	I	E	F	A	P	M	L	M	A	E	Q	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	M	G	G	E	Q	L	R	R	K	I	E	S	M	G	V	R	V	H	T	S	K	N	T	L	E	I	V
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	A	W	M	I	R	I	G	L	F	M	Y	D	H	L	G	K	R	T	S	L	P	G	S	T	G	L	R	F	G	A	N	S	V	L	K	P	E	I	K	R	G	F	E	Y	S	D	C	W	V	D	D	A	R	L	V	L	A	N	A	Q	X	V	V	R	K	G	G	E	V	L	T	R	T	R	A	T	S	A	R
Template Known Secondary structure																S	S			S	S	S										T	T	S	S	B		T	T																												T	T						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.				.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.						.	.	.	.	.	.	260	.	.			.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.																												.	.	.	.	.										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.																												.	.	.	.	.										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	E	G	V	E	A	R	K	T	M	R	F	.	.	.	A	D	G	S	E	L	E	V	D	F	I	V	F	S	T	G	I	R	P	R	D	K	L	A	T	Q	C	.	.	.	.	.	G	L	D	V	A	P	R	G	G	.	.	I	V	I	N	D	S	C	Q	T	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation														.	.	.																												.	.	.	.	.										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.																				.								.	.	.	.	.										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.
Template Sequence		R	E	N	G	L	W	I	V	E	A	E	D	I	D	T	G	K	K	Y	S	W	Q	A	R	G	L	V	N	A	T	G	P	W	V	.	K	Q	F	F	D	D	G	X	H	L	P	S	P	Y	G	I	R	L	I	K	G	S	H	I	V	V	P	R	V	H	T	Q	K	Q	A	Y	I	L	Q	N	E	D	K	R	I
Template Known Secondary structure				T	T									T	T	T																G	G	G		.							T	T					S	S															S		S		S								T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																				.
Template SS confidence
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210		.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
									274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.		.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.															.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.															.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	P	D	I	Y	A	I	G	E	C	A	S	W	N	N	.	R	V	F	G	L	V	A	P	G	Y	K	M	A	Q	V	A	V	D	H	I	L	G	S	E	N	A	F	E	G	A	D	L	S	A	K	L	K	L	L	G	V	D	V	G	G	I	G	D	A	H	G	R	T	P	G	A	R	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.															.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation
Template Sequence		V	F	V	I	P	W	X	D	E	F	S	I	I	G	T	T	D	V	E	Y	K	G	D	P	K	A	V	K	I	E	E	S	E	I	N	Y	L	L	N	V	Y	N	T	H	F	K	K	Q	L	S	R	D	D	I	V	W	T	Y	S	G	V	R	P	L	C	D	D	E	S	D	S	P	Q	A	I	T	R	D	Y	T
Template Known Secondary structure								T	T	T													S		G	G	G																	T	T	B	S	S				G	G	G																	S	S	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.										.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	V	Y	L	D	E	S	K	E	I	Y	K	R	L	I	V	S	E	D	N	K	T	L	L	G	A	V	L	V	G	D	T	S	D	Y	G	N	L	L	Q	L	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	N	A	I	E	L	P	E	N	P	D	S	L	I	L	P	A	H	S	G	S	G	K	P	S	I	G	V	D
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	I	H	D	E	N	G	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	L	S	V	F	G	G	K	L	T	T	Y	R	K	L	A	E	H	A	L	E	K	L	T	P	Y	Y	Q	G	I	G	P	A	W	T	K	E	S	V	L	P	G	G	A	I	E	G	D	R	D	D	Y	A	A	R	L	R	R
Template Known Secondary structure							S	S	S		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										S	T	T													G	G	G		S	S						G	G	G				T	T				S	S		S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		336	.	.	.	340	.	.	.	.	.												.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
		417	.	.														420	.					.	.	.	.	.	.	.	.												430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.		.	.	.	.	.		.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.		.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.						.																.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.						.																.
Query Sequence		K	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	.	.	.	.	A	Q	I	C	S	C	F	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	K	G	D	L	I	A	A	I	N	K	.	G	C	H	T	V	.	A	A	L	K	A	E	T	K	A	G	T	G	C	G	G	.	C	I	P	L
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.						.																.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.						.																.
Template Conservation
Template Sequence		R	Y	P	F	L	T	E	S	L	A	R	H	Y	A	R	T	Y	G	S	N	S	E	L	L	L	G	N	A	G	T	V	S	D	L	G	E	D	F	G	H	E	F	Y	E	A	E	L	K	Y	L	V	D	H	E	W	V	R	R	A	D	D	A	L	W	R	R	T	K	Q	G	X	W	L	N	A	D	Q	Q	S	R
Template Known Secondary structure			S	T	T	S												T	G	G	G						T	T			S	G	G	G	G			B		S	T	T		B											S				S							T	S			G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
		466	.	.	.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	T	Q	V	L	N	A	E	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	S	Q	W	L	V	E	Y	T
Template Known Secondary structure										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		485	.	.	.	.	490	.	.	.