Job Description P08201 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:55 GMT 2012 Rank 27 Aligned Residues 352 % Identity 23% Template c1y56A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:hypothetical protein ph1363; PDBTitle: crystal structure of l-proline dehydrogenase from p.horikoshii Resolution 2.86 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.		.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.
Query SS confidence																																																						.
Query Sequence		R	L	A	I	I	G	N	G	M	V	G	H	R	F	I	E	D	L	L	D	K	S	D	A	A	N	F	D	I	T	V	F	C	E	E	P	R	I	A	Y	D	R	V	H	L	S	S	Y	F	S	H	H	.	T	A	E	E	L	S	L	V	R	E	G	F	Y	E	K	H	G	I	K	V	L	V	G	E	R	A	I
Query Conservation																																																						.
Alig confidence																							.	.	.	.	.																											.
Template Conservation																							.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	A	I	I	G	G	G	P	A	G	I	G	A	A	L	E	L	Q	Q	Y	.	.	.	.	.	L	T	V	A	L	I	E	E	R	G	W	L	G	G	D	M	W	L	K	G	I	K	Q	E	G	F	N	K	D	S	R	K	V	V	E	E	L	V	G	K	L	N	E	N	T	K	I	Y	L	E	T	S	A	L
Template Known Secondary structure		S							S											T	T	T	.	.	.	.	.								T	T	S	S	S	S		S	G	G	G	T		S			T	T	T	T													T			T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		108	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.						.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.						.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.
Query Sequence		T	I	N	R	Q	E	K	V	I	H	S	.	.	.	.	.	S	A	G	R	T	V	F	Y	D	K	L	I	M	A	T	G	S	Y	P	W	I	P	P	I	K	G	S	D	T	Q	D	C	F	V	Y	R	T	I	E	D	L	N	A	I	E	S	C	A	R	R	S	K	R	G	A	V	V	G	G	G	L	L	G	L
Query Conservation													.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.																																												.
Template Conservation																																																													.
Template Sequence		G	V	F	D	K	G	E	Y	F	L	V	P	V	V	R	G	D	K	L	I	E	I	L	A	K	R	V	V	L	A	T	G	A	I	D	S	T	M	L	F	E	N	N	D	M	P	G	V	F	R	R	D	F	A	L	E	V	M	N	.	V	W	E	V	A	P	G	R	K	V	A	V	T	G	S	K	A	D	E	V
Template Known Secondary structure							S	S	S								T	T								S																T	T	T	T	S	T	T													.	T	S		B		S		S						S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																													.
Template SS confidence
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.		.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	A	A	G	A	L	K	N	L	G	I	E	T	H	V	I	E	F	A	P	M	L	M	A	E	Q	L	D	Q	M	G	G	E	Q	L	R	R	K	I	E	S	M	G	V	R	V	H	T	S	K	N	T	L	E	I	V	Q	E	G	V	E	A	R	K	T	M	R	F	A	D	G	S	E	L	E	V	D	F	I	V
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Sequence		I	Q	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	R	W	G	I	D	Y	V	H	I	P	N	V	K	R	V	E	G	N	.	.	E	K	V	E	R	V	I	D	M	N	N	H	E	Y	K	V	D	A	L	I
Template Known Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T							S	S							S	.	.	S	S							T	T							S
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template SS confidence
		262	.	.																																				.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.			.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.			.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.
Query SS confidence																		.	.
Query Sequence		F	S	T	G	I	R	P	R	D	K	L	A	T	Q	C	G	.	.	L	D	V	A	P	R	G	G	I	V	I	N	D	S	C	Q	T	S	D	P	D	I	Y	A	I	G	E	C	A	S	W	N	N	R	V	F	G	L	V	A	P	G	Y	K	M	A	Q	V	A	V	D	H	I	L	G	S	E	N	A	F	E	G
Query Conservation																		.	.
Alig confidence																		.	.																															.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	A	D	G	R	R	P	D	I	N	P	I	T	Q	A	G	G	K	L	R	F	R	R	G	Y	Y	S	P	V	L	D	E	Y	H	R	I	K	D	G	I	Y	V	A	G	S	A	V	S	.	.	.	.	.	I	K	P	H	Y	A	N	Y	L	E	G	K	L	V	G	A	Y	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																T	T							T	T								T	T	S				T	T					S	T	T	T		.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.						.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	D	L	S	A	K	L	K	L	L	G	V	D	V	G	G	I	G	D	A	H	G	R	T	P	G	A	R	S	Y	V	Y	L	D	E	S	K	E	I	Y	K	R	L	I	V	S	E	D	N	K	T	L	L	G	A	V	L	V	G	D	T	S	D	Y	G	N	L	L	Q	L	V	L	N	A	I	E	L	P	E	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	F	G	Y	D	A	Q	P	C	I	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																						372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.		.	460	.			.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure																									.																																								.				.	.
Query SS confidence																									.																																								.				.	.
Query Sequence		P	D	S	L	I	L	P	A	H	S	G	S	G	K	P	S	I	G	V	D	K	L	P	.	D	S	A	Q	I	C	S	C	F	D	V	T	K	G	D	L	I	A	A	I	N	K	G	C	H	T	V	A	A	L	K	A	E	T	K	A	G	T	G	.	C	G	G	.	.	C	I	P	L	V	T	Q	V	L	N	A
Query Conservation																									.																																								.				.	.
Alig confidence																									.										.																														.				.	.
Template Conservation																																			.
Template Sequence		E	E	K	L	R	E	Y	E	P	E	S	L	S	I	P	R	I	P	L	D	K	F	N	L	E	D	V	Q	I	C	G	C	D	.	V	S	L	K	K	V	D	E	V	I	R	K	G	I	T	D	L	Q	I	I	K	R	L	T	H	L	A	M	G	F	C	Q	G	R	Y	C	L	F	N	G	A	V	V	V	S	Q
Template Known Secondary structure						T	T	S												T	T	T	S		G	G	G	S	B		S	S	S	S	.		B										T	T											S		T	T		S	T	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.
Template SS confidence
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.		.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
		473	.	.	.	.	.	.	480	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	L	A	K	Q	G	I	E	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	T	G	K	K	L	S	E	I
Template Known Secondary structure							G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		463	.	.	.	.	.	.	470	.