Job Description P0AAD8 Confidence 97.49% Date Thu Jan 5 11:12:39 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 405 % Identity 12% Template d2a65a1 SCOP info SNF-like SNF-like SNF-like Resolution 1.65

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		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.		.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.					.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.													.	.	.	.
Query SS confidence																								.													.	.	.	.
Query Sequence		S	S	W	R	K	S	D	T	T	W	T	L	G	L	F	G	T	A	I	G	A	G	.	V	L	F	F	P	I	R	A	G	F	G	G	.	.	.	.	L	I	P	I	L	L	M	L	V	L	A	Y	P	I	A	F	Y	C	H	R	A	L	A	R	L	C	L	S	G	S	N	P	S	G	N	I	T	E	T	V	E
Query Conservation																								.													.	.	.	.
Alig confidence																								.													.	.	.	.																																.	.
Template Conservation																																																																								.	.
Template Sequence		R	E	H	W	A	T	R	L	G	L	I	L	A	M	A	G	N	A	V	G	L	G	N	F	L	R	F	P	V	Q	A	A	E	N	G	G	G	A	F	M	I	P	Y	I	I	A	F	L	L	V	G	I	P	L	M	W	I	E	W	A	M	G	R	Y	G	G	A	Q	G	H	.	.	G	T	T	P	A	I	F	Y
Template Known Secondary structure						S														S	S					T									T	T	T														T																	T	T	T		.	.		S
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.			.	.	.	.	.	80	.	.
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	H	F	G	K	T	G	G	V	V	I	T	F	L	Y	F	F	A	I	C	P	L	L	W	I	Y	G	V	T	I	T	N	T	F	M	T	F	W	E	N	Q	L	G	F	A	P	L	N	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	W	R	N	R	F	A	K	I	L	G	V	F	G	L	W	I	P	L	V	V	A	I	Y	Y	V	Y	I	E	S	W	T	L	G	F	A	I	K	F	L	V	G	L	V	P	E	P	P	P	T	D	P	D	S	I	L	R	P	F	K	E	F	L	Y	S	Y	I	G	V	P	K	G	D	E	P	I	L	K	P
Template Known Secondary structure				S		S								T																														T																										T			S	S	S	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
							139	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.			.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																																									.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																																									.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	G	F	V	A	L	F	L	L	L	L	M	A	F	V	I	W	F	G	K	D	L	M	V	K	V	M	S	Y	L	V	W	P	F	I	A	S	L	V	L	I	S	L	S	L	I	P	Y	W	N	S	A	V	I	D	Q	V	.	.	D	L	G	S	L	S	L	T	G	H	D	G	I	L	I	T	V
Query Conservation		.	.	.	.	.																																																									.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																																									.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	L	F	A	Y	I	V	F	L	I	T	M	F	I	N	V	S	I	L	I	R	G	I	S	K	G	I	E	R	F	A	K	I	A	M	P	T	L	F	I	L	A	V	F	L	V	I	R	V	F	L	L	E	T	P	N	G	T	A	A	D	G	L	N	F	L	W	T	P	D	F	E	K	L	K	D	P	G	V	W
Template Known Secondary structure																					T	T		T	T	T	T																								T	T				T	T												S			T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
		212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.		.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
Predicted Secondary structure														.
Query SS confidence														.
Query Sequence		W	L	G	I	S	I	M	V	F	S	F	N	.	F	S	P	I	V	S	S	F	V	V	S	K	R	E	E	Y	E	K	D	F	G	R	D	F	T	E	R	K	C	S	Q	I	I	S	R	A	S	M	L	M	V	A	V	V	M	F	F	A	F	S	C	L	F	T	L	S	P	A	N	M	A	E	A	K	A	Q	N
Query Conservation														.
Alig confidence														.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	A	A	V	G	Q	I	F	F	T	L	S	L	G	F	G	A	I	I	T	Y	A	S	Y	V	R	K	D	Q	D	I	V	L	S	.	.	.	.	.	.	G	L	T	A	A	T	L	N	E	K	A	E	V	I	L	G	G	S	I	S	I	P	A	A	V	A	F	F	G	V	A	N	A	V	A	I	A	K	A	G
Template Known Secondary structure													T	T	T	S	S							T	T	S		T	T	S						.	.	.	.	.	.														T	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.							.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	P	V	L	S	Y	L	A	N	H	F	A	S	M	T	G	T	K	T	T	F	A	I	T	L	E	Y	A	A	S	I	I	A	L	V	A	I	F	K	S	F	F	G	H	Y	L	G	T	L	E	G	L	N	G	L	V	L	K	F	G	Y	K	G	D	K	T	K	V	S	L	G	K	L	N	T	I	S	M	I	F
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	F	N	L	G	F	I	T	L	P	.	.	.	A	I	F	S	Q	T	A	G	G	T	F	L	G	F	L	W	F	F	L	L	F	F	A	G	L	T	S	S	I	A	I	M	Q	P	M	I	A	F	L	E	D	E	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	R	K	H	A	V	L	W	T	A	A
Template Known Secondary structure		S	S					T				.	.	.				T	T	S	T	T																																		T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.				.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.												.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.																.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	M	G	S	T	W	V	V	A	Y	A	N	P	N	I	L	D	L	I	E	A	M	G	A	P	I	I	A	S	L	L	C	L	L	P	M	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	R	K	A	P	S	L	A	K	Y	R	G	R	L	D	N	V	F	V	T	V	I	G	L	L	T	I
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	V	F	F	S	A	H	L	V	M	F	L	N	K	S	L	D	E	M	D	F	W	A	G	T	I	G	V	V	F	F	G	L	T	E	L	I	I	F	F	W	I	F	G	A	D	K	A	W	E	E	I	N	R	G	G	I	I	K	V	P	R	I	Y	Y	Y	V	M	R	Y	I	T	P	A	F	L	A	V	L	L
Template Known Secondary structure													B	T	T									T	T	T																T	T	S											T	T		S	S				T								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
		436	.	.	.	440	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	N	I	V	Y	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	V	W	A	R	E
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		465	.	.	.	.	470