![]() |
| ||||||||||||||||||||||||
|   | Insertion relative to template |
|   | Deletion relative to template |
|   | Catalytic residue from the CSA |
|   | |
| Detailed help on interpreting your alignment | |
|   |   | 29 | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | |||||||||||||
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | L | S | V | H | I | L | N | Q | Q | T | G | K | P | A | A | D | V | T | V | T | L | E | K | K | A | D | N | G | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | W | L | Q | L | N | T | A | K | T | D | K | D | G | R | I | K | A | L | W | P | E | Q | T | A | T | T | G | D | Y | R | V | V | F | K | . | . | T | G | D | Y | F |
| Template Sequence |   | L | Q | G | Q | V | F | D | A | N | . | G | K | P | L | A | G | A | T | V | D | L | W | H | A | N | T | Q | G | T | Y | S | Y | F | D | S | T | Q | S | E | F | N | L | R | R | R | I | I | T | D | A | E | G | R | Y | R | A | . | . | . | . | R | S | I | V | P | S | G | Y | G | C | D | P | Q | G | P | T | Q | E | C | L |
| Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | . | S | B | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | S | B | T | T | B | T | T | S | T | T | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 134 | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||
|   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 96 | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | K | K | Q | N | L | E | S | F | F | P | E | I | P | V | E | F | H | I | N | K | V | N | E | H | Y | H | V | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Sequence |   | D | L | L | G | R | H | G | Q | R | P | A | . | H | V | H | F | F | I | S | A | F | G | . | H | R | H | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | T | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | . | B | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 209 | 210 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |
| Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
| Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
| Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
|   | ||||||||
|
| |||||||