![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 8 | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | ||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | T | F | L | Q | R | E | A | E | G | Q | D | F | Q | L | Y | P | G | E | L | G | K | R | I | Y | N | E | I | S | K | E | A | W | A | Q | W | Q | H | K | Q | T | M | L | I | N | E | K | K | L | N | M | M | N | A | E | H | R | K | L | L | E | Q | E | M | V | N | F | L | F | E | G | K | E | V | H | . | . | . | . | . | . |
Template Sequence |   | V | R | T | G | R | S | I | R | G | F | C | L | P | P | H | C | S | R | G | E | R | R | A | I | E | K | L | A | V | E | A | L | S | S | L | D | G | D | L | A | G | R | Y | . | . | Y | A | L | K | S | M | T | E | A | E | Q | Q | Q | L | I | D | . | . | D | H | F | L | F | D | K | P | V | S | P | L | L | L | A | S | G |
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | B | T | T | S | T | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | G | G | G | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | G | G | G | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | T | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | T | |||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 131 | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | ||||
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 82 | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | . | . | . | . | . | I | E | G | . | . | . | Y | T | P | E | D | K | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | M | A | R | D | W | P | D | A | R | G | I | W | H | N | D | N | K | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | T | T | T | T | T | T | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 207 | . | . | 210 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|