Job Description P0AA82 Confidence 99.45% Date Thu Jan 5 11:12:10 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 387 % Identity 14% Template c2xq2A_ PDB info PDB header:transport protein Chain: A: PDB Molecule:sodium/glucose cotransporter; PDBTitle: structure of the k294a mutant of vsglt Resolution 2.73 Å

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		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.		.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.
Query SS confidence																																																																	.
Query Sequence		G	V	L	A	L	T	F	V	M	L	G	L	T	F	F	S	A	S	M	W	T	G	G	T	L	G	T	G	L	S	Y	H	D	F	F	L	A	V	L	I	G	N	L	L	L	G	I	Y	T	S	F	L	G	Y	I	G	A	K	T	G	L	T	T	.	H	L	L	A	R	F	S	F	G	V	K	G	S	W	L	P
Query Conservation																																																																	.
Alig confidence																																	.																																.
Template Conservation																																	.
Template Sequence		P	W	W	A	V	G	A	S	L	I	A	A	N	I	S	A	E	Q	F	I	G	M	S	G	S	G	Y	S	I	G	L	.	A	I	A	S	Y	E	W	M	S	A	I	T	L	I	I	V	G	K	Y	F	L	P	I	F	I	E	K	G	I	Y	T	I	P	E	F	V	E	K	R	F	N	K	K	L	K	T	I	L
Template Known Secondary structure												G	G	G	S	S														T		G	.	G	G	G																T								T	T			S									T
Template Predicted Secondary structure																																	.
Template SS confidence
		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.		.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.		.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.		.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
Predicted Secondary structure												.																																								.																												.	.
Query SS confidence												.																																								.																												.	.
Query Sequence		S	L	L	L	G	G	T	Q	V	G	.	W	F	G	V	G	V	A	M	F	A	I	P	V	G	K	A	T	G	L	D	I	N	L	L	I	A	V	S	G	L	L	M	T	V	T	V	F	F	G	.	I	S	A	L	T	V	L	S	V	I	A	V	P	A	I	A	C	L	G	G	Y	S	V	W	L	A	V	.	.
Query Conservation												.																																								.																												.	.
Alig confidence												.																																								.																												.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	V	F	W	I	S	L	Y	I	F	V	N	L	T	S	V	L	Y	L	G	G	L	A	L	E	T	I	L	G	I	P	L	M	Y	S	I	L	G	L	A	L	F	A	L	V	Y	S	I	Y	G	G	V	V	W	T	D	V	I	Q	V	F	F	L	V	L	G	G	F	M	T	T	Y	M	A	V	S	F	I	G	G
Template Known Secondary structure												T																																						T	T																														G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
																			174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.			.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.															.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.															.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	M	G	G	L	D	A	L	K	A	V	V	P	A	Q	P	L	D	F	N	V	A	L	A	L	V	V	G	S	F	I	S	A	G	T	L	T	A	D	F	V	R	F	.	.	G	R	N	A	K	L	A	V	L	V	A	M	V	A	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.															.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	D	G	W	F	A	G	V	S	K	M	V	D	A	A	P	G	H	F	E	M	I	L	D	Q	S	N	P	Q	Y	M	N	L	P	G	I	A	V	L	I	G	G	L	W	V	A	N	L	Y	Y	W	G	F	N	Q	Y	I	I	Q	R	T	L	A	A	K	S	V	S	E	A	Q	K	G	I	V	F	A	A	F	L
Template Known Secondary structure		G	G														G	G	G	S		S	S			S	S	S	G	G	G	G	T	S		T	T					S	T										T	T	T		S							T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	F	L	G	N	S	L	M	F	I	F	G	A	A	G	A	A	A	L	G	M	A	D	I	S	D	V	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	Q	G	L	L	L	P	A	I	V	V	L	G	L	N	I	W	T	T	N	D	N	A	L	Y	A	S	G	L	G	F	A
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	L	I	V	P	F	L	V	V	L	P	G	I	A	A	Y	V	I	T	S	D	P	Q	L	M	A	S	L	G	N	L	P	S	A	A	N	A	D	K	A	Y	P	W	L	T	Q	F	L	P	V	G	V	K	G	V	V	F	A	A	L	A	A	A	I	V	S	S	L	A	S	M	L	N	S	T	A	T	I	F	T
Template Known Secondary structure		T	T	T						T											T														S	T	B	G	G	G								T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
		293	.	.															.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.				.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Query Sequence		N	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	M	S	S	K	T	L	S	V	I	N	G	I	I	G	T	V	C	A	L	.	.	.	W	L	Y	N	N	F	V	G	W	L	T	F	L	S	A	A	I	P	P	V	G	G	V	I	I	A	D	Y	L	M	N	R	R	R	Y	E	H	F	A	T
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.																																					.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		M	D	I	Y	K	E	Y	I	S	P	D	S	G	D	H	K	L	V	N	V	G	R	T	A	A	V	V	A	L	I	I	A	A	L	I	A	P	M	L	G	G	I	G	Q	C	F	Q	Y	I	Q	E	Y	T	G	L	V	S	P	G	I	L	A	V	F	L	L	G	L	F	W	K	K	T	T	S	K	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T					T		S																										G	G	G	G	G	G		B											T	T	T															T	T					.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.									.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	R	M	M	S	V	N	W	V	A	I	L	A	V	A	L	G	I	A	A	G	H	W	L	P	G	I	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	A	V	L	G	G	A	L	S	Y	L	I	L	N	P	I	L	N	R	K	T	T	A	A	M	T	H	V	E	A	N	S	V
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	I	I	G	V	V	A	S	I	P	F	A	L	F	L	K	F	M	P	L	S	M	P	F	M	D	Q	M	L	Y	T	L	L	F	T	M	V	V	I	A	F	T	S	L	S	T	S	I	N	D	D	D	P	K	G	I	S	V	T	S	S	M
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																			S	S																													S	S	S	S		T	T						S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										455	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.