Job Description P05825 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:58:57 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 641 % Identity 15% Template c3qlbA_ PDB info PDB header:metal transport Chain: A: PDB Molecule:enantio-pyochelin receptor; PDBTitle: enantiopyochelin outer membrane tonb-dependent transporter from2 pseudomonas fluorescens bound to the ferri-enantiopyochelin Resolution 3.26 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.				.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.
Query Sequence		Q	E	P	T	D	T	P	V	S	H	D	D	T	I	V	V	T	A	A	E	Q	N	L	.	.	.	Q	A	P	G	V	S	T	I	T	A	D	E	I	R	K	N	P	V	A	R	D	V	S	K	I	I	R	T	M	P	G	V	N	L	T	G	N	S	T	S	G	Q	R	G	N	N	R	Q	I	D	I	R	G	M
Query Conservation																									.	.	.
Alig confidence																									.	.	.																																			.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.
Template Sequence		D	S	A	T	G	P	Q	A	G	Y	V	A	K	R	S	L	S	G	T	K	T	D	A	S	L	S	E	I	P	Q	S	I	S	V	I	T	R	D	Q	M	D	A	Q	Q	V	Q	S	V	N	E	A	L	R	Y	T	A	G	V	Q	A	.	.	.	N	T	T	A	A	S	Q	R	F	D	T	L	S	I	R	G	F
Template Known Secondary structure				S	S	S			S	S	S						S	T	T	T	S	S				T	T	T		S	S													T	T			S					G	G	G	S	T	T				.	.	.				S	S			S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.
Template SS confidence
		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.				.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	P	E	N	T	L	I	L	I	D	G	K	P	V	S	S	R	N	S	V	R	Q	G	W	R	G	E	R	D	T	R	G	D	T	S	W	V	P	P	E	M	I	E	R	I	E	V	L	R	G	P	A	A	A	R	Y	G	N	G	A	A	G	G	V	V	N	I	I	T	K	K	G	S	G	E	W	H	G	S	W
Query Conservation
Alig confidence					.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	T	.	T	G	M	L	R	D	G	L	K	G	N	T	A	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	P	K	V	E	A	Y	G	L	E	R	I	D	V	L	K	G	P	A	S	V	L	F	G	Q	N	S	P	G	G	V	V	N	Q	I	S	K	R	P	L	D	K	P	F	H	E	V
Template Known Secondary structure				G	.	G	G				T	T	B					S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						G	G	G									S							S	S			T	T												S	S
Template Predicted Secondary structure					.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		101	.	.		.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.															.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	A	Y	F	N	A	P	E	H	K	E	E	G	A	T	K	R	T	N	F	S	L	T	G	P	L	G	D	E	F	S	F	R	L	Y	G	N	L	D	K	T	Q	A	D	A	W	D	I	N	Q	G	H	Q	S	A	R	A	G	T	Y	A	T	T	L	P	A	G	R	E	G	V	I	N	K	D	I	N	G	V	V
Query Conservation
Alig confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	I	Q	G	G	S	F	D	R	A	Q	G	Q	F	D	F	S	G	P	L	D	D	E	G	Q	F	L	Y	R	L	V	G	L	E	R	D	S	G	T	Q	F	D	H	I	K	D	D	K	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	F	A	P	S	F	T	W	K	P	N	D	D	T	S	L	T	L	L	A	D	Y
Template Known Secondary structure							T	T	T												S	S	S	S	S	S													B		S	S	T	T		B					.	.	.	.	.	.	.	.	.										S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.										.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	W	D	F	A	P	L	Q	S	L	E	L	E	A	G	Y	S	R	Q	G	N	L	Y	A	G	D	T	Q	N	T	N	S	D	S	Y	T	R	S	K	Y	G	D	E	T	N	R	L	Y	R	Q	N	Y	A	L	T	W	N	G	G	W	D	N	G	V	T	T	S	N	W	V	Q	Y	E	H	T	R	N	S	R	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	Q	D	T	F	G	A	P	R	V	F	L	P	A	Q	G	T	L	L	G	N	P	N	G	K	V	R	H	N	V	F	L	D	E	P	G	L	D	N	D	R	T	Q	Y	S	L	G	Y	L	L	E	H	R	L	N	D	V	W	S	L	N	S	S	A	R	Y	G	H	V	N	L	L	T	N	T	A	S	G	M	S
Template Known Secondary structure									S	S				B	S	B	T	T	T	B			T	T					T	T				S		S	S																			S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	E	G	L	A	G	G	T	E	G	K	F	N	E	K	A	T	Q	D	F	V	D	I	D	L	D	D	V	M	L	H	S	E	V	N	L	P	I	D	F	L	V	N	Q	T	L	T	L	G	T	E	W	N	Q	Q	R	M	K	D	L	S	S	N	T	Q	A	L	T	G	T	N	T	G	G	A	I	D	G	V	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	A	P	D	L	R	T	L	N	R	A	A	Y	R	F	R	I	V	G	D	T	Y	S	L	D	N	N	A	Q	A	R	W	N	L	G	S	T	Q	M	V	S	L	L	G	I	D	Y	R	R	T	R	E	D	Y	Y	L	R	G	G	S	A	S	P	I	D	I	Y	N	P	V	H	H	H	H	G	V	F	D	P	S
Template Known Secondary structure				T	T	T	S																											B	S	S	S																														S	S	S									B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.														.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	T	D	R	S	P	Y	S	K	A	E	I	F	S	L	F	A	E	N	N	M	E	L	T	D	S	T	I	V	T	P	G	L	R	F	D	H	H	S	I	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	W	S	P	A	L	N	I	S	Q	G	L	G	D	D	F	T	L	K	M	G	I	A	R
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	P	F	T	N	T	V	Q	R	A	D	Q	V	G	V	Y	A	Q	Q	Q	F	T	F	D	E	H	W	V	L	T	V	G	G	R	Q	D	R	S	S	A	R	T	D	N	R	M	N	D	S	G	S	K	Q	D	D	E	K	F	T	Y	R	T	G	L	V	Y	L	A	D	N	G	L	A	P	Y	I	S	Y	S	T
Template Known Secondary structure		S																							T	T	T																			T	T	T	T																					T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	Y	K	A	P	S	L	Y	Q	T	N	P	N	Y	I	L	Y	S	K	G	Q	G	C	Y	A	S	A	G	G	C	Y	L	Q	G	N	D	D	L	K	A	E	T	S	I	N	K	E	I	G	L	E	F	K	R	D	G	W	L	A	G	V	T	W	F	R	N	D	Y	R	N	K	I	E	A	G	Y	V	A	V	G
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	F	D	P	V	L	G	T	N	F	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	P	Y	K	P	T	S	A	K	Q	S	E	V	G	V	K	Y	Q	P	P	G	I	D	S	Y	I	T	L	S	L	F	D	L	T	Q	E	N	V	L	T	T	D	P	A	Q
Template Known Secondary structure								S	B		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		B																		T	T	S	S																				S	S	S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
		567	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.						.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.																						.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.																						.	.	.
Query Sequence		Q	N	A	V	G	T	D	L	Y	Q	W	D	N	V	P	K	A	V	V	E	G	L	E	G	S	L	N	V	P	V	S	E	T	V	M	W	T	N	N	I	T	Y	M	L	K	S	E	N	K	T	T	.	.	.	.	.	G	D	R	L	S	I	I	P	E	Y	T	L	N	S	T	L	S	W	Q	A	R	.	.	.
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.																						.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	L	.	.	.	.	.	.	.	N	K	I	Q	T	G	E	I	N	V	R	G	I	E	L	E	G	K	A	S	L	A	R	G	L	D	L	L	A	A	L	T	Y	N	D	A	E	V	S	K	S	N	N	P	L	E	K	G	K	R	P	T	D	T	P	E	K	M	A	S	L	W	A	D	Y	T	L	P	E	G	P
Template Known Secondary structure		T	T	.	.	.	.	.	.	.																						T	T	S																S	S			T	T							T	T			S													S	S	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		537	.								.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.
			639	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.							.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.
Predicted Secondary structure		.																																																		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																																																		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	E	D	L	S	M	Q	T	T	F	T	W	Y	G	K	Q	Q	P	K	K	Y	N	Y	K	G	Q	P	A	V	G	P	E	T	K	E	I	S	P	Y	S	I	V	G	L	S	A	T	W	D	V	.	.	.	.	.	.	T	K	N	V	S	L	T	G	G	V	D	N	L	F	D	K	R	L	W	R	A	G	N	A
Query Conservation		.																																																		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	S	G	L	G	F	G	A	G	V	R	Y	I	G	S	T	E	A	D	A	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Q	R	V	P	S	Y	T	L	L	D	A	A	V	H	Y	D	F	D	K	L	I	P	A	A	K	G	L	R	L	A	V	N	A	T	N	L	T	D	K	H	Y	Y	E	G	C	S	L
Template Known Secondary structure		T	T	T																S	T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		G	G	G	S	S	G	G	G	T	T									S	T	T										S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.											.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		712	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	T	T	G	D	L	A	G	A	N	Y	I	A	G	A	G	A	Y	T	Y	N	E	P	G	R	T	W	Y	M	S	V	N	T	H	F
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	S	A	G	Y	D	R	S	V	I	A	S	L	R	Y	R	W
Template Known Secondary structure		S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		680	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.