Job Description P05825 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:58:57 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 606 % Identity 18% Template c3fhhA_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: A: PDB Molecule:outer membrane heme receptor shua; PDBTitle: crystal structure of the heme/hemoglobin outer membrane2 transporter shua from shigella dysenteriae Resolution 2.60 Å

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		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.				.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110
Predicted Secondary structure														.	.	.
Query SS confidence														.	.	.
Query Sequence		D	T	I	V	V	T	A	A	E	Q	N	L	.	.	.	Q	A	P	G	V	S	T	I	T	A	D	E	I	R	K	N	P	V	A	R	D	V	S	K	I	I	R	T	M	P	G	V	N	L	T	G	N	S	T	S	G	Q	R	G	N	N	R	Q	I	D	I	R	G	M	G	P	E	N	T	L	I	L	I	D	G
Query Conservation														.	.	.
Alig confidence														.	.	.																																								.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.
Template Sequence		E	T	M	T	V	T	A	T	G	N	A	R	S	S	F	E	A	P	M	M	V	S	V	I	D	T	S	A	P	E	N	Q	T	A	T	S	A	T	D	L	L	R	H	V	P	G	I	T	L	D	G	T	G	R	.	.	.	.	T	N	G	Q	D	I	N	M	R	G	Y	D	H	R	G	V	L	V	L	V	D	G
Template Known Secondary structure						S	T	T	T	S	S				S	T	T	S	S	S							T	T	S	T	T	T	T	T			S	G	G	G	G	G	T	T	S	T	T					S		S	S	.	.	.	.	S	T	T						T	T	B		G	G	G						T	T
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.					.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	P	V	S	S	R	N	S	V	R	Q	G	W	R	G	E	R	D	T	R	G	D	T	S	W	V	P	P	E	M	I	E	R	I	E	V	L	R	G	P	A	A	A	R	Y	G	N	G	A	A	G	G	V	V	N	I	I	T	K	K	G	S	G	E	W	H	G	S	W	D	A	Y	F	N	A	P	E	H	K	E
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	R	Q	G	T	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	L	N	G	T	F	L	D	P	A	L	I	K	R	V	E	I	V	R	G	P	S	A	L	L	Y	G	S	G	A	L	G	G	V	I	S	Y	D	T	V	D	A	K	D	L	L	Q	E	G	Q	S	S	G	F	R	V	F	G	T	G	G
Template Known Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S								G	G	G									S				T	T	T		T	T		S	S																	S	S	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.												.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
		191	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	A	T	K	R	T	N	F	S	L	T	G	P	L	G	D	E	F	S	F	R	L	Y	G	N	L	D	K	T	Q	A	D	A	W	D	I	N	Q	G	H	Q	S	A	R	A	G	T	Y	A	T	T	L	P	A	G	R	E	G	V	I	N	K	D	I	N	G	V	V	R	W	D	F	A	P	L	Q	S	L	E
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	G	D	H	S	L	G	L	G	A	S	A	F	G	R	T	E	N	L	D	G	I	V	A	W	S	S	R	D	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	R	Q	S	N	G	E	T	A	P	N	D	E	S	I	N	N	M	L	A	K	G	T	W	Q	I	D	S	A	Q	S	L	S
Template Known Secondary structure		T	T	T	T													S	S														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		B			S	S	S			B																	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		147	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.																.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	E	A	G	Y	S	R	Q	G	N	L	Y	A	G	D	T	Q	N	T	N	S	D	S	Y	T	R	S	K	Y	G	D	E	T	N	R	L	Y	R	Q	N	Y	A	L	T	W	N	G	G	W	D	N	G	V	T	T	S	N	W	V	Q	Y	E	H	T	R	N	S	R	I	P	E	G	L	A	G	G	T	E	G	K
Query Conservation
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	L	V	R	Y	Y	N	N	D	A	R	E	P	K	N	P	Q	T	V	E	A	S	E	S	S	N	P	M	V	D	R	S	T	I	Q	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Q	L	S	Y	K	L	A	P	Q	G	N	D	W	L	N	A	D	A	K	I	Y	W	S
Template Known Secondary structure															S	S	T	T	S	S	S			S	S	S	S												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	N	E	K	A	T	Q	D	F	V	D	I	D	L	D	D	V	M	L	H	S	E	V	N	L	P	I	D	F	L	V	N	Q	T	L	T	L	G	T	E	W	N	Q	Q	R	M	K	D	L	S	S	N	T	Q	A	L	T	G	T	N	T	G	G	A	I	D	G	V	S	T	T	D	R	S	P	Y	S	K	A	E
Query Conservation
Alig confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	V	R	I	N	A	Q	E	Y	R	E	Q	I	T	K	G	A	R	L	E	N	R	S	T	L	F	A	D	S	F	A	S	H	L	L	T	Y	G	G	E	Y	Y	R	Q	E	Q	G	S	H	T	T	G	F	P	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	D	F	S	S	G	W	L	Q	D	E
Template Known Secondary structure																											S		S	S	S																						S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.													.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	F	S	L	F	A	E	N	N	M	E	L	T	D	S	T	I	V	T	P	G	L	R	F	D	H	H	S	I	V	G	N	N	W	S	P	A	L	N	I	S	Q	G	L	G	D	D	F	T	L	K	M	G	I	A	R	A	Y	K	A	P	S	L	Y	Q	T	N	P	N	Y	I	L	Y	S	K	G	Q	G	C	Y
Query Conservation
Alig confidence																																																																												.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.	.	.
Template Sequence		I	T	L	R	D	L	P	I	T	L	L	G	G	T	R	Y	D	S	Y	R	G	S	S	D	G	Y	K	D	V	D	A	D	K	W	S	S	R	A	G	M	T	I	N	P	T	N	W	L	M	L	F	G	S	Y	A	Q	A	F	R	A	P	T	M	G	E	M	Y	N	D	S	K	H	F	S	.	.	.	.	.	I
Template Known Secondary structure					S	S	S	S																	S	S	S																		S	S	S	S																							S					.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430						.
		511	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.								540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	S	A	G	G	C	Y	L	Q	G	N	D	D	L	K	A	E	T	S	I	N	K	E	I	G	L	E	F	K	.	.	.	.	.	.	.	R	D	G	W	L	A	G	V	T	W	F	R	N	D	Y	R	N	K	I	E	A	G	Y	V	A	V	G	Q	N	A	V	G	T	D	L	Y	Q	W	D	N	V	P	K	A
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	R	F	Y	T	N	Y	W	V	P	N	P	N	L	R	P	E	T	N	E	T	Q	E	Y	G	F	G	L	R	F	D	D	L	M	L	S	N	D	A	L	E	F	K	A	S	Y	F	D	T	K	A	K	D	Y	I	S	T	T	V	D	F	.	.	.	.	.	.	A	A	A	T	T	M	S	Y	N	V	P	N	A
Template Known Secondary structure		S	S	S									T	T																			S		T	T																										G	.	.	.	.	.	.	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.							.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.
		584	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.		640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.
Query SS confidence																																																										.
Query Sequence		V	V	E	G	L	E	G	S	L	N	V	P	V	S	E	T	V	M	W	T	N	N	I	T	Y	M	L	K	S	E	N	K	T	T	G	D	R	L	S	I	I	P	E	Y	T	L	N	S	T	L	S	W	Q	A	R	E	.	D	L	S	M	Q	T	T	F	T	W	Y	G	K	Q	Q	P	K	K	Y	N	Y	K	G
Query Conservation																																																										.
Alig confidence														.																	.																											.																					.	.	.
Template Conservation														.																	.																																																.	.	.
Template Sequence		K	I	W	G	W	D	V	M	T	K	Y	T	.	T	D	L	F	S	L	D	V	A	Y	N	R	T	R	G	K	.	D	T	D	T	G	E	Y	I	S	S	I	N	P	D	T	V	T	S	T	L	N	I	P	I	A	H	S	G	F	S	V	G	W	V	G	T	F	A	D	R	S	T	H	I	S	S	K	.	.	.
Template Known Secondary structure														.		S	S														.		T	T	T			B		S	S															T	T	S	S																				.	.	.
Template Predicted Secondary structure														.																	.																																																.	.	.
Template SS confidence
		506	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.		.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.		.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580
		663	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.				.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.
Query Sequence		Q	P	A	V	G	P	E	T	K	E	I	S	P	Y	S	I	V	G	L	S	A	T	W	D	V	T	.	.	.	K	N	V	S	L	T	G	G	V	D	N	L	F	D	K	R	L	W	R	A	G	N	A	Q	T	T	G	D	L	A	G	A	N	Y	I	A	G	A	G	A	Y	T	Y	N	E	P	G	R	T	W	Y
Query Conservation																												.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	P	G	Y	G	V	N	D	F	Y	V	S	Y	Q	G	Q	Q	A	L	K	G	M	T	T	T	L	V	L	G	N	A	F	D	K	E	Y	W	S	P	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	P	Q	D	G	R	N	G	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	G	G	G	T	T									S	T	T					B		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		B				S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												584	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	630	.	.	.
		740	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	S	V	N	T	H	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	F	V	S	Y	Q	W
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		634	.	.	.	.	.	640