Job Description P05825 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:58:57 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 674 % Identity 15% Template c3cslB_ PDB info PDB header:membrane protein/heme binding protein Chain: B: PDB Molecule:hasr protein; PDBTitle: structure of the serratia marcescens hemophore receptor hasr in2 complex with its hemophore hasa and heme Resolution 2.70 Å

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		41	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.
Query SS confidence																																																													.
Query Sequence		A	E	Q	N	L	Q	A	P	G	V	S	T	I	T	A	D	E	I	R	K	N	P	V	A	R	D	V	S	K	I	I	R	T	M	P	G	V	N	L	T	G	N	S	T	S	G	Q	R	G	N	N	R	Q	I	D	I	R	G	M	.	G	P	E	N	T	L	I	L	I	D	G	K	P	V	S	S	R	N	S	V
Query Conservation																																																													.
Alig confidence																																																		.	.	.	.								.
Template Conservation																																																		.	.	.	.
Template Sequence		N	D	W	V	Y	D	E	P	R	S	V	S	V	I	S	R	E	Q	M	D	N	R	P	A	R	H	A	A	D	I	L	E	Q	T	T	G	A	Y	S	S	V	S	Q	Q	D	P	A	L	.	.	.	.	S	V	N	I	R	G	I	Q	D	Y	G	R	V	N	M	N	I	D	G	M	R	Q	N	F	Q	K	S	G
Template Known Secondary structure				G	G	G	G	S	S	S													S			S	S	G	G	G	T	T	T	T	S	T	T							T	T				B	.	.	.	.					T	T	B		S	G	G	G						T	T									S
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.
Template SS confidence
		113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160					.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	Q	G	W	R	G	E	R	D	T	R	G	D	T	S	W	V	P	P	E	M	I	E	R	I	E	V	L	R	G	P	A	A	A	R	Y	G	N	G	A	A	G	G	V	V	N	I	I	T	K	K	G	S	G	E	W	H	G	S	W	D	A	Y	F	N	A	P	E	H	K	E	E	G	A	T	K	R	T	N	F
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	R	N	G	T	M	Y	I	D	S	E	L	L	S	G	V	T	I	D	K	G	T	T	G	G	M	G	S	A	G	T	L	G	G	I	A	T	F	N	T	V	S	A	S	D	F	L	A	P	G	K	E	L	G	G	K	L	H	A	S	T	G	D	N	G	T	H	F	I	G	S
Template Known Secondary structure		S	.	.	.	.	.	.	.	S	S		S	S		B				S	T	T									S	S			S	T	T		T	T		S	S										G	G	G	T			S	S													S	T	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		189								190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.											.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	T	G	P	L	G	D	E	F	S	F	R	L	Y	G	N	L	D	K	T	Q	A	D	A	W	D	I	N	Q	G	H	Q	S	A	R	A	G	T	Y	A	T	T	L	P	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	E	G	V	I	N	K	D	I	N	G	V	V	R	W	D	F	A	P	L	Q	S	L
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	I	L	A	L	G	N	E	T	G	D	I	L	L	A	A	S	E	R	H	L	G	D	Y	W	P	G	N	K	G	D	I	G	N	I	R	I	N	N	D	T	G	N	Y	D	R	Y	A	E	S	I	K	N	N	K	I	P	D	T	H	Y	R	M	H	S	R	L	A	K	V	G	W	N	L	P	A	N	Q	R	L
Template Known Secondary structure									S	S																				B	S				S	S	S	S		S		T	T											T	S			G	G	G																T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		262	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	L	E	A	G	Y	S	R	Q	G	N	L	Y	A	G	D	T	Q	N	T	N	S	D	S	Y	T	R	S	K	Y	G	D	E	T	N	R	L	Y	R	Q	N	Y	A	L	T	W	N	G	G	W	D	N	G	V	T	T	S	N	W	V	Q	Y	E	H	T	R	N	S	R	I	P	E	G	L	A	G	G	T	E	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q	L	S	Y	L	Q	T	Q	T	A	S	P	I	A	G	T	L	T	N	L	G	T	R	P	P	Y	E	L	G	W	K	R	T	G	Y	T	D	V	M	A	R	N	A	A	F	D	Y	S	L	A	P	E	D	V	D	W	L	D	F	Q	A	K	L	Y	Y	V	D	T	Q	D	D	S	D	T	Y	S	T	S	S	L
Template Known Secondary structure																		S				S	S	S	S	S																											T	T		T	T																					S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		342	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	F	N	E	K	A	T	Q	D	F	V	D	I	D	L	D	D	V	M	L	H	S	E	V	N	L	P	I	D	F	L	V	N	Q	T	L	T	L	G	T	E	W	N	Q	Q	R	M	K	D	L	S	S	N	T	Q	A	L	T	G	T	N	T	G	G	A	I	D	G	V	S	T	T	D	R	S	P	Y	S	K	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	D	N	G	Y	A	T	R	T	R	L	R	T	Y	G	A	Q	A	Q	N	T	S	R	F	S	L	A	P	G	H	D	F	R	A	N	Y	G	L	E	F	Y	Y	D	K	A	T	S	D	S	S	R	Q	G	M	E	G	V	T	P	A	G	N	R	S	V	A	S	L	F	A	N	L	T	Y	D	Y	D	G	W	L
Template Known Secondary structure		S																											T	T																					S	S	T	T		T	T	S	S																			T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																																															.	.	.
Query Sequence		E	I	F	S	L	F	A	E	N	N	M	E	L	T	D	S	T	I	V	T	P	G	L	R	F	D	H	H	S	I	V	G	N	N	W	S	P	A	L	N	I	S	Q	G	L	G	D	D	F	T	L	K	M	G	I	A	R	A	Y	K	A	P	S	L	Y	Q	T	N	P	N	Y	I	L	Y	S	K	G	.	.	.
Query Conservation																																																																															.	.	.
Alig confidence																																																																															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	L	E	G	G	L	R	Y	D	R	Y	R	L	R	G	Q	T	G	L	S	Y	P	D	L	A	K	D	G	Q	R	Y	T	I	D	N	P	C	K	A	L	R	L	T	G	C	S	T	T	T	R	E	D	W	D	V	D	R	D	Q	G	K	L	S	P	T	L	A	V	A	V	R	P	G	V	E	W	L	E	L	Y
Template Known Secondary structure																										B	S	S	S		B			T	T	S					S	S	G	G	G	T																												S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		502	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.
																	507	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540								.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	C	Y	A	S	A	G	G	C	Y	L	Q	G	N	D	D	L	K	A	E	T	S	I	N	K	E	I	G	L	E	F	K	R	.	.	.	.	.	.	.	D	G	W	L	A	G	V	T	W	F	R	N	D	Y	R	N	K	I	E	A	G	Y	V	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	T	Y	G	K	S	W	R	P	P	A	I	T	E	T	L	T	N	G	S	A	H	S	S	S	T	Q	Y	P	N	P	F	L	Q	P	E	R	S	R	A	W	E	V	G	F	N	V	Q	Q	P	D	L	W	F	E	G	D	R	L	V	A	K	V	A	Y	F	D	T	K	V	D	N	Y	I	N	L	A	I	D	R
Template Known Secondary structure																				B		S	S	T	T							T	T																			S	S	S	S	T	T																S							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		582	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.
		565	.				.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	G	.	.	.	Q	N	A	V	G	T	D	L	Y	Q	W	D	N	V	P	K	A	V	V	E	G	L	E	G	S	L	N	V	P	V	S	E	T	V	M	W	T	N	N	I	T	Y	M	L	K	S	E	N	K	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation				.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.																														.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.
Template Sequence		N	K	P	G	L	V	Q	P	S	I	G	N	A	A	Y	V	N	N	L	S	K	T	R	F	R	G	L	E	Y	Q	L	N	Y	D	.	A	G	V	F	Y	A	D	L	T	Y	T	H	M	I	G	K	N	E	F	C	S	N	K	A	W	L	G	G	R	L	R	Y	G	D	G	S	R	R	G	N	F	Y	V	E	P
Template Known Secondary structure				S	B	S					T	T								S	S															.		S	S																				S	S	T	T			B					S			S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																				.
Template SS confidence
		662	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.		.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740
																617	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.		.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	D	R	L	S	I	I	P	E	Y	T	L	N	S	T	L	S	W	Q	A	.	R	E	D	L	S	M	Q	T	T	F	T	W	Y	G	K	Q	Q	P	K	K	Y	N	Y	K	G	Q	P	A	V	G	P	E	T	K	E	I	S	P	Y	S	I	V	G	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.																							.	.	.	.	.
Template Conservation																																																												.	.	.	.	.
Template Sequence		D	A	A	S	N	D	F	V	T	C	D	G	G	T	Q	F	G	S	A	A	Y	L	P	G	D	R	G	S	V	T	L	G	G	R	A	F	D	R	K	L	D	A	G	V	T	V	R	F	A	P	G	Y	Q	D	S	S	V	P	.	.	.	.	.	S	N	Y	P	Y	L	A	D	W	P	K	Y	T	L	F	D	L
Template Known Secondary structure							S						T	T				S	G	G	G	S															T	T	T																		S	S		.	.	.	.	.	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		741	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.						.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.
		682	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	A	T	W	D	V	T	K	N	V	S	L	T	G	G	V	D	N	L	F	D	K	R	L	W	R	A	G	N	A	Q	T	T	G	D	L	A	G	A	N	Y	I	A	G	A	G	A	Y	T	Y	N	E	P	G	R	T	W	Y	M	S	V	N	T	H	F
Query Conservation
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	A	S	Y	K	L	T	D	S	L	T	L	R	G	S	V	E	N	L	T	N	R	A	Y	V	V	S	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	L	A	N	T	L	G	R	G	R	T	V	Q	G	G	V	E	Y	R	F
Template Known Secondary structure							S	S	S	S								S		T	T		B					T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T							S
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		816	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.																.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.