Job Description P75785 Confidence 99.87% Date Thu Jan 5 12:14:07 GMT 2012 Rank 21 Aligned Residues 237 % Identity 15% Template c2xrgA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family PDBTitle: crystal structure of autotaxin (enpp2) in complex with the2 ha155 boronic acid inhibitor Resolution 3.20 Å

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		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.			.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.		.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.														.
Query SS confidence																																																.	.														.
Query Sequence		M	K	D	T	W	T	V	T	A	V	K	P	K	Y	Q	T	Y	V	V	V	I	G	E	S	A	R	R	D	A	L	G	A	F	G	G	H	W	D	N	T	P	F	A	S	S	V	.	.	N	G	L	I	F	A	D	Y	I	A	A	S	G	.	S	T	Q	K	S	L	G	L	T	L	N	R	V	V	D	G	K	P
Query Conservation																																																.	.														.
Alig confidence																																				.	.	.										.	.														.
Template Conservation																																				.	.	.
Template Sequence		E	E	I	K	V	P	E	C	P	A	G	F	V	R	P	P	L	I	I	F	S	V	D	G	F	R	A	S	Y	M	K	K	G	S	.	.	.	K	V	M	P	N	I	E	K	L	R	S	C	G	T	H	A	P	Y	M	R	P	V	Y	P	T	K	T	F	P	N	L	Y	T	L	A	T	G	L	Y	P	E	S	H
Template Known Secondary structure						S					T	T		S	S										T			G	G	G	G	G	S		T	.	.	.	T	T	S										S				S						S	S		S												S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.
Template SS confidence
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.				.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
		280	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	F	Q	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	V	T	L	A	N	R	A	G	F	Q	T	W	W	F	S	N	Q	G	Q	I	G	E	Y	D	T	A	I	A	S	I	A	K	R	A	D	E	V	Y	F	L	K	E	G	N	F	E
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	I	V	G	N	S	M	Y	D	P	V	F	D	A	S	F	H	L	R	G	R	E	K	F	N	H	R	W	W	G	G	Q	P	L	W	I	T	A	T	K	Q	G	V	R	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	F	F
Template Known Secondary structure		S				S	S				T	T	T	T					S	S	S	S	G	G	G		T	T	S			S									T	T	T			B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.																																.	.	.
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.		.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
Predicted Secondary structure																						.
Query SS confidence																						.
Query Sequence		A	D	K	N	T	K	D	E	A	L	L	D	M	T	A	Q	V	L	A	Q	.	E	H	S	Q	P	Q	L	I	V	L	H	L	M	G	S	H	P	Q	A	C	D	R	T	Q	G	K	Y	E	T	F	V	Q	S	K	E	T	S	C	Y	L	Y	T	M	T	Q	T	D	D	L	L	R	K	L	Y	D	Q	L	R	N
Query Conservation																						.
Alig confidence																						.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	S	V	S	I	P	H	E	R	R	I	L	T	I	L	Q	W	L	S	L	P	D	N	E	R	P	S	V	Y	A	F	Y	S	E	Q	P	D	F	S	G	H	K	Y	G	P	F	G	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	T	N	P	L	R	E	I	D	K	T	V	G	Q	L	M	D	G	L	K	Q
Template Known Secondary structure				T	T	S													T	T	S		T	T	T			S																		T	T		G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.											.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
		411	.			.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	G	.	.	S	S	F	S	L	V	Y	F	S	D	H	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation				.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	R	L	H	R	C	V	N	V	I	F	V	G	D	H	G	M	E	D	V	T	C	D	R	T	E	F	L	S	N	Y	L	T	N	V	D	D	I	T	L	V	P	G	T	L	G	R	I	R	A	K	Y	D	P	K	T	I	I	A	A	L	T	C	K	K	P	D	Q	H	F	K	P	Y	M	K	Q	H	L	P	K
Template Known Secondary structure		T	T		T	T	T								S								S	S	S				G	G	G	T		S			T	T						B	S																T	T	S	S		S	T	T								G	G	G	S		G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
																				425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	F	K	E	R	G	K	D	V	Q	Y	L	A	H	D	D	K	Y	Q	Q	N	F	Q	V	P	F	M	V	I	S	S	D	D	K	A	H	R	V	I	K	A	R	R	S	A	N	D	F	L	G	F	F	S	Q	W	T	G	I	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.
Template Conservation																																																													.
Template Sequence		R	L	H	Y	A	N	N	R	R	I	E	D	I	H	L	L	V	D	R	R	W	H	V	A	R	K	P	F	Q	G	D	H	G	F	D	N	K	V	N	S	M	Q	T	V	F	V	G	Y	G	P	T	F	K	Y	R	T	K	V	P	.	P	F	E	N	I	E	L	Y	N	V	M	C	D	L	L	G	L	K
Template Known Secondary structure		G	G				S	S	T	T	S		S							T	T					S									S		T	T		G	G	G		B						S	S	S	B		S	S		B			.				G	G	G										T
Template Predicted Secondary structure																																																													.
Template SS confidence
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.		490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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