Job Description P26648 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:43:06 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 370 % Identity 16% Template c1kcwA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:ceruloplasmin; PDBTitle: x-ray crystal structure of human ceruloplasmin at 3.0 angstroms Resolution 3.00 Å

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		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.				.	.	.					120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.				.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.				.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	L	G	P	T	I	R	V	W	K	G	D	D	V	K	L	I	Y	S	N	R	L	T	E	N	V	S	M	T	V	A	G	L	Q	V	P	G	P	L	M	G	G	P	.	.	.	A	R	M	.	.	.	.	M	S	P	N	A	D	W	A	P	V	L	P	I	R	Q	N	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																													.	.	.				.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																													.	.	.				.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	L	G	P	V	I	W	A	E	V	G	D	T	I	R	V	T	F	H	N	K	G	A	Y	P	L	S	I	E	P	I	G	V	R	F	N	K	N	N	E	G	T	Y	Y	S	P	V	P	P	S	A	S	H	V	A	P	T	E	T	F	T	Y	E	W	T	V	P	K	E	V	G	P	T	N	A	D	P	V	C	L
Template Known Secondary structure		T	S								T	T											S	S	S		B						T	S	B			T	T	S		S	S								B	T	T	B	B		T	T											G	G	G	S			T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	L	W	Y	H	A	N	T	P	N	R	T	A	Q	Q	V	Y	N	G	L	A	G	M	W	L	V	E	D	E	V	S	K	S	L	P	I	P	N	H	Y	G	V	D	D	F	P	V	I	I	Q	D	K	R	L	D	N	F	G	T	P	E	Y	N	E	P	G	S	G	G	F	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.
Template Sequence		A	K	M	Y	Y	S	A	V	D	.	.	P	T	K	D	I	F	T	G	L	I	G	P	M	K	I	C	K	K	G	S	L	H	A	N	G	R	Q	K	D	V	D	K	E	F	Y	L	F	P	T	V	F	D	E	N	E	S	L	L	L	E	D	N	I	R	M	F	T	T	A	P	D	Q	V	D	K	E	D	E	D
Template Known Secondary structure									S	S	.	.								T										T	T		B		T	T	S		B	T	T		S												G	G	G		T	T										S		S	T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.
Template SS confidence
		517	.	.	520	.	.	.	.	.			.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.
						209	210	.	.	.	.	.	.	.	.				.	220	.	.	.	.	.	.	.	.		.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.		.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.											.	.	.											.																.
Query SS confidence		.	.	.	.											.	.	.											.																.
Query Sequence		.	.	.	.	G	D	T	L	L	V	N	G	V	Q	.	.	.	S	P	Y	V	E	V	S	R	G	W	.	V	R	L	R	L	L	N	A	S	N	S	R	R	Y	Q	.	L	Q	M	N	D	G	R	P	L	H	V	I	S	G	D	Q	G	F	L	P	A	P	V	S	V	K	Q	L	S	L	A	P	G	E	R	R
Query Conservation		.	.	.	.											.	.	.											.																.
Alig confidence		.	.	.	.											.	.	.											.																.				.								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	Q	E	S	N	K	M	H	S	M	N	G	F	M	Y	G	N	Q	P	G	L	T	M	C	K	G	D	S	V	V	W	Y	L	F	S	A	G	N	E	A	D	V	H	G	I	Y	F	.	S	G	N	T	Y	L	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	E	R	R	D	T	A	N	L	F	P	Q	T	S	L
Template Known Secondary structure						T						T	T	B		T	T									T	T												S	T	T								.	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T				S						T	T
Template Predicted Secondary structure																																																	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		595	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.		.	.	.	.	.	.	.										.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	I	L	V	D	M	S	N	G	D	E	V	S	I	T	C	G	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	L	H	M	W	P	D	T	E	G	T	F	N	V	E	C	L	T	T	D	H	Y	T	G	G	M	K	Q	K	Y	T	V	N	Q	C	R	R	Q	S	E	D	S	T	F	Y	L	G	E	R	T	Y	Y	I	A	A	V	E	V	E	W	D	Y	S	P	Q	R	E	W	E	K	E	L	H	H	L	Q	E	Q	N	V
Template Known Secondary structure									S										S						T	T											S							S																			S		S													T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		665	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.
																																								299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	I	V	D	R	I	R	G	F	F	E	P	S	S	I	L	V	S	T	L	V	L	T	L	R	P	T	G	L	L	P	L	V	T	D	S	L	P	M	R	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	N	A	F	L	D	K	G	E	F	Y	I	G	S	K	Y	K	K	V	V	Y	R	Q	Y	T	D	S	T	F	R	V	P	V	E	R	K	A	E	E	E	H	L	G	I	L	G	P	Q	L	H	A	D	V	G	D	K	V	K	I	I	F	K	N	M	A	T	R	P	Y	S	I	H	A	H	G	V	Q	T	E	S
Template Known Secondary structure				T	T	T			T	T	T				S											S	S	T	T			S	B					G	G	G	G	G	G	T	T	S								T	T											S	S	S		B					T	T		B		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		745	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	P	T	E	I	M	A	G	S	P	I	R	S	R	D	I	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	T	V	T	P	T	L	P	G	E	T	L	T	Y	V	W	K	I	P	E	R	S	G	A	G	T	E	D	S	A	C	I	P	W	A	Y	Y	S	T	V	D	Q	V	K	D	L	Y	S	G	L	I	G	P	L	I	V	C	R	R	P	R	R	K	L	E	F	A	L	L	F	L	V	F	D	E	N	E	S	W	Y
Template Known Secondary structure		S					B		T	T											G	G	G	S			S	S	S		S										T	T	T	T					T	T																										G	G	G		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		825	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.
																											359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390					.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	D	P	G	I	N	G	Q	L	W	D	V	N	R	I	D	V	T	A	Q	Q	G	T	W	E	R	W	T	V	R	A	.	.	.	.	D	E	P	Q	A	F	H	I	E	G	V	M	F	Q	I	R	N	V	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.																				.	.	.	.
Template Conservation																																							.
Template Sequence		L	D	D	N	I	K	T	Y	S	D	H	P	E	K	V	N	K	D	D	E	E	F	I	E	S	N	K	M	H	A	I	N	G	R	M	F	G	.	N	L	Q	G	L	T	M	H	V	G	D	E	V	N	W	Y	L	M	G	M	G	N	E	I	D	L	H	T	V	H	F	H	G	H	S	F	Q	Y	K	H	R	G
Template Known Secondary structure											S		G	G	G			T	T								T						T	T	B		T	T	.									T	T											S	S	T	T								T	T						S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																							.
Template SS confidence
		912	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.		.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	A	M	P	F	P	E	D	R	G	W	K	D	T	V	W	V	D	G	Q	V	E	L	L	V	Y	F	G	Q	P	S	W	A	H	F	P	F	Y	F	N	S	Q	T	L	E	M	A	D	R	G	S	I	G	Q	L	L	V
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template Sequence		V	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	S	D	V	F	D	I	F	P	G	T	Y	Q	T	L	E	M	F	P	R	T	P	G	I	.	.	W	L	L	H	C	H	V	T	D	H	I	H	A	G	M	E	T	T	Y	T	V
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.				S						T	T											S				.	.							S							T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template SS confidence
		991									.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.			.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.