Job Description P26648 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:43:06 GMT 2012 Rank 16 Aligned Residues 413 % Identity 19% Template c1asqB_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:ascorbate oxidase; PDBTitle: x-ray structures and mechanistic implications of three functional2 derivatives of ascorbate oxidase from zucchini: reduced-, peroxide-,3 and azide-forms Resolution 2.32 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		43	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.		.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.			.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.																.	.						.	.	.
Query SS confidence																																																								.																.	.						.	.	.
Query Sequence		R	R	G	Q	P	L	F	M	T	V	Q	R	A	H	W	S	F	T	P	G	T	R	A	S	V	W	G	I	N	G	R	Y	L	G	P	T	I	R	V	W	K	G	D	D	V	K	L	I	Y	S	N	R	L	T	.	E	N	V	S	M	T	V	A	G	L	Q	V	P	G	P	.	.	L	M	G	G	P	.	.	.
Query Conservation																																																								.																.	.						.	.	.
Alig confidence																			.																																					.																.	.						.	.	.
Template Conservation																			.
Template Sequence		S	Q	I	R	H	Y	K	W	E	V	E	Y	M	F	W	A	P	.	N	C	N	E	N	I	V	M	G	I	N	G	Q	F	P	G	P	T	I	R	A	N	A	G	D	S	V	V	V	E	L	T	N	K	L	H	T	E	G	V	V	I	H	W	H	G	I	L	Q	R	G	T	P	W	A	D	G	T	A	S	I	S
Template Known Secondary structure																		T	.	T	S	S								T	T	B	S	S								T	T												S	S			B						T				T	T		G	G	G	S			B	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																			.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.		.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		A	R	M	M	S	P	N	A	D	W	A	P	V	L	P	I	R	Q	N	A	A	T	L	W	Y	H	A	N	T	P	N	R	T	A	Q	Q	V	Y	N	G	L	A	G	M	W	L	V	E	D	E	V	S	K	S	L	P	I	P	N	H	Y	G	V	D	D	F	P	V	I	I	Q	D	K	R	L	D	N	F	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence																					.									.	.	.	.																												.	.	.																	.	.
Template Conservation																					.									.	.	.	.																												.	.	.
Template Sequence		Q	C	A	I	N	P	G	E	T	F	F	Y	N	F	T	V	D	N	P	.	G	T	F	F	Y	H	G	H	.	.	.	.	L	G	M	Q	R	S	A	G	L	Y	G	S	L	I	V	D	P	P	Q	G	K	K	E	P	F	H	Y	.	.	.	D	G	E	I	N	L	L	L	S	D	W	W	H	Q	S	I	H	K
Template Known Secondary structure		B			B		T	T											S		.									.	.	.	.	S	T	T	G	G	G	G	T										S	T	T				S	S			.	.	.	S												S	S
Template Predicted Secondary structure																					.									.	.	.	.																												.	.	.
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.		.	100	.	.	.	.	.	.					.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.				.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
																													195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.		.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	P	E	Y	N	E	P	G	S	G	G	F	V	G	D	T	L	L	V	N	G	V	Q	S	P	Y	V	E	V	S	R	G	W	.	V	R	L	R	L	L	N	A	S	N	S	R	R	Y	Q	L	Q	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Conservation
Template Sequence		Q	E	V	G	L	S	S	K	P	I	R	W	I	G	E	P	Q	T	I	L	L	N	G	R	G	Q	F	D	C	S	I	A	A	K	Y	D	S	N	L	E	P	C	K	L	K	G	S	E	S	C	A	P	Y	I	F	H	V	S	P	K	K	T	Y	R	I	R	I	A	S	T	T	A	L	A	A	L	N	F	A	I
Template Known Secondary structure								S	S	S						S		S					T	T	B			S	S	S	B	T	T	G	G	G		T	T	S		B					S		S	T	T	S								T	T												S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.			.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.
Query SS confidence																																												.	.
Query Sequence		N	D	G	R	P	L	H	V	I	S	G	D	Q	G	F	L	P	A	P	V	S	V	K	Q	L	S	L	A	P	G	E	R	R	E	I	L	V	D	M	S	N	G	.	.	D	E	V	S	I	T	C	G	E	A	A	S	I	V	D	R	I	R	G	F	F	E	P	S	S	I	L	V	S	T	L	V	L	T	L	R
Query Conservation																																												.	.
Alig confidence		.																	.																									.	.
Template Conservation		.																	.
Template Sequence		.	G	N	H	Q	L	L	V	V	E	A	D	G	N	Y	V	Q	.	P	F	Y	T	S	D	I	D	I	Y	S	G	E	S	Y	S	V	L	I	T	T	D	Q	N	P	S	E	N	Y	W	V	S	V	G	T	R	A	R	H	P	N	T	P	P	G	L	T	L	L	N	Y	L	P	N	S	V	S	K	L	P	T	S
Template Known Secondary structure		.	T	T	B								T	T					.					S						T	T											S		T	T	S										S	S				S										T	T	S		T	T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure		.																	.
Template SS confidence
			232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.		.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.																.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	T	G	L	L	P	L	V	T	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	P	M	R	L	L	P	T	E	I	M	A	G	S	P	I	R	S	R	D	I	S	L	G	D	D	P	G	I	N	G	Q	L	W	D	V	N	R	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	P	P	Q	T	P	A	W	D	D	F	D	R	S	K	N	F	T	Y	R	I	T	A	A	M	G	S	P	K	P	P	V	K	F	N	R	R	I	F	L	L	N	T	Q	N	V	I	N	G	Y	V	K	W	A	I	N	D	V	S	L	A	L	P	P	T	P	Y	L	G	A	M	K	Y	N	L	L	H	A	F	D
Template Known Secondary structure									T	T										T	T			B		T	T	S					S	S		S													T	T							T	T							S	S								T	T		T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																															376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.									.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	A	Q	Q	G	T	W	E	R	W	T	V	R	A	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	A	F	H	I	E	G	V	M	F	Q	I	R	N	V	N	G	A	M	P	F	P	E	D	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	N	P	P	P	E	V	F	P	E	D	Y	D	I	D	T	P	P	T	N	E	K	T	R	I	G	N	G	V	Y	Q	F	K	I	G	E	V	V	D	V	I	L	Q	N	A	N	M	M	K	E	N	L	S	E	T	H	P	W	H	L	H	G	H	D	F	W	V	L	G	Y	G	D	G	K	F	S	A	E	E	E
Template Known Secondary structure			S								T	T			T	T	S					S	S												T	T													S	S	T	T										S	S											S	S			G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
										419	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	G	W	K	D	T	V	W	V	D	G	Q	V	E	L	L	V	Y	F	G	Q	P	S	W	A	H	F	P	F	Y	F	N	S	Q	T	L	E	M	A	D	R	G	S	I	G	Q	L	L	V	N	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template Conservation																																			.	.
Template Sequence		S	S	L	N	L	K	N	P	P	L	R	N	T	V	V	I	F	P	Y	G	W	T	A	I	R	F	V	A	D	N	P	G	V	.	.	W	A	F	H	C	H	I	E	P	H	L	H	M	G	M	G	V	V	F	A	E	G	V
Template Known Secondary structure		G	G	S		S	S	S					S						T	T											S				.	.						S	S						T	T									G
Template Predicted Secondary structure																																			.	.
Template SS confidence
		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.			.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.