Job Description P78067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:33:09 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 338 % Identity 22% Template c1yt8A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:thiosulfate sulfurtransferase; PDBTitle: crystal structure of thiosulfate sulfurtransferase from pseudomonas2 aeruginosa Resolution 1.90 Å

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		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.		.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
Predicted Secondary structure																.
Query SS confidence																.
Query Sequence		A	A	E	L	A	K	P	L	T	L	D	Q	L	Q	.	Q	Q	N	G	K	A	I	D	T	R	P	S	A	F	Y	N	G	W	P	Q	T	L	N	G	P	S	G	H	E	L	A	A	L	N	L	S	A	S	W	L	D	K	M	S	T	E	Q	L	N	A	W	I	K	Q	H	N	L	K	T	D	A	P	V	A	L
Query Conservation																.
Alig confidence																.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	A	V	R	T	F	H	D	I	R	A	A	L	L	A	R	R	E	L	A	L	L	D	V	R	E	E	D	P	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A	H	P	L	F	A	A	N	L	P	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	E	L	E	I	H	A	R	V	P	R	R	D	T	P	I	T	V
Template Known Secondary structure																	T			B						S						T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	B		T	T						G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	G									S			T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.										.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.									50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
		102	.		.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure				.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	G	.	N	D	K	D	V	D	A	V	K	T	R	L	Q	K	A	G	L	T	H	I	S	I	L	S	D	A	L	S	E	P	S	R	L	Q	K	L	P	H	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Q	L	V	Y	P	Q	W	L	H	D	L	Q	Q	G	K	E	V	T	A
Query Conservation				.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	D	D	G	E	G	L	A	P	V	A	A	Q	R	L	H	D	L	G	Y	S	D	V	A	L	L	D	G	G	L	S	G	W	R	N	A	G	G	E	L	F	R	D	V	N	V	P	S	K	A	F	G	E	L	V	E	A	E	R	H	T	P	S	L	A	A	E	E	V	Q	A	L	L	D	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				S	S	S	S												T	T		S	S					T	T								T	T				B		S	S	S																														.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	P	A	G	D	W	K	V	I	E	A	A	W	G	A	P	K	L	Y	L	I	S	H	I	P	G	A	D	Y	I	D	T	N	E	V	E	S	E	P	L	W	N	K	V	S	D	E	Q	L	K	A	M	L	A	K	H	G	I	R	H	D	T	T	V	I	L	Y	G	R	D	V	Y	A	A	A	R	V	A	Q	I
Query Conservation
Alig confidence		.											.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.											.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	A	R	A	E	A	V	I	L	D	A	.	.	R	R	F	D	E	Y	Q	T	X	S	I	P	G	G	I	S	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	A	E	L	V	L	R	V	A	E	L	A	P	D	P	R	T	R	V	I	V	N	C	A	G	R	T	R	S	I	I	G	T	Q	S
Template Known Secondary structure		.	T	T		S							.	.	S								S	B		T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		G	G	G											S	T	T	S							S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.											.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			143	.	.	.	.	.	.	150	.	.			.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.															170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250		.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
Predicted Secondary structure										.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	L	Y	A	G	V	K	D	.	V	R	L	L	D	G	G	W	Q	T	W	S	D	A	G	L	P	V	E	R	G	T	P	P	K	V	K	A	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation										.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	N	A	G	I	P	N	P	V	A	A	L	R	N	G	T	I	G	W	T	L	A	G	Q	Q	L	E	H	G	Q	T	R	R	F	G	A	I	S	Q	D	T	R	K	A	A	A	Q	R	A	R	A	V	A	D	R	A	G	V	E	R	L	D	L	A	G	L	A	Q	W	Q	D	E	H	D	R	T	T	Y	L
Template Known Secondary structure					T	T		S	S						T	T								T	T				B		S				B																								T																T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	D	V	R	T	P	E	E	Y	E	A	G	H	L	P	G	S	R	S	T	P	G	G	Q	L	V	Q	E	T	D	H	V	A	S	V	R	G	A	R	L	V	L	V	D	D	D	G	V	R	A	N	X	S	A	S	W	L	A	Q	X	G	W	Q	V	A	V	L	D	G	L	S	E	A	D	F	S	E	R	G	A
Template Known Secondary structure					S									B		T	T												S							S	B	T								S	S	S	S												T	T								S			G	G	G			B		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	F	G	V	K	I	P	A	Q	P	Q	L	M	L	D	M	E	Q	A	R	G	L	L	H	R	Q	D	A	S	L	V	S	I	R	S	W	P	E	F	I	G	T	T	S	G	Y	S	Y	I	K	P	K	G	E	I	A	G	A	R	W	G	H	A	G	S	D	S	T	H	M	E	D	F	H	N	P	D	G	T	M
Query Conservation
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	S	A	P	L	P	R	Q	P	R	A	D	T	I	D	P	T	T	L	A	D	W	L	G	E	P	G	T	R	V	L	D	F	T	A	S	A	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	R	H	I	P	G	A	A	W	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																								T	T	S	T	T							S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				B		T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.												.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	S	A	D	D	I	T	A	M	W	K	A	W	N	I	K	P	E	Q	Q	V	S	F	Y	C	G	T	G	W	R	A	S	E	T	F	M	Y	A	R	A	M	G	W	K	N	V	S	V	Y	D	G	G	W	Y	E	W	S	S	D	P	K	N	P	V	A	T	G	E	R	G	P	D	S	S
Query Conservation
Alig confidence		.												.	.																																													.
Template Conservation		.												.	.																																													.
Template Sequence		.	L	R	S	Q	L	K	Q	A	L	E	R	.	.	L	G	T	A	E	R	Y	V	L	T	C	G	S	S	L	L	A	R	F	A	V	A	E	V	Q	A	L	S	G	K	P	V	F	L	L	D	G	G	T	S	A	W	V	A	.	A	G	L	P	T	E	D	G	E	S	L	L	A	S	P
Template Known Secondary structure		.		G	G	G								.	.					S							S	S	S																S						T	T								.	T	T				B		S	S			B	S	S
Template Predicted Secondary structure		.												.	.																																													.
Template SS confidence
			416	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.			.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470		.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.