Job Description P33937 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:52:56 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 662 % Identity 20% Template d1h0ha2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 1.8

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.			60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.
Query SS confidence																																.	.
Query Sequence		R	A	V	V	G	Q	Q	E	A	I	K	W	D	K	A	P	C	R	F	C	G	T	G	C	G	V	L	V	G	T	.	.	Q	Q	G	R	V	V	A	C	Q	G	D	P	D	A	P	V	N	R	G	L	N	C	I	K	G	Y	F	L	P	K	I	M	Y	G	K	D	R	L	T	Q	P	L	L	R	M	K	N	G
Query Conservation																																.	.
Alig confidence																																.	.																																															.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		A	T	M	A	L	K	T	V	D	A	K	Q	T	T	S	V	C	C	Y	C	S	V	G	C	G	L	I	V	H	T	D	K	K	T	N	R	A	I	N	V	E	G	D	P	D	H	P	I	N	E	G	S	L	C	A	K	G	A	S	T	W	Q	L	A	E	N	E	R	R	P	A	N	P	L	Y	R	A	P	.	.
Template Known Secondary structure							T	T	T	T	S								S	S	B	T	T										T	T	T										T	T		T	T	T	T	T								T						S		T	T	S		S	S						T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		108	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.													.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	Y	D	K	E	G	E	F	T	P	I	T	W	D	Q	A	F	D	V	M	E	E	K	F	K	T	A	L	K	E	K	G	P	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	M	F	G	S	G	Q	W	T	I	W	E	G	Y	A	A	S	K	L	F	K	A	G	F	R	S	N	N	I	D	P	N
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation		.	.	.																																																																				.
Template Sequence		.	.	.	G	S	D	Q	W	E	E	K	S	W	D	W	M	L	D	T	I	A	E	R	V	A	K	T	R	E	A	T	F	V	T	K	N	A	K	G	Q	V	V	N	R	C	D	G	I	A	S	V	G	S	A	A	M	D	N	E	E	C	W	I	Y	Q	A	W	L	R	S	.	L	G	L	F	Y	I	E	H	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	T		S	S																														T	T	S								S							T	T	S															.	T	T	B						G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																																																																				.
Template SS confidence
					79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.		.	.	.	.	150	.	.	.	.
		176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	H	C	M	A	S	A	V	V	G	F	M	R	T	F	G	M	D	E	P	M	G	C	Y	D	D	I	E	Q	A	D	A	F	V	L	W	G	A	N	M	A	E	M	H	P	I	L	W	S	R	I	T	N	R	R	L	S	N	Q	N	V	T	V	A	V	L	S	T	Y	Q	H	R	S	F	E	L	A	D	N
Query Conservation
Alig confidence				.																																																						.	.
Template Conservation				.																																																						.	.
Template Sequence		A	R	.	I	H	S	A	T	V	A	A	L	A	E	S	Y	G	R	G	A	M	T	N	H	W	I	D	L	K	N	S	D	V	I	L	M	M	G	S	N	P	A	E	N	H	P	I	S	F	K	W	V	M	R	A	K	.	.	D	K	G	A	T	L	I	H	V	D	P	R	Y	T	R	T	S	T	K	C	D	L
Template Known Secondary structure		G	G	.														S			S		S	S		T	G	G	G	G	G		S						S							S	T	T										.	.		T	T								S	S			T	T	G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure				.																																																						.	.
Template SS confidence
		155	.		.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.			210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	I	I	F	T	P	Q	S	D	L	V	I	L	N	Y	I	A	N	Y	I	I	Q	N	N	A	I	N	Q	D	F	F	S	K	H	V	N	L	R	K	G	A	T	D	I	G	Y	G	L	R	P	T	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	E	K	A	A	K	N	P
Query Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	A	P	L	R	S	G	S	D	I	A	F	L	N	G	M	T	K	Y	I	L	E	K	E	L	Y	F	K	D	Y	V	V	N	Y	T	N	A	S	F	I	V	G	E	G	F	A	F	E	E	G	L	F	A	G	Y	N	K	E	T	R	K	Y	D	K	S	K	W	G	F	E	R	D	E	N	G	N	P	K	R	D
Template Known Secondary structure							T	T																T	T		S									B	G	G	G	B	B	B		T	T					T	T			T	T			T	T	T	T				G	G	G	G		B		B		T	T	S		B		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.				.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.
Query Sequence		G	S	D	A	S	E	P	M	S	F	E	D	Y	K	A	F	V	A	E	Y	T	L	E	K	T	A	E	M	T	G	V	P	K	D	Q	L	E	Q	L	A	Q	L	Y	A	D	P	.	.	.	N	K	K	V	I	S	Y	W	T	M	G	F	N	Q	H	T	R	G	V	W	A	N	N	L	V	Y	N	L	H	L	L
Query Conservation																																																.	.	.
Alig confidence																																																.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	T	L	K	H	P	R	C	V	F	Q	I	M	K	K	H	Y	E	R	Y	D	L	D	K	I	S	A	I	C	G	T	P	K	E	L	I	L	K	V	Y	D	A	Y	C	A	T	G	K	P	D	K	A	G	T	I	M	Y	A	M	G	W	T	Q	H	T	V	G	V	Q	N	I	R	A	M	S	I	N	Q	L	L
Template Known Secondary structure		T	T	S		S	T	T	B										T	T																										G	G	G	S	T	T												S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	G	K	I	S	Q	P	G	C	G	P	F	S	L	T	G	Q	P	S	A	C	G	T	A	R	E	V	G	T	F	A	H	R	L	P	A	D	M	V	V	T	N	E	K	H	R	D	I	C	E	K	K	W	N	I	P	S	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.
Template Sequence		L	G	N	I	G	V	A	G	G	G	V	N	A	L	R	G	E	A	N	V	Q	G	.	S	T	D	H	G	L	L	M	H	I	Y	P	G	Y	L	G	T	A	R	A	S	I	P	T	Y	E	E	Y	T	K	K	F	T	P	V	S	K	D	P	Q	S	A	N	W	W	S	N	F	P	K	Y	S	A	S	Y	I	K
Template Known Secondary structure		T	T		S	S	S	T	T		S						S	B	T	T				.				T	T		B	T	T			T	T	T					B	T	T			S															T	T				G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																								.
Template SS confidence
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.		.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
																			453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	A	K	I	G	L	H	A	V	A	Q	D	R	A	L	K	D	G	K	L	N	V	Y	W	T	M	C	T	N	N	M	Q	A	G	P	N	I	N	E	E	R	M	P	G	W	R	D	P	R	N	F	I	I	V	S	D	P	Y	P	T	V	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.
Template Conservation																																																													.	.
Template Sequence		S	M	W	P	D	A	D	L	N	E	A	Y	G	Y	L	P	K	G	E	D	G	K	D	Y	S	W	L	T	L	F	D	D	M	F	Q	G	K	I	K	G	F	F	A	W	G	Q	N	P	A	C	S	G	A	N	S	N	K	T	R	.	.	E	A	L	T	K	L	D	W	M	V	N	V	N	I	F	D	N	E	T
Template Known Secondary structure					T	T	S									S			B		T	T				S										T	T									S							S	S	S						.	.				T	T		S							S	S			T	T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.
Template SS confidence
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530			.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		516	.	.														.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570						.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	L	I	L	P	T	A	M	W	V	E	K	E	G	A	Y	G	N	A	E	R	R	T	Q	F	W	R	Q	Q	V	Q	A	P	G	E	A	K	S	D	L	W	Q	L	V	Q	F	S	R	R	F	K	.	.	.	.	.	T	E	E	V	W	P	E
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	S	F	W	R	G	P	D	M	D	P	K	K	I	K	T	E	V	F	F	L	P	C	A	V	A	I	E	K	E	G	S	I	S	N	S	G	R	W	M	Q	W	R	Y	V	G	P	E	P	R	K	N	A	I	P	D	G	D	L	I	V	E	L	A	K	R	V	Q	K	L	L	A	K	T	P	G	K	L	A	A
Template Known Secondary structure		T	T	G	G	G	S	T	T			G	G	G										B			G	G	G								T	T									S	S				T	T		B																				S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		578	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590			.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.																.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640
Predicted Secondary structure															.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	L	L	A	K	K	P	E	L	R	G	K	T	.	.	L	Y	E	V	L	Y	A	T	P	E	V	S	K	F	P	V	S	E	L	A	E	D	Q	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	S	R	E	L	G	F	Y	L	Q	K	G	L	F	E	E	Y	A	W	F	G	R	G	H
Query Conservation															.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	V	T	K	L	K	T	D	Y	W	V	N	D	H	G	H	F	D	P	H	K	I	A	K	L	I	N	G	F	A	L	K	D	F	K	V	G	D	V	E	Y	K	A	G	Q	Q	I	A	T	F	G	H	L	Q	A	D	G	S	T	T	S	G	C	W	I	Y	T	G	S	Y	T	E	K	G	N	M	A	A	R	R
Template Known Secondary structure						S		G	G	G	G	B		T	T	S		B												B	B	S	S					T	T					T	T		B		S		G	G	G			T	T	S		B			S	S	G	G	G	T	T	S			T	T			G	G	G		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		641	.	.	.	.				.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.					.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.
Query Sequence		G	H	D	L	A	.	.	.	P	F	D	D	Y	H	K	A	R	G	L	R	W	P	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	G	K	E	T	Q	W	R	Y	S	E	G	N	D	P	Y	V	K	A	G	E	G	Y	.	.	.	.	K	F	Y
Query Conservation							.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	K	T	Q	T	D	M	Q	A	K	I	G	L	Y	P	G	W	T	W	A	W	P	V	N	R	R	I	I	Y	N	R	A	S	V	D	L	N	G	K	P	Y	A	P	E	K	A	V	V	E	W	N	A	A	E	K	K	W	V	G	D	V	P	D	G	P	W	P	P	Q	A	D	K	E	K	G	K	R	A	F	I
Template Known Secondary structure													T			T	T	B	S			T	T	T	T		S	S	T	T	G	G	G	G	B		T	T	S		B	S		G	G	G		S					T	T	T	T					S			S	S		S			T	T		T	T	T				S		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		688	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	K	P	D	G	K	A	V	I	F	A	L	P	F	E	P
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		M	K	P	E	G	Y	A	Y	L	Y	G	P	G	R	E	D
Template Known Secondary structure		T	S	S	S	S		B		S	S		T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.