Job Description P33937 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:52:56 GMT 2012 Rank 24 Aligned Residues 579 % Identity 16% Template d1dmra2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 1.82

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		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.		.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.												.	.	.	.	.	.	110	.
Predicted Secondary structure													.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	P	C	R	F	C	G	T	G	C	G	.	V	L	V	G	T	Q	Q	G	R	V	V	A	C	Q	G	D	P	D	A	P	V	N	R	G	L	N	C	I	K	G	Y	F	L	P	K	I	M	Y	G	K	D	R	L	T	Q	P	L	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	K	N	G	K	Y	D	K
Query Conservation													.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.																															.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.																													.	.	.
Template Sequence		N	G	T	V	M	S	G	S	H	W	G	V	F	T	A	T	V	E	N	G	R	A	T	A	F	T	P	W	E	K	D	P	H	P	S	P	M	L	A	G	V	L	.	.	.	.	D	S	I	Y	S	P	T	R	I	K	Y	P	M	V	R	R	E	F	L	E	K	G	V	N	A	D	R	S	.	.	.	T	R	G
Template Known Secondary structure										T	T									T	T									T	T		S	S			T	T						.	.	.	.					S	T	T	B			S											G	G	G	S		G	G	.	.	.	G	T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.																													.	.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.					.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.				.	.	.
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.					.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.					.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.															.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.															.	.	.	.
Query Sequence		E	G	E	F	T	P	I	T	W	D	Q	A	F	D	V	M	E	E	K	F	K	T	A	L	K	E	K	G	P	E	S	I	G	M	F	G	S	G	Q	W	T	I	W	.	.	.	.	E	G	Y	A	A	S	K	L	F	K	A	G	F	R	.	.	.	.	S	N	N	I	D	P	N	A	R	H	C	M	A	S	A
Query Conservation																																													.	.	.	.															.	.	.	.
Alig confidence																																													.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	G	D	F	V	R	V	S	W	D	Q	A	L	D	L	V	A	A	E	V	K	R	V	E	E	T	Y	G	P	E	G	V	F	G	G	S	Y	G	W	K	S	P	G	R	L	H	N	C	T	T	L	L	R	R	M	L	T	L	A	G	G	Y	V	N	G	A	G	D	Y	S	T	G	A	A	Q	V	I	M	P	H
Template Known Secondary structure		S																												G	G	G													S	S															T			B				S		S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.							.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.		.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.																													.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.																													.
Query Sequence		V	V	G	F	M	R	T	F	G	M	D	E	P	M	G	C	Y	D	D	I	E	Q	A	D	A	F	V	L	W	G	A	N	M	A	E	M	H	P	I	L	.	.	.	.	.	.	W	S	R	I	T	N	R	R	L	S	N	Q	N	V	T	V	A	V	L	S	T	Y	Q	H	R	S	F	E	.	L	A	D	N	G
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.																													.
Alig confidence														.	.																											.	.	.	.	.	.																													.
Template Conservation														.	.
Template Sequence		V	V	G	T	L	E	V	Y	E	Q	Q	T	.	.	A	W	P	V	L	A	E	N	T	E	V	M	V	F	W	A	A	D	P	I	K	T	S	Q	I	G	W	V	I	P	E	H	G	A	Y	P	G	L	E	A	L	K	A	K	G	T	K	V	I	V	I	D	P	V	R	T	K	T	V	E	F	F	G	A	E	H
Template Known Secondary structure			T	S	S			T	T	S			S	.	.										S						S							T	T			S	S	B				T												T								S	S									T
Template Predicted Secondary structure														.	.
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.			170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		I	I	F	T	P	Q	S	D	L	V	I	L	N	Y	I	A	N	Y	I	I	Q	N	N	A	I	N	Q	D	F	F	S	K	H	V	N	L	R	K	G	A	T	D	I	G	Y	G	L	R	P	T	H	P	L	E	K	A	A	K	N	P	G	S	D	A	S	E	P	M	S	F	E	D	Y	K	A	F	V	A	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	T	P	K	P	Q	T	D	V	A	I	M	L	G	M	A	H	T	L	V	A	E	D	L	Y	D	K	D	F	I	A	N	Y	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	F	D	K	F	L	P	Y	L	D	G	E
Template Known Secondary structure						T	T																T	T		S										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
						335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	E	Y	T	L	E	K	T	A	E	M	T	G	V	P	K	D	Q	L	E	Q	L	A	Q	L	Y	A	D	P	N	K	K	V	I	S	Y	W	T	M	G	F	N	Q	H	T	R	G	V	W	A	N	N	L	V	Y	N	L	H	L	L	T	G	K	I	S	Q	P	G	C	G	P	F	S	L	T	G	Q
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																														.	.
Template Conservation																																			.	.
Template Sequence		T	D	S	T	P	K	T	A	E	W	A	E	G	I	S	G	V	P	A	E	T	I	K	E	L	A	R	L	F	E	S	K	R	.	.	T	M	L	A	A	G	W	S	M	Q	R	M	H	H	G	E	Q	A	H	W	M	L	V	T	L	A	S	M	L	G	Q	I	G	L	P	G	G	G	F	G	L	S	Y	H	Y
Template Known Secondary structure		T	T	S																													S		.	.							S	G	G	G	S	S	T	T	T															T		T	T	S	T	T					S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.
Template SS confidence
		283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.			.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
		411	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.				.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.
Query Sequence		P	S	A	C	G	T	A	R	E	V	G	T	F	A	H	R	L	P	A	D	M	V	V	T	N	E	K	H	R	D	I	C	E	K	K	W	N	I	P	S	G	T	.	.	.	I	P	A	K	I	G	L	H	A	V	A	Q	D	R	A	L	K	D	G	K	L	N	V	Y	W	T	M	C	T	N	N	M	Q	A	G
Query Conservation																																												.	.	.
Alig confidence								.																																				.	.	.
Template Conservation								.
Template Sequence		S	G	G	G	T	P	.	S	T	S	G	P	A	L	A	G	I	T	D	G	G	A	A	T	K	G	P	E	W	L	A	A	S	G	A	S	V	I	P	V	A	R	V	V	D	M	L	E	N	P	G	A	E	F	D	F	N	G	T	R	S	K	F	P	D	V	K	M	A	Y	W	V	G	G	N	P	F	V	H	H
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	S		.			S										S	G	G	G	S							S	S	S			S				G	G	G							S	T	T						T	T															S							S
Template Predicted Secondary structure								.
Template SS confidence
		361	.	.	.	.	.		.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.				.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.
Query Sequence		P	N	I	N	E	E	R	M	P	G	W	R	D	P	R	N	F	I	I	V	S	D	P	Y	P	T	V	S	A	L	A	A	D	L	I	L	P	T	A	M	W	V	E	K	E	G	A	Y	G	N	.	.	.	A	E	R	R	T	Q	F	W	R	Q	Q	V	Q	A	P	G	E	A	K	S	D	L	W	Q	L	V	Q
Query Conservation																																																				.	.	.
Alig confidence									.	.																																										.	.	.
Template Conservation									.	.
Template Sequence		Q	D	R	N	R	M	V	.	.	K	A	W	E	K	L	E	T	F	V	V	H	D	F	Q	W	T	P	T	A	R	H	A	D	I	V	L	P	A	T	T	S	Y	E	R	N	D	I	E	T	I	G	D	Y	S	N	T	G	I	L	A	M	K	K	I	V	E	P	L	Y	E	A	R	S	D	Y	D	I	F	A	A
Template Known Secondary structure		S							.	.			G	G	G		S							S	B							T		S					B			G	G	G	S								T	T	T											S				T	T		B
Template Predicted Secondary structure									.	.
Template SS confidence
		440	.	.	.	.	.	.			.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
		565	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	S	R	R	F	K	T	E	E	V	W	P	E	D	L	L	A	K	K	P	E	L	R	G	K	T	L	Y	E	V	L	Y	A	T	P	E	V	S	K	F	P	V	S	E	L	A	E	D	Q	L	N	D	E	S	R	E	L	G	F	Y	L	Q	K	G	L	F	E	E	Y	A	W	F	G	R	G	H	G	H	D	L
Query Conservation
Alig confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	A	E	R	L	G	K	G	A	E	F	T	E	G	K	D	E	M	G	W	I	K	S	F	Y	D	D	A	A	K	Q	G	K	A	A	G	V	Q	M	P	A	F	D	A	F	W	A	E	G	I	V	E	F	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	D	G	A	D	F	V
Template Known Secondary structure						T	T							T	T																					T	T																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		518	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
		645	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	P	F	D	D	Y	H	K	A	R	G	L	R	W	P	V	V	N	G	K	E	T	Q	W	R	Y	S	E	G	N	D	P	Y	V	K	A	G	E	G	Y	K	F	Y
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	Y	A	S	F	R	E	D	P	L	L	N	P	L	G	T	P	T	G	L	I	E	I	Y	S	K	N	I	E	K	M	G	Y	D	D	C	P	A	H	P	T	W	M
Template Known Secondary structure		T	T							T	T	T	S			S	S	T	T	S	S			S	S								T		T	T	S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.