Job Description P33937 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:52:56 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 776 % Identity 16% Template c2ivfA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:ethylbenzene dehydrogenase alpha-subunit; PDBTitle: ethylbenzene dehydrogenase from aromatoleum aromaticum Resolution 1.88 Å

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		39	40	.	.	.	.	.	.	.				.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80								.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	K	W	D	K	A	P	C	R	.	.	.	F	C	G	T	G	C	G	V	L	V	G	T	Q	Q	G	R	V	V	A	C	Q	G	D	P	D	A	P	V	N	R	G	L	N	.	.	.	.	.	.	.	C	I	K	G	Y	F	L	P	K	I	M	Y	G	K	D	R	L	T	Q	P	L	L	R	M	K	N	G	K
Query Conservation											.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		D	K	V	N	W	G	S	H	L	N	I	C	W	P	Q	G	S	C	K	F	Y	V	Y	V	R	N	G	I	V	W	R	E	E	Q	A	A	Q	T	P	A	C	N	V	D	Y	V	D	Y	N	P	L	G	C	Q	K	G	S	A	F	N	N	N	L	Y	G	D	E	R	V	K	Y	P	L	K	R	V	G	.	.	.
Template Known Secondary structure		S									S			S	S												T	T														S	S	T	T	S					S				T	T	G	G	G	T					T	S	T	T	B			S						S	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	D	K	E	G	E	F	T	P	I	T	W	D	Q	A	F	D	V	M	E	E	K	F	K	T	A	L	K	E	K	G	P	E	S	I	G	M	F	G	S	G	Q	W	T	I	W	E	G	Y	A	A	S	K	L	F	K	A	G	F	R	S	N	N	I	D	P	N	A	R	H	C	M	A	S	A	V	V	G	F	M
Query Conservation
Alig confidence																																																																												.	.
Template Conservation																																																																												.	.
Template Sequence		K	R	G	E	G	K	W	K	R	V	S	W	D	E	A	A	G	D	I	A	D	S	I	I	D	S	F	E	A	Q	G	S	D	G	F	I	L	D	A	P	H	V	H	A	G	S	I	A	W	G	A	G	F	R	M	T	Y	L	M	D	G	V	S	P	D	I	N	V	D	I	G	D	T	Y	.	.	M	G	A	F
Template Known Secondary structure		S	T	T	S																											G	G	G	G								S	T	T																T		B									T				.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.			.	.	.	.
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	T	F	G	M	D	E	P	M	G	C	Y	D	D	I	E	Q	A	D	A	F	V	L	W	G	A	N	M	A	E	M	H	P	I	L	W	S	R	I	T	N	R	R	L	S	N	Q	N	V	T	V	A	V	L	S	T	Y	Q	H	R	S	F	E	L	A	D	N	G	I	I	F	T	P	Q	S	D	L	V	I	L
Query Conservation
Alig confidence																																													.	.
Template Conservation																																													.	.
Template Sequence		H	T	F	G	K	M	H	M	G	Y	S	A	D	N	L	L	D	A	E	L	I	F	M	T	C	S	N	W	S	Y	T	Y	P	S	S	Y	H	F	L	S	E	A	R	.	.	Y	K	G	A	E	V	V	V	I	A	P	D	F	N	P	T	T	P	A	A	D	L	H	V	P	V	R	V	G	S	D	A	A	F	W
Template Known Secondary structure					S					B			G	G	G	G	G	G		S						S								T	T	T									.	.			T								S	S			T	T	G	G	G		S							T	T
Template Predicted Secondary structure																																													.	.
Template SS confidence
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.			.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	Y	I	A	N	Y	I	I	Q	N	N	A	I	N	Q	D	F	F	S	K	H	V	N	L	R	K	G	A	T	D	I	G	Y	G	L	R	P	T	H	P	L	E	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	L	S	Q	V	M	I	D	E	K	L	F	D	R	Q	F	V	C	E	Q	T	D	L	P	L	L	V	R	M	D	T	G	K	F	L	S	A	E	D	V	D	G	G	E	A	K	Q	F	Y	F	F	D	E	K	A	G	S	V	R	K	A	S	R	G	T	L	K	L	D	F	M	P	A	L	E	G	T	F	S
Template Known Secondary structure											T	T		S									B	S	T	T	S				T	T	T		S	B		B						S			T	T							T	T	T	T							S	S					S	S					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	A	K	N	P	G	S	D	A	S	E	P	M	S	F	E	D	Y	K	A	F	V	A	E	Y	T	L	E	K	T	A	E	M	T	G	V	P	K	D	Q	L	E	Q	L	A	Q	L	Y	A	D	P	N	K	K	V	I	S	Y	W	T	M	G	F	N	Q	H	T	R	G	V	W	A	N	N	L	V	Y	N	L	H
Query Conservation
Alig confidence																																																											.	.
Template Conservation																																																											.	.
Template Sequence		A	R	L	K	N	G	K	T	I	Q	V	R	T	V	F	E	G	L	R	E	H	L	K	D	Y	T	P	E	K	A	S	A	K	C	G	V	P	V	S	L	I	R	E	L	G	R	K	V	A	K	K	R	T	C	S	Y	I	.	.	G	F	S	S	A	K	S	Y	H	G	D	L	M	E	R	S	L	F	L	A	M
Template Known Secondary structure					T	T	S																G	G	G	G	S																									S							.	.		T	T	T	T	T	B	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.
Template SS confidence
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.			.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	T	G	K	I	S	Q	P	G	C	G	P	F	S	L	T	G	Q	P	S	A	C	G	T	A	R	E	V	G	T	F	A	H	R	L	P	A	D	M	V	V	T	N	E	K	H	R	D	I	C	E	K	K	W	N	I	P	S	G	T	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.
Template Sequence		A	L	S	G	N	W	G	K	P	G	T	G	A	F	A	W	A	Y	S	D	D	N	M	V	Y	.	L	G	V	M	S	K	P	T	A	Q	G	G	M	D	E	L	H	Q	M	A	E	G	F	N	K	R	T	L	E	A	D	P	T	S	T	D	E	M	G	N	I	E	F	M	K	V	V	T	S	A	V	G	L	V
Template Known Secondary structure				T	T		S	S	S	T	T			S		B											.					S	S		G	G	G	T	T	T																			T	T																		T	T
Template Predicted Secondary structure																											.
Template SS confidence
		466	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490		.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.
																																						454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	K	I	G	L	H	A	V	A	Q	D	R	A	L	K	D	G	K	L	N	V	Y	W	T	M	C	T	N	N	M	Q	A	G	P	N	I	N	E	E	R	M	P	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	P	A	M	W	L	Y	Y	H	V	G	Y	D	Q	L	W	N	N	K	A	W	T	D	P	A	L	K	K	S	F	G	A	Y	L	D	E	A	K	E	K	G	W	W	T	N	D	H	I	R	P	A	P	D	K	T	P	Q	V	Y	M	L	L	S	Q	N	P	M	R	R	K	R	S	G	A	K	M	F	P	D	V
Template Known Secondary structure											S	S	T					T		G	G	G	S		T	T	S	S	S												T	T	S	S		T	T	T	S		S		T	T	S									S							S	T	T								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		545	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.
		498	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.			540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.
Query SS confidence																																												.	.
Query Sequence		W	R	D	P	R	N	F	I	I	V	S	D	P	Y	P	T	V	S	A	L	A	A	D	L	I	L	P	T	A	M	W	V	E	K	E	G	A	Y	G	N	A	E	.	.	R	R	T	Q	F	W	R	Q	Q	V	Q	A	P	G	E	A	K	S	D	L	W	Q	L	V	Q	F	S	R	R	F	K	T	E	E	V	W
Query Conservation																																												.	.
Alig confidence																																												.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	F	P	K	L	K	M	I	F	A	L	E	T	R	M	S	S	S	A	M	Y	A	D	I	V	L	P	C	A	W	Y	Y	E	K	H	E	M	T	T	P	C	S	G	N	P	F	F	T	F	V	D	R	S	V	A	P	P	G	E	C	R	E	E	W	D	A	I	A	L	I	L	K	K	V	G	E	R	A	A	A
Template Known Secondary structure		T	G	G	G		S							S	B			T	T	G	G	G		S					B			T	T										S	S	S										S			S	T	T		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		625	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.
		576	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	E	D	L	L	A	K	K	P	E	L	R	G	K	T	L	Y	E	V	L	Y	A	T	P	E	V	S	K	F	P	V	S	E	L	A	E	D	Q	L	N	D	E	S	R	E	L	G	F	Y	L	Q	K	G	L	F	E	E	Y	A	W	F	G	R	G	H	G	H	D	L	A	P	F	D	D	Y	H	K	A	R	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	G	L	T	E	F	N	D	H	N	G	R	K	R	R	Y	D	E	L	Y	K	K	F	T	M	D	G	H	L	L	T	N	E	D	C	L	K	E	M	V	D	I	N	R	A	V	G	V	F	A	K	D	Y	T	Y	E	K	F	K	K	E	G	Q	T	R	F	L	S	M	G	T	G	V	S	R	Y	A	H	A	N
Template Known Secondary structure		T	T							T	T	S					G	G	G						T	T	T	T	T			S															T	T	S	S		T	T																S		T	T	S						T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		705	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.
		656	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	W	P	V	V	N	G	K	E	T	Q	W	R	Y	S	E	G	N	D	P	Y	V	K	A	G	E	G	Y	K	F	Y	G	K	P	D	G	K	A	V	I	F	A	L	P	F	E	P	A	A	E	A	P	D	E	E	Y	D	L	W	L	S	T	G	R	V	L	E	H	W	H	T	G	S	M	T	R	R	V	P
Query Conservation
Alig confidence																																																																										.
Template Conservation																																																																										.
Template Sequence		E	V	D	V	T	K	P	I	Y	P	M	R	W	H	F	D	D	K	K	V	F	P	T	H	T	R	R	A	Q	F	Y	L	D	H	D	W	Y	L	E	A	G	E	S	L	P	T	H	K	D	T	P	M	V	G	G	D	H	P	F	K	I	T	G	G	H	P	R	V	S	I	H	S	.	T	H	L	T	N	S	H
Template Known Secondary structure					T	T	S				S							S					S	S	T	T	S	S	B													T		S	S									T	T	S	S		S									S	S	S	S	T	T	.	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																										.
Template SS confidence
		785	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.		.	.	.	860	.	.	.
		736	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.						.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.	.
Query Sequence		E	L	H	R	A	F	P	E	A	V	L	F	I	H	P	L	D	A	K	A	R	D	L	R	R	G	D	K	V	K	V	V	S	R	R	G	E	V	I	S	I	V	E	T	R	G	R	N	R	P	P	Q	G	L	V	Y	M	P	F	F	D	A	.	.	.	.	.	A	Q	L	V	N	K	L	T	L	D	A	T	D
Query Conservation																																																																.	.	.	.	.
Alig confidence																																																				.	.											.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.
Template Sequence		L	S	R	L	H	R	G	Q	P	V	V	H	M	N	S	K	D	A	A	E	L	G	I	K	D	G	D	M	A	K	L	F	N	D	F	A	D	C	E	I	M	V	R	T	A	P	N	V	Q	P	.	.	K	Q	C	I	V	Y	F	W	D	A	H	Q	Y	K	G	W	K	P	Y	D	I	L	L	I	G	M	P	K
Template Known Secondary structure				T	T	S		S	S													T	T			T	T								S	S											T	T	S		T	.	.	T									G	G	G	S	G	G	G			G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.
Template SS confidence
		864	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.			.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.
		811			.	.	.	.	.																.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	.	.	L	S	K	E	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	K	K	C	A	V	K	L	E	K
Query Conservation			.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	L	H	L	A	G	G	Y	E	Q	F	R	Y	Y	F	M	N	G	S	P	A	P	V	T	D	R	G	V	R	V	S	I	K	K
Template Known Secondary structure		G	G	G	G			S	B	T	T	B			B	T	T	B		S			S				B	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		942	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.