Job Description P33937 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:52:56 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 777 % Identity 20% Template c1y5iA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:respiratory nitrate reductase 1 alpha chain; PDBTitle: the crystal structure of the narghi mutant nari-k86a Resolution 1.90 Å

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		37	.	.	40	.	.	.	.	.	.		.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.								.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
Predicted Secondary structure												.																																	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.
Query SS confidence												.																																	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.
Query Sequence		E	A	I	K	W	D	K	A	P	C	.	R	F	C	G	T	G	C	G	V	L	V	G	T	Q	Q	G	R	V	V	A	C	Q	G	D	P	D	A	P	V	N	R	G	.	.	.	.	.	.	.	L	N	C	I	K	G	Y	F	L	P	K	I	M	Y	G	K	D	R	L	T	Q	P	L	L	R	.	.	.	.	.
Query Conservation												.																																	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.
Alig confidence												.																																	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	H	D	K	I	V	R	S	T	H	G	V	N	C	T	G	S	C	S	W	K	I	Y	V	K	N	G	L	V	T	W	E	T	Q	Q	T	D	Y	P	R	T	R	P	D	L	P	N	H	E	P	R	G	C	P	R	G	A	S	Y	S	W	Y	L	Y	S	A	N	R	L	K	Y	P	M	M	R	K	R	L	M	K
Template Known Secondary structure				S									S	S	S	S											T	T											S					T	T	S				T	T								T	G	G	G	G	G	T	S	T	T	B			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																															104	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	K	N	G	K	Y	D	K	E	G	E	F	T	P	I	T	W	D	Q	A	F	D	V	M	E	E	K	F	K	T	A	L	K	E	K	G	P	E	S	I	G	M	F	G	S	G	Q	W	T	I	W
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.
Template Sequence		M	W	R	E	A	K	A	L	H	S	D	P	V	E	A	W	A	S	I	I	E	D	A	D	K	A	K	S	F	K	Q	.	.	.	A	R	G	R	G	G	F	V	R	S	S	W	Q	E	V	N	E	L	I	A	A	S	N	V	Y	T	I	K	N	Y	G	P	D	R	V	A	G	F	S	P	I	P	A	M	S	M
Template Known Secondary structure								T	T		S	S										T										T	.	.	.	T	T	T	S	S																									T		G	G	G								G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.
Template SS confidence
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150				.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	Y	A	A	S	K	L	F	K	A	G	F	R	S	N	N	I	D	P	N	A	R	H	C	M	A	S	A	V	V	G	F	M	R	T	F	G	M	D	E	P	M	G	C	Y	D	D	I	E	Q	A	D	A	F	V	L	W	G	A	N	M	A	E	M	H	P	I	L	W	S	R	I	T	N	R	R	L	S	N
Query Conservation
Alig confidence																														.	.																																																.	.
Template Conservation																														.	.																																																.	.
Template Sequence		V	S	Y	A	S	G	A	R	Y	L	S	L	I	G	G	T	C	L	S	F	Y	D	W	Y	C	D	L	P	.	.	P	A	S	P	Q	T	W	G	E	Q	T	D	V	P	E	S	A	D	W	Y	N	S	S	Y	I	I	A	W	G	S	N	V	P	Q	T	R	T	P	D	A	H	F	F	T	E	V	R	.	.	Y
Template Known Secondary structure															T							T	T	T	T	T		S		.	.	T							S		S										T	T		S						S							S	G	G	G								G	.	.	G
Template Predicted Secondary structure																														.	.																																																.	.
Template SS confidence
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.			.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.			.
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.							.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	N	V	T	V	A	V	L	S	T	Y	Q	H	R	S	F	E	L	A	D	N	G	I	I	F	T	P	Q	S	D	L	V	I	L	N	Y	I	A	N	Y	I	I	Q	N	N	A	I	N	Q	.	.	.	.	.	.	D	F	F	S	K	H	V	N	L	R	K	G	A	T	D	I	G	Y	G	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																			.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	G	T	K	T	V	A	V	T	P	D	Y	A	E	I	A	K	L	C	D	L	W	L	A	P	K	Q	G	T	D	A	A	M	A	L	A	M	G	H	V	M	L	R	E	F	H	L	D	N	P	S	Q	Y	F	T	D	Y	V	R	R	Y	T	D	M	P	M	L	V	M	L	E	E	R	D	G	Y	Y	A	A	G
Template Known Secondary structure		G	T								S	S							T	S	S							T	T																		T	T	T	S													B	S	T	T	B								S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	M	L	R	A	A	D	L	V	D	A	L	G	Q	E	N	N	P	E	W	K	T	V	A	F	N	T	N	G	E	M	V	A	P	N	G	S	I	G	F	R	W	G	E	K	G	K	W	N	L	E	Q	R	D	G	K	T	G	E	E	T	E	L	Q	L	S	L	L	G	S	Q	D	E	I	A	E	V	G	F	P
Template Known Secondary structure					B	G	G	G	B	T	T	G	G	G			S	S	G	G	G		B				B	T	T	S					B	T	T	S	G	G	G	T	S	S	S		S			S		S	S	B	B	T	T	T			B			B					T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		353	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
																				303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R	P	T	H	P	L	E	K	A	A	K	N	P	G	S	D	A	S	E	P	M	S	F	E	D	Y	K	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	A	E	Y	T	L	E	K	T	A	E	M	T	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	F	G	G	D	G	T	E	H	F	N	K	V	E	L	E	N	V	L	L	H	K	L	P	V	K	R	L	Q	L	A	D	G	S	T	A	L	V	T	T	V	Y	D	L	T	L	A	N	Y	G	L	E	R	G	L	N	D	V	N	C	A	T	S	Y	D	D	V	K	A	Y	T	P	A	W	A	E	Q	I	T	G
Template Known Secondary structure				T	T				T	T	S							S													B	T	T	S																T	T	B			S	S			T	T	S	B	S	S	T	T	S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.					.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.																																																										.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.																																																										.	.	.	.
Query Sequence		V	P	K	D	Q	L	E	Q	L	A	Q	L	Y	A	D	.	.	.	.	P	N	K	K	V	I	S	Y	W	T	M	G	F	N	Q	H	T	R	G	V	W	A	N	N	L	V	Y	N	L	H	L	L	T	G	K	I	S	Q	P	G	C	G	P	F	S	L	T	G	Q	P	S	A	C	G	T	A	R	.	.	.	.
Query Conservation																	.	.	.	.																																																										.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.																																																										.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	S	R	S	Q	I	I	R	I	A	R	E	F	A	D	N	A	D	K	T	H	G	R	S	M	I	I	V	G	A	G	L	N	H	W	Y	H	L	D	M	N	Y	R	G	L	I	N	M	L	I	F	C	G	C	V	G	Q	S	G	G	G	W	A	H	Y	V	G	Q	E	K	L	R	P	Q	T	G	W	Q	P	L
Template Known Secondary structure																						T	S												T	S	T	T															T	T		T	T	S	T	T							S	S					S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		513	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.
																																				419	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	V	G	T	F	A	H	R	L	P	A	D	M	V	V	T	N	E	K	H	R	D	I	C	E	K	K	W	N	I	P	S	G	T	I	P	A	K	I	G	L	H	A	V	A	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	F	A	L	D	W	Q	R	P	A	R	H	M	N	S	T	S	Y	F	Y	N	H	S	S	Q	W	R	Y	E	T	V	T	A	E	E	L	L	S	P	M	A	D	K	S	R	Y	T	G	H	L	I	D	F	N	V	R	A	E	R	M	G	W	L	P	S	A	P	Q	L	G	T	N	P	L	T	I	A	G	E	A
Template Known Secondary structure				T	T	T	T		S															T	T	G	G	G	G					S	G	G	G	S		T	T	S		G	G	G	S		S												T	T	S	S			S	S		B	S	S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		593	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.
		465	.	.																										.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	D	G	K	L	N	V	Y	W	T	M	C	T	N	N	M	Q	A	G	P	N	I	N	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	K	A	G	M	N	P	V	D	Y	T	V	K	S	L	K	E	G	S	I	R	F	A	A	E	Q	P	E	N	G	K	N	H	P	R	N	L	F	I	W	R	S	N	L	L	G	S	S	G	K	G	H	E	F	M	L	K	Y	L	L	G	T	E	H	G	I	Q	G	K	D	L	G	Q	Q	G	G	V	K	P	E
Template Known Secondary structure				T	T	S													T	S	S		B	G	G	G		T	T	S	S	S	S	S								S			T	T	T	T	T		S	S								T	T		S						S			T	T	T	T	T					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		673	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.
						494	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.		.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																									.
Query SS confidence		.	.	.	.																																									.
Query Sequence		.	.	.	.	R	M	P	G	W	R	D	P	R	N	F	I	I	V	S	D	P	Y	P	T	V	S	A	L	A	A	D	L	I	L	P	T	A	M	W	V	E	K	E	G	.	A	Y	G	N	A	E	R	R	T	Q	F	W	R	Q	Q	V	Q	A	P	G	E	A	K	S	D	L	W	Q	L	V	Q	F	S	R	R
Query Conservation		.	.	.	.																																									.
Alig confidence		.	.	.	.																																									.
Template Conservation
Template Sequence		E	V	D	W	Q	D	N	G	L	E	G	K	L	D	L	V	V	T	L	D	F	R	L	S	S	T	C	L	Y	S	D	I	I	L	P	T	A	T	W	Y	E	K	D	D	M	N	T	S	D	M	H	P	F	I	H	P	L	S	A	A	V	D	P	A	W	E	A	K	S	D	W	E	I	Y	K	A	I	A	K	K
Template Known Secondary structure		S	S				S	S							S							S	B							T		S					B			T	T	S	S							S	S	S	S								S	S			S	T	T		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		753	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.
		569	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	K	T	E	E	V	W	P	E	D	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	S	E	V	C	V	G	H	L	G	K	E	T	D	I	V	T	L	P	I	Q	H	D	S	A	A	E	L	A	Q	P	L	D	V	K	D	W	K	K	G	E	C	D	L	I	P	G	K	T	A	P	H	I	M	V	V	E	R	D	Y	P	A	T	Y	E	R	F	T	S	I	G	P	L	M	E	K	I	G	N	G
Template Known Secondary structure						T	T	T	T													B	T	T	S	G	G	G				S	S	S				G	G	G	T	S	S				B	T	T	T	B										G	G	G						T	B			T					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		833	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.
																																														581	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	K	P	E	L	R	G	K	T	L	Y	E	V	L	Y	A	T	P	E	V	S	K	F	P	V	S	E	L	A	E	D	Q	L	N	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	K	G	I	A	W	N	T	Q	S	E	M	D	L	L	R	K	L	N	Y	T	K	A	E	G	P	A	K	G	Q	P	M	L	N	T	A	I	D	A	A	E	M	I	L	T	L	A	P	E	T	N	G	Q	V	A	V	K	A	W	A	A	L	S	E	F	T	G	R	D	H	T	H	L	A	L	N	K	E	D	E
Template Known Secondary structure			T	T																		B			S	S	T	T	T	T	S	B	B			S													T	T	T	B																S	S			G	G	G	T	G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		913	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.
		617	.		.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.
Query SS confidence				.
Query Sequence		E	S	.	R	E	L	G	F	Y	L	Q	K	G	L	F	E	E	Y	A	W	F	G	R	G	H	G	H	D	L	A	P	F	D	D	Y	H	K	A	R	G	L	R	W	P	V	V	N	G	K	E	T	Q	W	R	Y	S	E	G	N	D	P	Y	V	K	A	G	E	G	Y	K	F	Y	G	K	P	D	G	K	A	V
Query Conservation				.
Alig confidence				.																																																																										.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		K	I	R	F	R	D	I	Q	A	Q	P	R	K	I	I	S	S	P	T	W	S	G	L	E	D	E	H	V	S	Y	N	A	G	Y	T	N	V	H	E	L	I	P	W	R	T	L	S	G	R	Q	Q	L	Y	Q	D	H	Q	W	M	R	D	F	G	E	S	L	L	V	Y	R	P	P	I	D	T	R	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		B									S								T	T	S	S	S				S	S	S				T	T											S	S	T	T	S	S	B						S						T	T		S	S											.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		993	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.
		696	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	F	A	L	P	F	E	P	A	A	E	A	P	D	E	E	Y	D	L	W	L	S	T	G	R	V	L	E	H	W	H	T	G	S	M	T	R	R	V	P	E	L	H	R	A	F	P	E	A	V	L	F	I	H	P	L	D	A	K	A	R	D	L	R	R	G	D	K	V	K	V	V	S	R	R	G	E	V	I	S
Query Conservation
Alig confidence		.																																.
Template Conservation		.																																.
Template Sequence		.	S	V	K	E	V	I	G	Q	K	S	N	G	N	Q	E	K	A	L	N	F	L	T	P	H	Q	K	W	G	I	H	S	.	T	Y	S	D	N	L	L	M	L	T	L	G	R	G	G	P	V	V	W	L	S	E	A	D	A	K	D	L	G	I	A	D	N	D	W	I	E	V	F	N	S	N	G	A	L	T	A
Template Known Secondary structure		.		S	T	T	T	T	T	T	T			S	S											B		S	S	S	B	T	T	.	B	T	T	T								T	T	S	S														T			T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure		.																																.
Template SS confidence
			1069	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.		1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.
		776	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.															.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.			.	.	.	.	.															.	.	.	820	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	V	E	T	R	G	R	N	R	P	P	Q	G	L	V	Y	M	P	F	F	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	Q	L	V	N	K	L	T	L	D	A	T	D	P	.	.	L	S	K	E	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	K	K	C	A	V	K	L
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.
Template Sequence		R	A	V	V	S	Q	R	V	P	A	.	.	G	M	T	M	M	Y	H	A	Q	E	R	I	V	N	L	P	G	S	E	I	T	Q	Q	R	G	G	I	H	N	S	V	T	R	I	T	P	K	P	T	H	M	I	G	G	Y	A	H	L	A	Y	G	F	N	Y	Y	G	T	V	G	S	N	R	D	E	F	V	V	V
Template Known Secondary structure							T	T	S		T	.	.	T						B				S	S	S	S			B		T	T	T	S	S	B		B		G	G	G	S							G	G	G	S			S	B	T	T	B	S	B		T	T	T	S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.
Template SS confidence
		1147	.	.	1150	.	.	.	.	.	.			.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.
		826	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	K	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	K	M
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1225	.	.