Job Description P76773 Confidence 16.13% Date Thu Jan 5 12:25:21 GMT 2012 Rank 46 Aligned Residues 147 % Identity 14% Template d1i78a_ SCOP info Transmembrane beta-barrels OMPT-like Outer membrane protease OMPT Resolution 2.60

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		58	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70		.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.			.	.	.	.	.																												.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.																						.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.																						.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	Y	N	F	Q	R	E	D	E	L	K	H	G	.	Y	N	E	I	E	G	W	Y	P	L	F	K	P	T	D	K	L	T	I	Q	P	.	.	G	G	L	I	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	S	I	G	S	G	G	A	V	Y
Query Conservation															.																						.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.										.												.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.
Template Sequence		D	E	A	R	H	P	D	T	Q	L	N	Y	A	N	E	F	D	L	N	I	K	G	W	.	L	L	N	E	P	N	Y	R	L	G	L	M	A	G	Y	Q	E	S	R	Y	S	F	T	A	R	G	G	S	Y	I	Y	S	S	E	E	G	F	R	D	D	I	G	S	F	P	N	G	E	R	A	I	G	Y	K	Q	R
Template Known Secondary structure																									.					S	S																									B			T	T		S	S		B			B			T	T		S
Template Predicted Secondary structure																									.
Template SS confidence
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		108	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.			.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.
Query SS confidence																																																																			.	.
Query Sequence		L	D	V	N	Y	K	F	V	P	W	F	N	L	T	V	R	N	R	Y	N	H	N	N	Y	S	S	T	D	L	S	G	E	L	D	N	N	D	T	Y	E	I	G	T	Y	W	N	F	K	I	T	D	K	F	S	Y	T	F	E	P	H	Y	F	M	R	V	.	.	N	D	F	N	S	S	N	G	K	D	H	H	W
Query Conservation																																																																			.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	K	M	P	Y	.	.	.	.	.	I	G	L	T	G	S	Y	R	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	F	E	L	G	G	T	F	K	Y	S	G	W	V	E	S	S	D	N	D	E	H	Y	D	P	K	G	R	I	T	Y	R	S	K	V	K	D	Q	N	Y	Y
Template Known Secondary structure							.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T																								S	S	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		176	.	.	.	180						.	.	.	.	.	.	.	.	.																				190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	I	T	N	T	F	R	Y	R	I	N	E	H	W	L	P	Y	F	E	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	L	D	R	N	V	E	P	Y	H	R	E	Q	N	Q	I	R	I	G	T	K	Y	F	F
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation																																																								.
Template Sequence		S	V	A	V	N	A	G	Y	Y	V	T	P	N	A	K	V	Y	V	E	G	A	W	N	R	V	T	N	K	K	G	N	T	S	L	Y	D	H	N	N	N	T	S	D	Y	S	K	N	G	A	G	I	E	N	Y	.	N	F	I	T	T	A	G	L	K	Y	T	F
Template Known Secondary structure													T	T																								T	T	T	T															.
Template Predicted Secondary structure																																																								.
Template SS confidence
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.		.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions