Job Description P11349 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:32:35 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 203 % Identity 28% Template d1kqfb1 SCOP info Ferredoxin-like 4Fe-4S ferredoxins Ferredoxin domains from multidomain proteins Resolution 1.60

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	I	R	S	Q	V	G	M	V	L	N	L	D	K	C	I	G	C	H	T	C	S	V	T	C	K	N	V	W	T	S	R	E	G	V	E	Y	A	W	F	N	N	V	E	T	K	P	G	Q	G	F	P	T	D	W	E	N	Q	E	K	Y	K	G	G	W	I	R	K	I	N	G	K	L	Q	P	R	M	G	N	R
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	K	A	E	V	A	K	L	I	D	V	S	T	C	I	G	C	K	A	C	Q	V	A	C	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	N	D	I	R	D	E	V	G	H	C	V	G	V	Y	D	N	P	A	D	L	S	A	K	S	W	T	V	M	R	F	S	E	T	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T	T	T														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T									S	S	S	S			S	S	S		B	T	T	B	S									.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.													.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	M	L	L	G	K	I	F	A	N	P	H	L	P	G	I	D	D	Y	Y	E	P	F	D	F	D	Y	Q	N	L	H	T	A	P	E	G	S	K	S	Q	P	I	A	R	P	R	S	L	I	T	G	E	R	M	A	K	I	E	K	G	P	N	W	E	D	D	L	G	G	E	F	D	K	L	A	K	D	K	N	F
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	N	I	Q	K	A	M	Y	S	Q	F	E	N	T	F	M	M	Y	L	P	R	L	C	E	H	C	L	N	P	A	C	V	A	T	C	P	S	G	A	I	Y	K	R	E	E	D	G	I	V	L	I	D	Q	D	K	C	R	G	W	R	M	C	I	T	G	C	P	Y	K	K	I	Y	F	N	W	K	S	G	K	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	E	Q	N	G	K	L	E	W	L	I	R	K	D	G	C	M	H	C	E	D	P	G	C	L	K	A	C	P	S	A	G	A	I	I	Q	Y	A	N	G	I	V	D	F	Q	S	E	N	C	I	G	C	G	Y	C	I	A	G	C	P	F	N	I	P	R	L	N	K	E	D	N	R	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	S									S				B	S	S									S	T	T	S					T	T	S						G	G	G												T	T							T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	K	C	I	F	C	Y	P	R	I	E	A	G	Q	P	T	V	C	S	E	T	C	V	G	R	I	R	Y	L	G	V	L	L	Y	D	A	D	A	I	E	R	A	A	S	T	E	N	E	K	D	L	Y	Q	R	Q	L	D	V	F	L	D	P	N	D	P	K	V	I	E	Q	A	I	K	D	G	I	P	L	S	V
Query Conservation
Alig confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	K	C	T	L	C	V	D	R	V	S	V	G	Q	E	P	A	C	V	K	T	C	P	T	G	A	I	H	F	G	T	K	K	E	M	L	E	L	A	E	Q	R	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						T	T					T	T	T										T	T	S																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	E	A	A	Q	Q	S	P	V	Y	K	M	A	M	E	W	K	L	A	L	P	L	H	P	E	Y	R	T	L	P	M	V	W	Y	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	L	K	A	R	G	Y	E	H	A	G	V	Y	N	P	E	G	V	G	G	T	H	V	M	Y	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.						T	T		T	T							G	G	G	T		B	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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