Job Description P11349 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:32:35 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 185 % Identity 35% Template c1ti2F_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: F: PDB Molecule:pyrogallol hydroxytransferase small subunit; PDBTitle: crystal structure of pyrogallol-phloroglucinol2 transhydroxylase from pelobacter acidigallici Resolution 2.35 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	S	Q	V	G	M	V	L	N	L	D	K	C	I	G	C	H	T	C	S	V	T	C	K	N	V	W	T	S	R	E	G	V	E	Y	A	W	F	N	N	V	E	T	K	P	G	Q	G	F	P	T	D	W	E	N	Q	E	K	Y	K	G	G	W	I	R	K	I	N	G	K	L	Q	P	R	M	G	N	R	A	M
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	E	Q	Y	Y	M	V	I	D	V	A	K	C	Q	D	C	N	N	C	F	M	G	C	M	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	E	L	N	E	W	P	G	Y	T	A	S	M	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											G	G	G															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	S			B	T	T	T	B					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.													.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	G	K	I	F	A	N	P	H	L	P	G	I	D	D	Y	Y	E	P	F	D	F	D	Y	Q	N	L	H	T	A	P	E	G	S	K	S	Q	P	I	A	R	P	R	S	L	I	T	G	E	R	M	A	K	I	E	K	G	P	N	W	E	D	D	L	G	G	E	F	D	K	L	A	K	D	K	N	F	D	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	H	R	W	M	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																											41	.	.	.	.	.	.
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	Q	K	A	M	Y	S	Q	F	E	N	T	F	M	M	Y	L	P	R	L	C	E	H	C	L	N	P	A	C	V	A	T	C	P	S	G	A	I	Y	K	R	E	E	D	G	I	V	L	I	D	Q	D	K	C	R	G	W	R	M	C	I	T	G	C	P	Y	K	K	I	Y	F	N	W	K	S	G	K	S	E	K
Query Conservation
Alig confidence																																								.	.
Template Conservation																																								.	.
Template Sequence		I	E	R	R	E	R	G	T	Y	P	R	N	D	I	N	Y	R	P	T	P	C	M	H	C	E	N	A	P	C	V	A	K	G	N	G	A	V	Y	.	.	Q	R	E	D	G	I	V	L	I	D	P	E	K	A	K	G	K	K	E	L	L	D	T	C	P	Y	G	V	M	Y	W	N	E	E	E	N	V	A	Q	K
Template Known Secondary structure								S		T	T	S														T	T						S	S	T	T	S			.	.			T	T	S						T	T	T	T	T	T		G	G	G	G	G	G		S	S							T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																								.	.
Template SS confidence
		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.			.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.					.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.
Query Sequence		C	I	F	C	Y	P	R	I	E	A	.	.	.	.	G	Q	P	T	V	C	S	E	T	C	V	G	R	I	R	Y	L	G	V	L	L	Y	D	A	D	A	I	E	R	A	A	S	T	E	N	E	K	D	L	Y	Q	R	Q	L	D	V	F	L	D	P	N	D	P	K	V	I	E	Q	A	I	K	D	G	I	P	L
Query Conservation												.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	T	M	C	A	H	L	L	D	D	E	S	W	A	P	K	M	P	R	C	A	H	N	C	G	S	F	V	Y	E	F	L	K	T	T	P	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T					T		T	T		T	T		S								S	S													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	V	I	E	A	A	Q	Q	S	P	V	Y	K	M	A	M	E	W	K	L	A	L	P	L	H	P	E	Y	R	T	L	P	M	V	W	Y	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	A	K	K	V	E	E	E	G	L	E	.	V	I	K	P	E	L	G	T	K	P	R	V	Y	Y	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T		B	.		S	S	G	G	G					S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template SS confidence
												164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.		.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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