Job Description P13035 Confidence 99.63% Date Thu Jan 5 11:33:30 GMT 2012 Rank 50 Aligned Residues 356 % Identity 10% Template c2ardA_ PDB info PDB header:biosynthetic protein Chain: A: PDB Molecule:tryptophan halogenase prna; PDBTitle: the structure of tryptophan 7-halogenase (prna) suggests a mechanism2 for regioselective chlorination Resolution 2.60 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.				.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.																																																					.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.																																																					.	.	.	.
Query Sequence		D	L	I	V	I	G	G	G	I	N	G	A	G	I	A	A	D	A	A	G	R	.	.	.	G	L	S	V	L	M	L	E	A	Q	D	L	A	C	A	T	S	S	A	S	S	K	L	I	H	G	G	L	R	Y	L	E	H	Y	E	F	R	L	V	S	E	A	L	A	E	R	E	V	L	L	K	M	.	.	.	.
Query Conservation																							.	.	.																																																					.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	I	V	I	V	G	G	G	T	A	G	W	M	A	A	S	Y	L	V	R	A	L	Q	Q	Q	A	N	I	T	L	I	E	S	A	A	I	P	R	I	G	V	G	E	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	S	L	Q	K	V	F	F	D	F	L	G	I	P	E	R	E	W	M	P	Q	V	N	G	A	F
Template Known Secondary structure									S																S	S									T	T	S				S				B		.	.	.	.	.	.	.	.		T						T					T							T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.									.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
																			78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	H	I	A	F	P	M	R	F	R	L	P	H	R	P	H	L	R	P	A	W	M	I	R	I	G	L	F	M	Y	D	H	L	G	K	R	T	S	L	P	G	S	T	G	L	R	F	G	A	N	S	V	L	K	P	E	I	K	R	G	F	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.
Template Conservation																																																																											.	.
Template Sequence		K	A	A	I	K	F	V	N	W	R	K	S	P	D	P	S	R	D	D	H	F	Y	H	L	F	G	N	V	P	N	C	D	G	V	P	L	T	H	Y	W	L	R	K	R	E	Q	G	F	Q	Q	P	M	E	Y	A	C	Y	P	Q	P	G	A	L	D	G	K	L	A	P	C	L	S	D	.	.	G	T	R	Q	M
Template Known Secondary structure									S		S	S	S			T	T	S									S						T	T												T	T	T			S								S							T	T	B		S	B		T	T	.	.			B		S
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.			.	.	.	.	.
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	S	D	C	W	V	D	D	A	R	L	V	L	A	N	A	Q	M	V	V	R	K	G	G	E	V	L	T	R	T	R	A	T	S	A	R	R	E	N	G	L	W	I	V	E	A	E	D	I	D	T	G	K	K	Y	S	W	Q	A	R	G	L	V	N	A	T	G	P	W	V	K	Q	F	F	D	D	G	M	H	L
Query Conservation
Alig confidence																																.																			.	.	.
Template Conservation																																.																			.	.	.
Template Sequence		S	H	A	W	H	F	D	A	H	L	V	A	D	F	L	K	R	W	A	V	E	R	G	V	N	R	V	V	D	E	.	V	V	D	V	R	L	N	N	R	G	Y	I	S	N	L	L	T	K	.	.	.	E	G	R	T	L	E	A	D	L	F	I	D	C	S	G	M	R	G	L	L	I	N	Q	A	L	K	E	P
Template Known Secondary structure																							T	T								.								S	S	S								T	.	.	.	T	S						S						S		T	T								S
Template Predicted Secondary structure																																.																			.	.	.
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.		.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.				.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.						.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.
Query Sequence		P	S	P	Y	G	I	R	L	I	K	G	S	H	I	V	V	P	R	V	H	T	.	.	.	.	.	Q	K	Q	A	Y	I	L	Q	N	E	D	K	R	I	V	F	V	I	P	W	M	D	E	F	S	I	I	G	T	T	D	V	E	Y	K	G	D	P	K	A	V	K	I	E	E	S	E	I	N	Y	L	L	N	V
Query Conservation																							.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	I	D	M	S	D	Y	L	L	C	D	S	A	V	A	S	A	V	P	N	D	D	A	R	D	G	V	E	P	Y	T	S	S	I	A	M	N	S	G	W	T	W	K	I	P	M	L	G	R	F	G	S	G	Y	V	F	S	S	H	F	T	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Q	A	T	A	D
Template Known Secondary structure						T	T	T																						S	S							S	S									T	T										T	T	T	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.												.	.	.	.	300	.
		296	.	.	.	300	.	.		.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.
Query SS confidence									.
Query Sequence		Y	N	T	H	F	K	K	.	Q	L	S	R	D	D	I	V	W	T	Y	S	G	V	R	P	L	C	D	D	E	S	D	S	P	Q	A	I	T	R	D	Y	T	L	D	I	H	D	E	N	G	K	A	P	L	L	S	V	F	G	G	K	L	T	T	Y	R	K	L	A	E	H	A	L	E	K	L	T	P	Y	Y	Q
Query Conservation									.
Alig confidence									.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	L	K	L	W	G	L	S	D	N	Q	P	L	N	Q	I	K	F	R	V	G	R	N	K	R	A	W	V	N	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	V	S	I	G	L	S	S	C	F	L	E	P	L	E	S	T	G	I	.	.	.	.	.	.	Y	F	I	Y	A	A	L	Y	Q	L	V	K	H	F	P
Template Known Secondary structure							T			T	T														S		S			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					G	G	G	S		B			G	G	G					.	.	.	.	.	.													T
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.											.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350							.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	I	G	P	A	W	T	K	E	S	V	L	P	G	G	A	I	E	G	D	R	D	D	Y	A	A	R	L	R	R	R	Y	P	F	L	T	E	S	L	A	R	H	Y	A	R	T	Y	G	S	N	S	E	L	L	L	G	N	A
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	F	D	P	R	L	S	D	A	F	N	A	E	I	V	H	M	F	D	D	C	R	D	F	V
Template Known Secondary structure		B	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		366	.																																.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.