Job Description P13035 Confidence 99.91% Date Thu Jan 5 11:33:30 GMT 2012 Rank 22 Aligned Residues 359 % Identity 15% Template c1x31A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:sarcosine oxidase alpha subunit; PDBTitle: crystal structure of heterotetrameric sarcosine oxidase from2 corynebacterium sp. u-96 Resolution 2.15 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	K	D	L	I	V	I	G	G	G	I	N	G	A	G	I	A	A	D	A	A	G	R	G	L	S	V	L	M	L	E	A	Q	D	L	A	C	A	T	S	S	A	S	S	K	L	I	H	G	G	L	R	Y	L	E	H	Y	E	F	R	L	V	S	E	A	L	A	E	R	E	V	L	L	K	M	A	P	H	I	A
Query Conservation
Alig confidence																																																				.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.
Template Sequence		H	T	D	V	L	V	V	G	A	G	P	A	G	L	A	A	A	R	E	A	S	R	S	G	A	R	V	M	L	L	D	E	R	P	E	A	G	G	T	L	R	E	A	S	G	E	Q	I	D	G	.	.	.	.	.	I	D	A	A	Q	W	I	D	A	V	T	E	E	L	A	A	A	E	E	T	T	H	L	Q	R
Template Known Secondary structure											S													T	T								S	S	S	S	S		G	G	G	G	G			S				T	T	.	.	.	.	.																		T	T					S	S
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.						.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
		83	.	.	.	.	.	.																																																90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	P	M	R	F	R	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	H	R	P	H	L	R	P	A	W	M	I	R	I	G	L	F	M	Y	D	H	L	G	K	R	T
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	T	V	F	G	S	Y	D	A	N	Y	I	L	A	A	Q	R	R	T	V	H	L	D	G	P	S	G	Q	G	V	S	R	E	R	I	W	H	I	R	A	K	Q	V	V	L	A	T	A	A	H	E	R	P	I	V	F	E	N	N	D	R	P	G	I	M	L	A	G	S	V	R	S	Y	L	N	R	F	G	V	R
Template Known Secondary structure									T	T	T									S	T	T		S	S				T	T			S																									B	T	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	P	G	S	T	G	L	R	F	G	A	N	S	V	L	K	P	E	I	K	R	G	F	E	Y	S	D	C	W	V	D	D	A	R	L	V	L	A	N	A	Q	M	V	V	R	K	G	G	E	V	L	T	R	T	R	A	T	S	A	R	R	E	N	G	L	W	I	V	E	A	E	D	.	.	.	.	.	.	I
Query Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																											.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	S	K	I	A	V	A	T	T	N	D	S	V	Y	P	L	V	S	E	L	A	A	S	G	G	V	V	A	V	I	D	A	R	Q	N	I	S	A	A	A	A	Q	A	V	T	D	G	V	T	V	L	T	G	S	V	V	A	N	T	E	A	D	A	S	G	E	L	S	A	V	L	V	A	T	L	D	E	Q	R
Template Known Secondary structure		S		S	S						S	S	G	G	G								G	G	G	T			S						S	S	S											T	T					T	T										T	T	S	S									B		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		282	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.
Query SS confidence																						.
Query Sequence		D	T	G	K	K	Y	S	W	Q	A	R	G	L	V	N	A	T	G	P	W	.	V	K	Q	F	F	D	D	G	M	H	L	P	S	P	Y	G	I	R	L	I	K	G	S	H	I	V	V	P	R	V	H	T	Q	K	Q	A	Y	I	L	Q	N	E	D	K	R	I	V	F	V	I	P	W	M	D	E	F	S	I	I
Query Conservation																						.
Alig confidence																						.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	L	G	E	A	Q	R	F	E	A	D	V	L	A	V	S	G	G	F	N	P	V	V	H	L	H	S	Q	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			B									S																		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.		.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.
Query SS confidence																																																														.
Query Sequence		G	T	T	D	V	E	Y	K	G	D	P	K	A	V	K	I	E	E	S	E	I	N	Y	L	L	N	V	Y	N	T	H	F	K	K	Q	L	S	R	D	D	I	V	W	T	Y	S	G	V	R	P	L	C	D	D	E	S	D	S	P	Q	.	A	I	T	R	D	Y	T	L	D	I	H	D	E	N	G	K	A	P	L
Query Conservation																																																														.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.																			.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	K	L	N	W	D	T	S	I	H	A	F	V	P	A	D	A	V	A	N	Q	H	L	A	G	A	L	T	G	L	L	D	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T							T	T	T	T						S			T	T					G	G	G	G	T			S	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Template SS confidence
																																																391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	S	V	F	G	G	K	L	T	T	Y	R	K	L	A	E	H	A	L	E	K	L	T	P	Y	Y	Q	G	I	G	P	A	W	T	K	E	S	V	L	P	G	G	A	I	E	G	D	R	D	D	Y	A	A	R	L	R	R	R	Y	P	F	L	T	E	S	L	A	R	H	Y	A	R	T	Y	G	S	N	S	E	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	T	A	S	A	L	S	T	G	A	A	T	G	A	A	A	A	S	A	A	G	F	E	K	I	A	E	V	P	Q	A	L	A	V	P	A	G	E	T	R	P	V	W	L	V	P	S	L	S	G	D	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																			T	T																										B	T	T	B	S	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	G	N	A	G	T	V	S	D	L	G	E	D	F	G	H	E	F	Y	E	A	E	L	K	Y	L	V	D	H	E	W	V	R	R	A	D	D	A	L	W	R	R	T	K	Q	G	M	W	L	N	A	D	Q	Q	S	R	V	S	Q	W	L	V	E	Y	T	Q	Q	R	L	S	L	A	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																									.							.												.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																									.							.												.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	V	H	Y	K	F	H	F	V	D	L	Q	R	D	Q	T	V	A	D	V	L	R	A	T	G	.	A	G	M	Q	S	V	.	E	H	I	K	R	Y	T	S	I	S	T	.	.	A	N	D	Q	G	K	T	S	G	V	A	A	I	G	V	I	A	A	V	L	G	I	E	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	G	G	G	T	T	B				T	T	T	T												.	T	T			S		.									T	T		.	.	S	T	T	T	T	T	T	T												T	T		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																									.							.												.	.
Template SS confidence
							476	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.		500	.	.	.	.	.		.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.			.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540