Job Description P13035 Confidence 99.40% Date Thu Jan 5 11:33:30 GMT 2012 Rank 92 Aligned Residues 372 % Identity 14% Template c1s3bB_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:amine oxidase [flavin-containing] b; PDBTitle: crystal structure of maob in complex with n-methyl-n-2 propargyl-1(r)-aminoindan Resolution 1.65 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.					.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	T	K	D	L	I	V	I	G	G	G	I	N	G	A	G	I	A	A	D	A	A	G	R	G	L	S	V	L	M	L	E	A	Q	D	L	A	C	A	T	S	S	.	.	.	.	A	S	S	K	L	I	H	G	G	L	R	Y	L	E	H	Y	E	F	R	L	V	S	E	A	L	A	E	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																												.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																												.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	K	C	D	V	V	V	V	G	G	G	I	S	G	M	A	A	A	K	L	L	H	D	S	G	L	N	V	V	V	L	E	A	R	D	R	V	G	G	R	T	Y	T	L	R	N	Q	K	V	K	Y	V	D	L	G	G	S	Y	V	G	P	T	Q	N	R	I	L	R	L	A	K	E	L	G	L	E	T	Y	K	V
Template Known Secondary structure			B		S							B													T	T								S	S	S	S	S	B	T	T							T	T	T					S	S						T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
																																						71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	V	L	L	K	M	A	P	H	I	A	F	P	M	R	F	R	L	P	H	R	P	H	L	R	P	A	W	M	I	R	I	G	L	F	M	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	E	V	E	R	L	I	H	H	V	K	G	K	S	Y	P	F	R	G	P	F	P	P	V	W	N	P	I	T	Y	L	D	H	N	N	F	W	R	T	M	D	D	M	G	R	E	I	P	S	D	A	P	W	K	A	P	L	A	E	E	W	D	N	M	T	M	K	E	L	L	D	K	L	C	W	T	E	S	A	K
Template Known Secondary structure				S	S							T	T							S	S	S					S																			T	T	S		T	T		G	G	G	S	T	T						T	S	B										S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
										108	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	H	L	G	K	R	T	S	L	P	G	S	T	G	L	R	F	G	A	N	S	V	L	K	P	E	I	K	R	G	F	E	Y	S	D	C	W	V	D	D	A	R	L	V	L	A	N	A	Q	M	V	V	R	K	G	G	E	V	L	T	R	T	R	A	T	S	A	R	R	E	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	L	A	T	L	F	V	N	L	C	V	T	A	E	T	H	E	V	S	A	L	W	F	L	W	Y	V	K	Q	C	G	G	T	T	R	I	I	S	T	T	N	G	G	Q	E	R	K	F	V	G	G	S	G	Q	V	S	E	R	I	M	D	L	L	G	D	R	V	K	L	E	R	P	V	I	Y	I	D	Q	T	R
Template Known Secondary structure													S	S		T	T	T	S	B										T	T	T								S	T	T	S	T	T	S				T	T		T												G	G	G			S	S									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.								.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.					.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.
Query Sequence		G	L	W	I	V	E	A	E	D	I	D	T	G	K	K	Y	S	W	Q	A	R	G	L	V	N	A	T	G	P	W	V	K	Q	F	F	.	.	.	.	.	.	.	D	D	G	M	H	L	P	S	P	Y	G	I	R	L	I	K	G	S	H	I	V	V	P	R	V	H	T	Q	.	.	.	.	K	Q	A	Y	I	L
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.
Template Sequence		E	N	V	L	V	E	T	L	N	H	E	.	.	.	.	.	M	Y	E	A	K	Y	V	I	S	A	I	P	P	T	L	G	M	K	I	H	F	N	P	P	L	P	M	M	R	N	Q	M	I	T	R	V	P	L	G	S	V	I	K	C	I	V	Y	Y	K	E	P	F	W	R	K	K	D	Y	C	G	T	M	I	I
Template Known Secondary structure		S	S						T	T	S		.	.	.	.	.					S						S		G	G	G	G	G	G	S				S										T	T	S			B											S	S		G	G	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.						.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.				260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.			.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.																																												.	.
Query SS confidence													.	.	.																																												.	.
Query Sequence		Q	N	E	D	K	R	I	V	F	V	I	.	.	.	P	W	M	D	E	F	S	I	I	G	T	T	D	V	E	Y	K	G	D	P	K	A	V	K	I	E	E	S	E	I	N	Y	L	L	N	V	Y	N	T	H	F	K	K	.	.	Q	L	S	R	D	D	I	V	W	T	Y	S	G	V	R	P	L	C	D	D	E
Query Conservation													.	.	.																																												.	.
Alig confidence													.	.	.																																												.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	G	E	E	A	P	V	A	Y	T	L	D	D	T	K	P	E	G	N	Y	A	A	I	M	G	F	I	L	A	H	K	A	R	K	L	A	R	L	T	K	E	E	R	L	K	K	L	C	E	L	Y	A	K	V	L	G	S	L	E	A	L	E	P	V	H	Y	E	E	K	N	W	C	E	E	Q	Y	S	G	G	C
Template Known Secondary structure			S	S	S		S		S								T	T	S		S									T							T	T	S																		T		G	G	G	G			S							G	G	G		T	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.										.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	D	S	P	Q	A	I	T	R	D	Y	T	L	D	I	H	D	E	N	G	K	A	P	L	L	S	V	F	G	G	K	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Y	R	K	L	A	E	H	A	L	E	K	L	T	P	Y	Y	Q	G	I	G	P	A	W
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.
Template Sequence		Y	T	T	Y	F	P	P	G	I	L	T	Q	Y	G	R	V	L	R	Q	P	V	D	R	I	Y	.	.	F	A	G	T	E	T	A	T	H	W	S	G	Y	M	E	G	A	V	E	A	G	E	R	A	A	R	E	I	L	H	A	M	G	K	I	P	E	D	E
Template Known Secondary structure		S		B				T	T						G	G	G	T	T			B	T	T			.	.			S	G	G	G		S	S	S	T	T	S																			T	T	S	S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																											.	.
Template SS confidence
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.			.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.