Job Description P37661 Confidence 98.82% Date Thu Jan 5 11:56:34 GMT 2012 Rank 28 Aligned Residues 300 % Identity 12% Template d1zeda1 SCOP info Alkaline phosphatase-like Alkaline phosphatase-like Alkaline phosphatase Resolution 1.57

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Show / Hide Conservation and Alignment quality

		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.										.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	A	R	V	D	E	S	S	D	N	N	S	L	L	N	P	A	K	K	F	T	Y	Q	A	P	Q	N	V	D	D	T	Y	V	V	F	I	I	G	E	T	T	R	W	D	H	M	G	I	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	E	R	N	T	T	P	K	L	A	Q	E	K	N	L	A	A	F	R	G	Y
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	E	E	E	N	P	D	F	W	N	R	E	A	A	E	A	L	G	A	A	K	K	L	Q	P	A	Q	T	A	A	K	N	L	I	I	F	L	G	D	G	M	G	V	S	T	V	T	A	A	R	I	L	K	G	Q	K	K	D	K	L	G	P	E	I	P	L	A	M	D	R	F	P	Y	V	A	L	S	K	T	Y
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	S																						S	B			S								T	T																	T	T	S		S	T	T	S			T	G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
		289	290				.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.														.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	C	.	.	.	D	T	A	T	K	L	S	L	R	C	M	F	V	R	Q	G	G	A	E	D	N	P	Q	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	K	E	Q	N	I	F	A	V	L	K	Q	L	G	F	S	S	D	L	Y	A	M	Q	S	E	M	W	F	Y	S	N	T	M	A	D	N	I
Query Conservation				.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	V	D	K	H	V	P	D	S	G	A	T	A	T	A	Y	L	C	G	V	K	G	N	F	Q	T	I	G	L	S	A	A	A	R	F	N	Q	C	N	T	T	R	G	N	E	V	I	S	V	M	N	R	A	K	K	A	G	K	S	V	G	V	V	T	T	T	R	V	Q	H	A	S	P	A	G	T	Y	A	H	T
Template Known Secondary structure			S	S		S	S													S	S				T	T		B	S	B		T	T	S		T	T		G	G	G		T	T		B											T	T											T	T	S					T	T	T			B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
		353	.	.	.	.	.	.																							360	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Query Sequence		A	Y	R	E	Q	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	P	R	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	K	P	V	D	D	M	L	L	V	D	E	M	Q	.	.	.	.	.
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	N	R	N	W	Y	S	D	A	D	V	P	A	S	A	R	Q	E	G	C	Q	D	I	A	T	Q	L	I	S	N	M	D	I	D	V	I	L	G	G	G	R	K	Y	M	F	R	M	G	T	P	D	P	E	Y	P	D	D	Y	S	Q	G	G	T	R	L	D	G	K	N	L	V	Q	E	W	L	A	K	R	Q	G
Template Known Secondary structure		S		T	T			S	G	G	G	S							T	T											T	S			S							G	G	G	G	S	B	T	T				S	S		T	T		G	G	G	S			B	S	S											T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
												380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.																									.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	S	L	G	R	N	P	D	G	K	H	L	I	I	L	H	T	K	G	S	H	F	N	Y	T	Q	R	Y	P	R	S	F	A	Q	W	K	P	E	C	I	G	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	C
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.
Template Sequence		A	R	Y	V	W	N	R	T	E	L	M	Q	A	S	L	D	P	S	V	T	H	L	M	G	L	.	F	E	P	G	D	M	K	Y	E	I	H	R	D	S	T	L	D	P	S	L	M	E	M	T	E	A	A	L	R	L	L	S	R	N	P	R	G	F	F	L	F	V	E	G	G	R	I	D	H	G	H	H	E	S
Template Known Secondary structure							S									T		T	T		S						.		S	S	S	S				G	G	G			T	T	T																T	T		T	T									T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure																											.
Template SS confidence
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.		.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	K	A	Q	M	I	N	S	Y	D	N	S	V	T	Y	V	D	H	F	I	S	S	V	I	D	Q	V	R	D	K	K	A	I	V	F	Y	A	A	D	H	G	E	S	I	N	E	R	E	H	L	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.
Template Sequence		R	A	Y	R	A	L	T	E	.	.	.	.	T	I	M	F	D	D	A	I	E	R	A	G	Q	L	T	S	E	E	D	T	L	S	L	V	T	A	D	H	S	H	V	F	S	F	G	G	Y	P	L	R	G	S	S	I	F	G	L	A	P	G	K	A	R	D	R	K	A	Y	T	V	L	L	Y	G	N	G	P	G
Template Known Secondary structure										.	.	.	.															S		T	T	T								S				S					S				T	T			T	T	S	B		S	S			T	T	S	S			B	S						S	T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330					.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
																											477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	P	R	E	L	A	P	P	E	Q	F	R	V	P	M	M	V	W	M	S	D	K	Y	L	E	N	P	A	N	A	Q	A	F	A	Q	L	K	K	E	A	D	M	K	V	P	R	R	H	V	E	L	Y	D	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	V	L	K	D	G	A	R	P	D	V	T	E	S	E	S	G	S	P	E	Y	R	Q	Q	S	A	V	P	L	D	E	E	T	H	A	G	E	D	V	A	V	F	A	R	G	P	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	H	L	V	H	G	V	Q	E	Q	T	F	I	A	H	V
Template Known Secondary structure					B	T	T	B										T	S	T	T										S	S						S								S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G			S				T	T
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
		532	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	M	G	C	L	G	Y	T
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		M	A	F	A	A	C	L	E
Template Known Secondary structure						T	T		G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		462	.	.	.	.	.	.	.