Job Description P37661 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:56:34 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 288 % Identity 13% Template d1p49a_ SCOP info Alkaline phosphatase-like Alkaline phosphatase-like Arylsulfatase Resolution 2.60

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		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.			280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.																																				.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.																																				.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	V	D	D	T	Y	V	V	F	I	I	G	E	T	T	R	W	D	H	M	G	I	F	G	Y	E	R	N	T	T	P	K	L	A	Q	E	.	.	K	N	L	A	A	F	R	G	Y	S	C	D	T	A	T	K	L	S	L	R	C	M	F	V	R	Q	G	G	A	E	D	N	P	Q	R	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																						.	.																																				.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																						.	.														.																						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.
Template Sequence		A	A	S	R	P	N	I	I	L	V	M	A	D	D	L	G	I	G	D	P	G	C	Y	G	N	K	T	I	R	T	P	N	I	D	R	L	A	S	G	G	V	K	L	T	Q	H	L	A	A	S	P	.	L	T	P	S	R	A	A	F	M	T	G	R	Y	P	V	R	S	G	M	A	S	W	S	R	T	G	V	F
Template Known Secondary structure														S	S			T	T	S	S	G	G	G	T		S	S	S							T	T	T	T	T	S				S	S				S			.											S	S		G	G	G	G	T		S		S	S	S			S
Template Predicted Secondary structure																																																					.
Template SS confidence
		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.		.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
											315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.											.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	K	E	Q	N	I	F	A	V	L	K	Q	L	G	F	S	S	D	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	M	Q	S	E	M	W	F	Y	S	N	T	M	A	D	N	I	A	Y	R	E	Q	I	G	A	E	P	R	N	R	G	K	P	V	D	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	F	T	A	S	S	G	G	L	P	T	D	E	I	T	F	A	K	L	L	K	D	Q	G	Y	S	T	A	L	I	G	K	W	H	L	G	M	S	C	H	S	K	T	D	F	C	H	H	P	L	H	H	G	F	N	Y	F	Y	G	I	S	L	T	N	L	R	D	C	K	P	G	E	G	S	V	F	T	T	G	F
Template Known Secondary structure				T	T					S		T	T											T	T											S				S	S	S	T	T	T		T	T	S	G	G	G	T	T		S						S	S				G	G	G	S	T	T			T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
																																																																																371	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	R	L	V	F	L	P	L	Q	I	V	G	V	T	L	L	T	L	A	A	L	N	C	L	G	L	L	H	V	P	L	G	V	F	F	S	L	L	F	L	A	A	L	I	L	T	L	F	L	G	F	L	H	Y	F	R	P	L	N	C	F	M	M	R	N	Y	E	I	I	Q	Q	P	M	S	Y	D	N	L	T	Q
Template Known Secondary structure					T																				T	T	S																																							T	T						S				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	V	D	E	M	Q	Q	S	L	G	R	N	P	D	G	K	H	L	I	I	L	H	T	K	G	S	H	F	N	Y	T	Q	R	Y	P	R	S	F	A	Q	W	K	P	E	C	I	G	V	D	S	G	C	T	K	A	Q	M	I	N	S	Y	D	N	S	V	T	Y	V	D	H	F	I	S	S	V	I	D	Q	V
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	L	T	V	E	A	A	Q	F	I	Q	R	N	T	E	T	P	F	L	L	V	L	S	Y	L	H	V	H	T	A	L	F	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	D	F	A	G	K	S	Q	H	G	V	Y	G	D	A	V	E	E	M	D	W	S	V	G	Q	I	L	N	L	L
Template Known Secondary structure													T	T	T	T	S										T	T	S	S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T	S	S			S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
		453	.					.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.											.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	D	.	.	.	.	K	K	A	I	V	F	Y	A	A	D	H	G	E	S	I	N	E	R	E	H	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	T	P	R	E	L	A	P	P	E	Q	F	R	V	P	M	M	V	W	M	S	D	K	Y	L	E	N	P	A	N	A	Q	A	F	A	Q	L	K	K	E	A	D
Query Conservation				.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	E	L	R	L	A	N	D	T	L	I	Y	F	T	S	D	Q	G	A	H	V	E	E	V	S	S	K	G	E	I	H	G	G	S	N	G	I	Y	K	G	G	K	A	N	N	W	E	G	G	I	R	V	P	G	I	L	R	W	P	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	I	Q	A	G	Q	K
Template Known Secondary structure				T	T		G	G	G								S	S				T	T		B		S	S	S		B		S				T	T					T	T	S	S	S													T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.														.	.	.	390	.	.	.
		519	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	K	V	P	R	R	H	V	E	L	Y	D	T	I	M	G	C	L	G	Y	T	S	P	D	G	G	I	N	E	N	N	N	W	C	H	I	P	Q	A	K	E	A	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	D	E	P	T	S	N	M	D	I	F	P	T	V	A	K	L	A	G	A	P	L	P	E	D	R	I	I	D	G	R	D	L	M	P	L	L	E	G	K	S	Q	R
Template Known Secondary structure				S				G	G	G										T					S	S	S												T	T	S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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