Job Description P37661 Confidence 99.78% Date Thu Jan 5 11:56:34 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 254 % Identity 12% Template c3szzA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:phosphonoacetate hydrolase; PDBTitle: crystal structure of phosphonoacetate hydrolase from sinorhizobium2 meliloti 1021 in complex with acetate Resolution 2.00 Å

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		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.			280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.																																						.	.
Query SS confidence																																									.	.																																						.	.
Query Sequence		A	P	Q	N	V	D	D	T	Y	V	V	F	I	I	G	E	T	T	R	W	D	H	M	G	I	F	G	Y	E	R	N	T	T	P	K	L	A	Q	E	.	.	K	N	L	A	A	F	R	G	Y	S	C	D	T	A	T	K	L	S	L	R	C	M	F	V	R	Q	G	G	A	E	D	N	P	Q	R	T	L	.	.
Query Conservation																																									.	.																																						.	.
Alig confidence																													.												.	.																																						.	.
Template Conservation																													.
Template Sequence		R	R	Y	P	W	P	R	V	P	A	I	A	V	C	L	D	G	C	E	P	A	Y	L	D	A	A	I	.	D	A	G	L	M	P	A	L	K	R	I	K	E	R	G	A	V	R	L	A	H	S	V	I	P	S	F	T	N	P	N	N	L	S	I	A	T	G	S	P	P	A	V	H	G	I	C	G	N	Y	L	Y
Template Known Secondary structure								S	S								T	T											.		T	T												S									S	S													T	S									S	S
Template Predicted Secondary structure																													.
Template SS confidence
		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40		.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
																		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	Q	N	I	F	A	V	L	K	Q	L	G	F	S	S	D	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	M	Q	S	E	M	W	F	Y	S	N	T	M	A	D	N	I	A	Y	R	E	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	P	S	T	G	E	E	V	M	M	N	D	P	K	F	L	R	A	P	T	I	F	Q	A	F	Y	D	A	G	A	R	V	A	V	V	T	A	K	D	K	L	R	A	L	L	G	K	G	L	R	F	D	E	G	R	A	V	C	F	S	S	E	K	S	D	K	A	T	R	A	E	H	G	I	D	N	A	S	A	W
Template Known Secondary structure			T	T	T	T							S	G	G	G			S										T	T								S	S								T	T	T				S	S	S							S	T	T	G	G	G							S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	G	A	E	P	R	N	R	G	K	P	V	D	D	M	L	L	V	D	E	M	Q	Q	S	L	G	R	N	P	D	G	K	H	L	I	I	L	H	T	K	G	S	H	F	N	Y	T	Q	R	Y	P	R	S	F	A	Q	W	K	P	E	C	I	G	V	D	S	G	C	T	K	A	Q	M	I	N	S	Y	D	N	S
Query Conservation
Alig confidence																													.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	G	R	P	V	P	E	V	Y	S	A	A	L	S	E	F	V	F	A	A	G	V	K	L	L	R	E	.	.	F	R	P	D	I	M	Y	L	T	T	T	D	Y	V	Q	H	K	Y	A	P	G	V	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	S	F
Template Known Secondary structure			T						S	S	S	S																	.	.	T			S																T	T	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																													.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.			200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.																								.	.	.	.
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	T	Y	V	D	H	F	I	S	S	V	I	D	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	E	M	F	D	R	Y	L	A	E	L	D	G	L	G	A	A	I	V	V	T	A	D	H	G	M	K	P	K	H	K	A	D	G	S	P	D	V	I	Y	V	Q	D	L	L	D	E	W	L	G	K	D	A	A	R	V	I	L	P	I	T	D	P	Y	V	V	H	H	G	A	L	G	S	F	A	T	A	Y	L	P
Template Known Secondary structure															T	T								S							B		T	T	S	S	B															T	T	S	S					T	T	S		T	T			S	S	T	T		B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
																													452	.	.					.	.	.	.			.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.							.	.	.	.	490	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.					.	.																												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.					.	.																												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	R	D	.	.	.	.	K	K	A	I	.	.	V	F	Y	A	A	D	H	G	E	S	I	N	E	R	E	H	L	H	G	T	P	R	E	L	A	P	P	.	.	.	.	.	.	E	Q	F	R	V	P	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.					.	.																												.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.					.	.																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	G	C	D	R	S	E	I	M	A	R	L	K	A	I	Q	G	V	D	V	V	L	G	R	E	E	A	C	R	R	F	E	L	P	E	D	R	I	G	D	I	V	L	V	S	S	E	N	K	T	L	G	T	S	E	H	R	H	D	L	A	A	L	D	E	P	L	R	S	H	G	G	L	T	E	Q	E	V	P	F
Template Known Secondary structure		T	T	S											T	S	T	T															T			G	G	G	S		S							T	T							S	S	S							S	S							S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
		493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	V	W	M	S	D	K	Y	L	E	N	P	A	N	A	Q	A	F	A	Q	L	K	K	E	A	D	M	K	V	P	R	R	H	V	E	L	Y	D	T	I	M
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	V	N	R	V	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	P	N	A	P	R	L	R	N	F	D	A	F	F	Y	A	V	T	A	A
Template Known Secondary structure				S	S			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T				T	T	T	S	B	G	G	G
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		388	.	390	.	.	.	.														.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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